Evaluation of circulating tumor DNA by electropherogram analysis and methylome profiling in high-risk neuroblastomas

Data de publicació: Data Ahead of Print:

Autors de IIS La Fe

Autors aliens a IIS La Fe

  • Trinidad, Eva Maria
  • Pisano, Giulia
  • Gut, Marta
  • Heath, Simon

Grups d'Investigació

Abstract

BackgroundLiquid biopsy has emerged as a promising, non-invasive diagnostic approach in oncology because the analysis of circulating tumor DNA (ctDNA) reflects the precise status of the disease at diagnosis, progression, and response to treatment. DNA methylation profiling is also a potential solution for sensitive and specific detection of many cancers. The combination of both approaches, DNA methylation analysis from ctDNA, provides an extremely useful and minimally invasive tool with high relevance in patients with childhood cancer. Neuroblastoma is an extracranial solid tumor most common in children and responsible for up to 15% of cancer-related deaths. This high death rate has prompted the scientific community to search for new therapeutic targets. DNA methylation also offers a new source for identifying these molecules. However, the limited blood sample size which can be obtained from children with cancer and the fact that ctDNA content may occasionally be diluted by non-tumor cell-free DNA (cfDNA) complicate optimal quantities of material for high-throughput sequencing studies. MethodsIn this article, we present an improved method for ctDNA methylome studies of blood-derived plasma from high-risk neuroblastoma patients. We assessed the electropherogram profiles of ctDNA-containing samples suitable for methylome studies, using 10 ng of plasma-derived ctDNA from 126 samples of 86 high-risk neuroblastoma patients, and evaluated several bioinformatic approaches to analyze DNA methylation sequencing data. ResultsWe demonstrated that enzymatic methyl-sequencing (EM-seq) outperformed bisulfite conversion-based method, based on the lower proportion of PCR duplicates and the higher percentage of unique mapping reads, mean coverage, and genome coverage. The analysis of the electropherogram profiles revealed the presence of nucleosomal multimers, and occasionally high molecular weight DNA. We established that 10% content of the mono-nucleosomal peak is sufficient ctDNA for successful detection of copy number variations and methylation profiles. Quantification of mono-nucleosomal peak also showed that samples at diagnosis contained a higher amount of ctDNA than relapse samples. ConclusionsOur results refine the use of electropherogram profiles to optimize sample selection for subsequent high-throughput analysis and support the use of liquid biopsy followed by enzymatic conversion of unmethylated cysteines to assess the methylomes of neuroblastoma patients.

Copyright © 2023 Trinidad, Juan-Ribelles, Pisano, Castel, Cañete, Gut, Heath and Font de Mora.

Dades de la publicació

ISSN/ISSNe:
2234-943X, 2234-943X

Frontiers in Oncology  Frontiers Media S.A.

Tipus:
Article
Pàgines:
1037342-1037342
PubMed:
37251933
Factor d'Impacte:
1,291 SCImago
Quartil:
Q1 SCImago

Documents

  • No hi ha documents

Mètriques

Filiacions

Filiacions no disponibles

Keywords

  • DNA mehtylation; ctDNA / normal cfDNA ratio; enzymatic methyl-sequencing (EM-seq); high-risk neuroblastoma; liquid biopsy

Projectes associats

NEUROBLASTO VAL: INVESTIGACION BASICA Y TRASLACIONAL DE LA TERAPIA DEL NEUROBLASTOMA DE ALTO RIESGO.

Investigador Principal: VICTORIA CASTEL SÁNCHEZ

41/09 . GENT PER GENT . 2010

RED DE BIOBANCOS (BIOBANCOS)

RD09/0076/00021 . INSTITUTO DE SALUD CARLOS III; FUNDACIÓN PARA LA INVESTIGACIÓN DEL HOSPITAL UNIVERSITARIO LA FE DE LA COMUNIDAD VALENCIANA . 2010

APLICACION DE LA CLASIFICACION INTERNACIONAL EN GRUPOS DE RIESGO EN ENFERMOS CON NEUROBLASTOMA: CARACTERIZACION DE LOS NUEVOS GRUPOS E INVESTIGACION CLINICA Y TRASLACIONAL DE LA TERAPIA DEL NEUROBLASTOMA

Investigador Principal: VICTORIA CASTEL SÁNCHEZ

FUNDACION CONTRA EL CANCER . FUNDACIÓN CIENTÍFICA AECC . 2010

ENCCA—EUROPEAN NETWORK for CANCER research in CHILDREN and ADOLESCENTS

Investigador Principal: ADELA CAÑETE NIETO

261474_ENCCA_PE_CAÑETE . FUNDACIÓN PARA LA INVESTIGACIÓN DEL HOSPITAL UNIVERSITARIO LA FE DE LA COMUNIDAD VALENCIANA . 2011

RECOMBINACION CHIMERC MONOCLONAL ANTIBODY CH 14-18

EC10-303 . FUNDACIÓN PARA LA INVESTIGACIÓN DEL HOSPITAL UNIVERSITARIO LA FE DE LA COMUNIDAD VALENCIANA . 2011

ESTUDIO DE REDES DE SEÑALES EN OSTEOSARCOMAS.

SAF2012-37330 . MINISTERIO DE ECONOMIA Y COMPETITIVIDAD; FUNDACIÓN PARA LA INVESTIGACIÓN DEL HOSPITAL UNIVERSITARIO LA FE DE LA COMUNIDAD VALENCIANA . 2013

CARACTERIZACION DE NUEVOS DETERMINANTES MOLECULARES EN TUMORES DEPENDIENTES DE AIB1

SAF2009-08334 . MINISTERIO DE ECONOMIA Y COMPETITIVIDAD . 2010

BUSQUEDA DE TRATAMIENTO PERSONALIZADO PARA EL NEUROBLASTOMA DE ALTO RIESGO.

Investigador Principal: PASCUAL BOLUFER GILABERT

PROMETEO/2013/060_FASE_I . FUNDACIÓN PARA LA INVESTIGACIÓN DEL HOSPITAL UNIVERSITARIO LA FE DE LA COMUNIDAD VALENCIANA; CONSELLERIA DE EDUCACION . 2013

COMPREHENSIVE, INTEGRATIVE AND GENOMIC APPROACH TO THE UNDERSTANDING AND TREATMENT OF CANCER AND LEUKEMIA.

Investigador Principal: MIGUEL ÁNGEL SANZ ALONSO

PIE13/00046 . INSTITUTO DE SALUD CARLOS III; FUNDACIÓN PARA LA INVESTIGACIÓN DEL HOSPITAL UNIVERSITARIO LA FE DE LA COMUNIDAD VALENCIANA . 2014

EXPO-R-NET - EUROPEAN EXPERT PAEDIATRIC ONCOLOGY REFERENCE NETWORK FOR DIAGNOSTICS AND TREATMENT.

Investigador Principal: ADELA CAÑETE NIETO

20131207_PE_DGSANCO_CAÑETE . 2013

EVALUACION PROSPECTIVA DE LA APLICACIÓN DE UN SCORE O PUNTUACIÓN PARA LA EVALUACIÓN SEMICUANTITATIVA DE LA 123I-MIBG COMO MÉTODO DE VALORACIÓN DE LA RESPUESTA AL TRATAMIENTO Y ESTRATIFICACIÓN DE PACIENTES CON NEUROBLASTOMA DE ALTO RIESGO: MODELO EN RED DE COLABORACION MULTIDISCIPLINAR.

Investigador Principal: JULIA BALAGUER GUILL

GV/2015/142 . 2015

FUNCIÓN DE ATM EN NEUROBLASTOMAS DE ALTO RIESGO CON DELECIÓN EN 11Q: UNA INNOVADORA APROXIMACIÓN

Investigador Principal: JAIME FONT DE MORA SAINZ

2016_0002_CRC_AECC_FONT_DE_MORA . FUNDACIÓN CIENTÍFICA AECC . 2016

IMPLANTACIÓN DE LA MEDICINA PERSONALIZADA EN ONCOLOGÍA PEDIÁTRICA: FARMACOGENÉTICA, EPIGENÉTICA, METABOLÓMICA Y LOS SISTEMAS DE INFORMACIÓN.

Investigador Principal: MARÍA JOSÉ HERRERO CERVERA

MJH-CIS-2016-01 . FUNDACION MUTUA MADRILEÑA . 2016

NEUROBLASTOHEAL. ESTUDIOS GENÉTICOS Y MOLECULARES EN NEUROBLASTOMAS DE ALTO RIESGO.

Investigador Principal: JAIME FONT DE MORA SAINZ

SAF2017-88422-R . MINISTERIO DE ECONOMIA Y COMPETITIVIDAD . 2018

LIQUIDHOPE. ADVANCING LIQUID BIOPSIES FOR MONITORING AND PERSONALIZED TREATMENT OF CHILDREN WITH NEUROBLASTOMA.

Investigador Principal: JAIME FONT DE MORA SAINZ

TRNSC118001FON . COMISION EUROPEA . 2019

Identificación temprana de nuevas alteraciones genéticas pronósticas y accionables en biopsia líquida de pacientes pediátricos con tumores sólidos.

Investigador Principal: SANDRA DOLZ GIMÉNEZ

PI18/00521 . INSTITUTO DE SALUD CARLOS III . 2019

ESTUDIO DE FASE 1/2 MULTICÉNTRICO, ABIERTO, DE BÚSQUEDA DE DOSIS PARA EVALUAR LA SEGURIDAD, TOLERABILIDAD Y EFICACIA PRELIMINAR DE NAB®-PACLITAXEL SEMANAL, EN PACIENTES PEDIÁTRICOS CON TUMORES SÓLIDOS EN RECAÍDA O REFRACTARIOS.

Investigador Principal: VICTORIA CASTEL SÁNCHEZ

ABI-007-PST-001 . 2013

ESTUDIO FASE I, ABIERTO, DE ESCALADO DE DOSIS DE LDK378 EN PACIENTES PEDIÁTRICOS CON ENFERMEDADES MALIGNAS QUE PRESENTAN UNA ALTERACIÓN GENÉTICA EN LA QUINASA DEL LINFOMA ANAPLÁSICO (ALK).

Investigador Principal: VICTORIA CASTEL SÁNCHEZ

CLDK378X2103 . 2014

ENSAYO ADAPTATIVO DE FASE 3 ALEATORIZADO, ABIERTO Y CONTROLADO PARA INVESTIGAR LA EFICACIA, SEGURIDAD Y TOLERABILIDAD DEL ANTICUERPO BITE® BLINATUMOMAB COMO TRATAMIENTO DE CONSOLIDACIÓN FRENTE A LA QUIMIOTERAPIA DE CONSOLIDACIÓN CONVENCIONAL EN SUJETOS PEDIÁTRICOS CON LEUCEMIA LINFOBLÁSTICA AGUDA (LLA) DE PRECURSORES B EN PRIMERA RECAÍDA DE ALTO RIESGO.

Investigador Principal: JOSÉ MARÍA FERNÁNDEZ NAVARRO

20120215 . 2015

ESTUDIO EN FASE I/II, MULTICÉNTRICO, ABIERTO, DE INCREMENTO DE LA DOSIS, DE LA SEGURIDAD Y FARMACOCINÉTICA DEL COBIMETINIB EN PACIENTES PEDIÁTRICOS Y ADULTOS JÓVENES CON TUMORES SÓLIDOS PREVIAMENTE TRATADOS.

Investigador Principal: ADELA CAÑETE NIETO

GO29665 . 2016

ESTUDIO FASE 1, MULTICÉNTRICO, ABIERTO DE DE-ESCALADO DE DOSIS PARA EVALUAR LA SEGURIDAD Y EFICACIA DE TALIMOGENE LAHERPAREPVEC EN PACIENTES PEDIÁTRICOS CON TUMORES AVANZADOS QUE NO SEAN DEL SISTEMA NERVIOSO CENTRAL Y QUE SEAN TRATABLES CON INYECCIÓ N D IRECTA.

Investigador Principal: ADELA CAÑETE NIETO

20110261 . 2017

ENSAYO CLÍNICO FASE IB/II DE NIVOLUMAB EN MONOTERAPIA Y NIVOLUMAB EN COMBINACIÓN CON IPILIMUMAB EN PACIENTES PEDIÁTRICOS CON NEOPLASIAS MALIGNAS PRIMARIAS DEL SNC DE ALTO GRADO.

Investigador Principal: ADELA CAÑETE NIETO

CA209-908 . 2017

ENSAYO DE FASE II ABIERTO, BASADO EN RIESGO, ADAPTADO A LA RESPUESTA, DE NIVOLUMAB+ BRENTUXIMAB VEDOTINA (N + BV) EN NIÑOS, ADOLESCENTES Y ADULTOS JÓVENES CON LINFOMA DE HODGKIN CLÁSICO (LHC) CD30+ EN RECIDIVA/REFRACTARIO (R/R) DESPUÉS DEL FRACASO DEL TRATAMIENTO DE PRIMERA LÍNEA, SEGUIDO DE BRENTUXIMAB + BENDAMUSTINA(BV + B) EN PARTICIPANTES CON UNA RESPUESTA SUBÓPTIMA.

Investigador Principal: ADELA CAÑETE NIETO

CA209-744 . 2017

ESTUDIO CLÍNICO DE FASE 2 DE POMALIDOMIDA (CC-4047) EN MONOTERAPIA PARA NIÑOS Y ADULTOS JÓVENES CON TUMORES CEREBRALES PRIMARIOS RECURRENTES O PROGRESIVOS.

Investigador Principal: ADELA CAÑETE NIETO

CC-4047-BRN-001 . 2017

ENSAYO FASE I-II DE SUNITINIB Y NIVOLUMAB TRAS TRATAMIENTO ESTÁNDAR EN SARCOMAS DE PARTES BLANDAS Y ÓSEOS AVANZADOS.

Investigador Principal: ROBERTO PEDRO DÍAZ BEVERIDGE

GEIS-52 . 2017

ESTUDIO EN FASE I/II DE LENVATINIB EN NIÑOS Y ADOLESCENTES CON TUMORES MALIGNOS SÓLIDOS RESISTENTES AL TRATAMIENTO O RECIDIVANTES Y ADULTOS JÓVENES CON OSTEOSARCOMA.

Investigador Principal: ADELA CAÑETE NIETO

E7080-G000-207 . 2017

PROTOCOLO INTERNACIONAL COLABORATIVO DE TRATAMIENTO PARA NIÑOS Y ADOLESCENTES CON HISTIOCITOSIS DE CÉLULAS DE LANGERHANS.

Investigador Principal: MARÍA DEL MAR ANDRÉS MORENO

042011 . 2017

Papel de la biodosimetría en la optimización del uso de 131I-MIBG como intensificación del tratamiento del neuroblastoma de alto riesgo.

Investigador Principal: JULIA BALAGUER GUILL

JBG-IOD-2017-01 . 2024

ENSAYO FASE I DE ESCALADO DE DOSIS, MULTICÉNTRICO, ABIERTO, NO ALEATORIZADO, DE REGORAFENIB (BAY 73-4506) EN PACIENTES PEDIÁTRICOS CON TUMORES SÓLIDOS MALIGNOS RECURRENTES O REFRACTARIOS AL TRATAMIENTO ESTÁNDAR.

Investigador Principal: ADELA CAÑETE NIETO

BAY73-4506/15906 . 2018

ESTUDIO DE FASE II ABIERTO GLOBAL PARA EVALUAR EL EFECTO DE DABRAFENIB EN COMBINACIÓN CON TRAMETINIB EN PACIENTES NIÑOS Y ADOLESCENTES CON GLIOMA DE ALTO GRADO (HGG) RECIDIVANTE O REFRACTARIO CON MUTACIÓN BRAF V600 POSITIVA.

Investigador Principal: ADELA CAÑETE NIETO

CDRB436G2201 . 2018

ENSAYO INTERNACIONAL PEDIÁTRICO EN TUMOR HEPÁTICO.

Investigador Principal: ANTONIO JUAN RIBELLES

RG_15-114 . 2018

ENSAYO CLÍNICO EUROPEO BASADO EN LA ESTRATIFICACIÓN TERAPÉUTICA SEGÚN LAS ALTERACIONES MOLECULARES PRESENTES EN LOS PACIENTES CON TUMORES REFRACTARIOS O EN RECAÍDA.

Investigador Principal: ADELA CAÑETE NIETO

CSET-2016/2369-ITCC-057 . 2020

PROTOCOLO UMBRELLA SIOP-RTSG 2016 – INVESTIGACIÓN INTEGRADA Y GUÍAS PARA DIAGNÓSTICO Y TERAPIA ESTANDARIZADOS DE TUMORES DE RIÑÓN EN NIÑOS, ADOLESCENTES Y ADULTOS JÓVENES.

Investigador Principal: JULIA BALAGUER GUILL

DRKS00011208 . 2019

ESTUDIO DE FASE I/II, ABIERTO, DE AUMENTO ESCALONADO DE DOSIS PARA DETERMINAR LA MTD, SEGURIDAD, FARMACOCINÉTICA Y EFICACIA DE AFATINIB EN MONOTERAPIA EN NIÑOS DE .1 ANO A < 18 AÑOS DE EDAD CON TUMORES NEUROECTODÉRMICOS, RABDOMIOSARCOMA Y/U OTROS TUMORES SÓLIDOS CON DESREGULACIÓN CONOCIDA DE LA VÍA DE ERBB INDEPENDIENTEMENTE DE LA HISTOLOGÍA TUMORAL, RECIDIVANTES O REFRACTARIOS.

Investigador Principal: ADELA CAÑETE NIETO

1200.120 . 2018

MULTICENTRE RETROSPECTIVE STUDY OF TEMOZOLOMIDE USE IN PAEDIATRIC REFRACTORY / RELAPSED NEUROBLASTOMA.

Investigador Principal: ADELA CAÑETE NIETO

ACN-TEM-2018-01 . 2020

MEDICINA BIOLÓGICA PARA LA ERRADICACIÓN DIFUSA DEL GLIOMA PONTINO INTRÍNSECO DIPG).

Investigador Principal: ADELA CAÑETE NIETO

2014/2126 . 2018

ENSAYO CLÍNICO FASE 1/2 DE UN BRAZO PARA EVALUAR LA SEGURIDAD Y LA EFICACIA DEL MESILATO DE ERIBULINA EN COMBINACIÓN CON IRINOTECÁN EN NIÑOS CON TUMORES SÓLIDOS REFRACTARIOS O RECURRENTES.

Investigador Principal: ANTONIO JUAN RIBELLES

E7389-G000-213 . 2018

ENSAYO DE FASE PIVOTAL 2 DEL ANTICUERPO NAXITAMAB (HU3F8) Y FACTOR ESTIMULANTE DE COLONIAS DE GRANULOCITOS Y MACRÓFAGOS (GM-CSF) EN PACIENTES CON NEUROBLASTOMA DE ALTO RIESGO CON ENFERMEDAD REFRACTARIA PRIMARIA O CON RESPUESTA INCOMPLETA AL TRATAMIENTO DE RESCATE EN EL HUESO Y/O LA MÉDULA ÓSEA.

Investigador Principal: ADELA CAÑETE NIETO

201 . 2019

FASE 1B DE CRIZOTINIB EN COMBINACIÓN O COMO AGENTE ÚNICO EN PACIENTES PEDIÁTRICOS CON TUMORES MALIGNOS POSITIVOS PARA ALK, ROS1 O ME.

Investigador Principal: ADELA CAÑETE NIETO

ITCC 053 . 2020

ESTUDIO MULTICÉNTRICO RANDOMIZADO FASE II PARA EVALUACIÓN Y COMPARACIÓN DE 2 ESTRATEGIAS TERAPÉUTICAS INTENSIVAS EN PACIENTES CON NEUROBLASTOMA METASTÁSICO CON POCA RESPUESTA A LA QUIMIOTERAPIA DE INDUCCIÓN ESTÁNDAR. UN ESTUDIO SIOPEN.

Investigador Principal: JULIA BALAGUER GUILL

2015/2294 . 2019

LBL 2018 - PROTOCOLO DE TRATAMIENTO COOPERATIVO INTERNACIONAL PARA NIÑOS Y ADOLESCENTES CON LINFOMA LINFOBLÁSTICO.

Investigador Principal: MARÍA DEL MAR ANDRÉS MORENO

UKM17_0023 . 2019

PanCareSurPass. PanCare studies of the scale-up and implementation of the digital Survivorship Passport to improve person-centred care for childhood cancer survivors.

Investigador Principal: ADELA CAÑETE NIETO

PanCareSurPass . COMISION EUROPEA . 2021

ESTUDIO EN FASE II MULTICENTRICO, COMPARATIVO, ABIERTO Y ALEATORIZADO DEL TRATAMIENTO CON BEVACIZUMAB EN PACIENTES PEDIATRICOS CON GLIOMA SUPRATENTORIAL DE ALTO GRADO RECIEN DIAGNOSTICADO.

Investigador Principal: ADELA CAÑETE NIETO

BO25041

ESTUDIO FASE II DE TRATAMIENTO CON DASATINIB EN NIÑOS Y ADOLESCENTES CON LEUCEMIA MIELOIDE CRONICA EN FASE CRONICA, RECIEN DIAGNOSTICADA O CON LEUCEMIAS PH+ CON RESISTENCIA O INTOLERANCIA A IMATINIB.

Investigador Principal: VICTORIA CASTEL SÁNCHEZ

CA180-226 . 2009

ESTUDIO DE FASE 1/2, ABIERTO Y DE UN SOLO BRAZO, QUE EVALÚA LA SEGURIDAD Y EFICACIA DEL PONATINIB PARA EL TRATAMIENTO DE LEUCEMIAS O TUMORES SÓLIDOS RECURRENTES O REFRACTARIOS EN PACIENTES PEDIÁTRICOS.

Investigador Principal: ANTONIO JUAN RIBELLES

INCB84344-102 . 2021

A POST-AUTHORISATION SAFETY STUDY PATIENT REGISTRY OF PATIENTS WITH HIGH-RISK NEUROBLASTOMA BEING TREATED WITH THE MONOCLONAL ANTIBODY DINUTUXIMAB BETA.

Investigador Principal: ADELA CAÑETE NIETO

EUS-DIN-2019-01 . 2019

Organoides tumorales derivados de pacientes para la detección de interacciones sintéticas letales en cánceres pediátricos.

Investigador Principal: JAIME FONT DE MORA SAINZ

2019-296-1_CRC_AECC_CORONADO . FUNDACIÓN CIENTÍFICA AECC . 2019

MARCADORES CIRCULANTES Y TISULARES EN PACIENTES CON CARCINOMA RENAL AVANZADO O METASTÁSICO EN PRIMERA LÍNEA DE TRATAMIENTO.

Investigador Principal: GASPAR REYNES MUNTANER

SOG-ITQ-2013-01 . ASOC SPANISH ONCOLOGY GENITOURINARY GROUP . 2019

ESTUDIO EN FASE 2, MULTICÉNTRICO, ABIERTO Y ALEATORIZADO PARA COMPARAR LA EFICACIA Y LA SEGURIDAD DE LENVATINIB EN COMBINACIÓN CON IFOSFAMIDA Y ETOPÓSIDO FRENTE A IFOSFAMIDA Y ETOPÓSIDO EN NIÑOS, ADOLESCENTES Y ADULTOS JÓVENES CON OSTEOSARCOMA RECIDIVANTE O RESISTENTE (OLIE).

Investigador Principal: ANTONIO JUAN RIBELLES

E7080-G000-230 . 2020

ESTUDIO ALEATORIZADO DE FASE IIB CON BEVACIZUMAB ASOCIADO A TEMOZOLOMIDA ± IRINOTECÁN EN NIÑOS Y JÓVENES CON NEUROBLASTOMA RESISTENTE O RECIDIVANTE. ENSAYO BEACON-NEUROBLASTOMA.

Investigador Principal: ADELA CAÑETE NIETO

RG_11-087 . 2014

ESTUDIO ABIERTO, MULTICENTRICO, EN FASE III PARA VALORAR LA CAPTACION DE I123-MLIBG CON GAMMAGRAFIA, EN SUJETOS EVALUADOS POR FEOCROMOCITOMA O NEUROBLASTOMA.

Investigador Principal: VICTORIA CASTEL SÁNCHEZ

MBG308

Plataforma ISCIII de soporte para la investigación clínica independiente.

Investigador Principal: PILAR NOS MATEU

PT20/00092 . INSTITUTO DE SALUD CARLOS III . 2021

Plataforma ISCIII de Biobancos y Biomodelos

Investigador Principal: JOSÉ VICENTE CERVERA ZAMORA

PT20/00179 . INSTITUTO DE SALUD CARLOS III . 2021

Función de la haploinsuficiencia de genes reparadores del DNA en la predisposición a neuroblastoma y en la regulación del nicho inmunosupresor.

Investigador Principal: JAIME FONT DE MORA SAINZ

PID2020-119323RB-I00 . MINISTERIO DE CIENCIA E INNOVACION . 2021

Desarrollo y evaluación de un nuevo tratamiento dirigido y personalizado para neuroblastomas con MYCN amplificado

Investigador Principal: ADELA CAÑETE NIETO

ACIF/2021/264 . CONSELLERIA DE INNOVACIÓN, UNIVERSIDADES, CIENCIA Y SOCIEDAD DIGITAL . 2021

SIOP EPENDIMOMA - PROGRAMA CLÍNICO INTERNACIONAL PARA EL DIAGNÓSTICO Y TRATAMIENTO DE NIÑOS, ADOLESCENTES Y ADULTOS JÓVENES CON EPENDIMOMA.

Investigador Principal: ADELA CAÑETE NIETO

ET13-002 . 2019

ESTUDIO DE FASE I, ABIERTO, DE GRUPOS PARALELOS PARA INVESTIGAR LA SEGURIDAD, LA TOLERABILIDAD, LA EFICACIA Y LA FARMACOCINÉTICA DE OLAPARIB EN PACIENTES PEDIÁTRICOS CON TUMORES SÓLIDOS.

Investigador Principal: ANTONIO JUAN RIBELLES

D0816C00025 . 2019

ESTUDIO DE FASE 1, MULTICÉNTRICO, ABIERTO, CON INTENSIFICACIÓN DE DOSIS Y EXPANSIÓN DE COHORTE CON NIRAPARIB Y DOSTARLIMAB EN PACIENTES PEDIÁTRICOS CON TUMORES SÓLIDOS RECURRENTES O REFRACTARIOS.

Investigador Principal: ANTONIO JUAN RIBELLES

213406 . 2020

ESTUDIO DE FASE 1B DE AUMENTO DE LA DOSIS DE ABEMACICLIB EN COMBINACIÓN CON TEMOZOLOMIDA E IRINOTECÁN (PARTE A) Y DE ABEMACICLIB EN COMBINACIÓN CON TEMOZOLOMIDA (PARTE B) EN NIÑOS Y ADULTOS JÓVENES CON TUMORES SÓLIDOS RECIDIVANTES/RESISTENTES AL TRATAMIENTO.

Investigador Principal: ANTONIO JUAN RIBELLES

I3Y-MC-JPCS . 2020

SURVIVORSHIP PASSPORT.

Investigador Principal: JULIA BALAGUER GUILL

SURPASS . 2020

OGMIOS. Sistema Inteligente de apoyo a la toma de decisiones clínicas en medicina de precisión.

Investigador Principal: ADELA CAÑETE NIETO

INNEST/2021/55 . AGENCIA VALENCIANA DE LA INNOVACION (AVI) . 2021

Mejora de la supervivencia con nuevas estrategias terapéuticas para niños con neuroblastoma de alto riesgo en España: un ensayo aleatorizado de fase III en pacientes recién diagnosticados (HR-NBL2 / SIOPEN).

Investigador Principal: ADELA CAÑETE NIETO

ICI21/00098 . INSTITUTO DE SALUD CARLOS III . 2022

ESTUDIO FASE II, ABIERTO, PROPECTIVO, MULTICENTRICO Y SIN GRUPO CONTROL DE DOXIRUBICINA LIPOSOMAL (CEELYX) EN SARCOMAS INFANTILES EN ESTADIOS AVANZADOS EN SEGUNDA LINEA DE TRATAMIENTO.

Investigador Principal: VICTORIA CASTEL SÁNCHEZ

SARAV-2L-98

ENSAYO CLINICO FASE III, DOBLE CIEGO, ALEATORIZADO PARA COMPARAR DOS PROGRAMACIONES DE ADMINITRACION DE LERIDISTIM (SC-70935) FRENTE A G-CSF EN LA PREVENCION DE NEUTROPENIA FEBRIL SECUNDARIA EN PACIENTES PEDIATRICOS CON CANCER.

Investigador Principal: VICTORIA CASTEL SÁNCHEZ

IN5-99-02-012

ESTUDIO FASE II-IV DE TEMOZOLOMIDA Y RADIOTERAPIA EN LOS TUMORES DE TRONCO EN LA INFANCIA.

Investigador Principal: ADELA CAÑETE NIETO

GT/PED-00

ESTUDIO ABIERTO ALEATORIZADO PARA EVALUAR EL EFECTO DE EPOETINUM ALFA EN LA DISMINUCION DE LAS TRASFUSIONES SANGUINEAS EN PACIENTES PEDIATRICOS CON CANCER RECIENTEMENTE DIAGNOSTICADO Y SOMETIDOS A QUIMIOTERAPIA MIELOSUPRESORA.

Investigador Principal: VICTORIA CASTEL SÁNCHEZ

PRI/EPO-INT-51

ESTUDIO ABIERTO DE EXTENSION PARA EVALUAR LA SEGURIDAD DE EPOETINUM ALFA EN PACIENTES PEDIATRICOS CON NEOPLASIA DE RECIENTE DISGNOSTICO QUE RECIBEN QUIMIOTERAPIA MIELOSUPRESORA. FASE III.

Investigador Principal: VICTORIA CASTEL SÁNCHEZ

EPO/INT-79

USO DEL SR 29142 PARA LA PREVENCION O TRATAMIENTO DE LA HIPERURICEMIA A NIVEL MULTICENTRICO EN EUROPA, ASIA Y AUSTRALIA

Investigador Principal: VICTORIA CASTEL SÁNCHEZ

LTS3256

ESTUDIO DE FASE II, ALEATORIZADO, NO COMPARATIVO DE IRINOTECAN Y CARBOPLATINO FRENTE A IRINOTECAN EN SUJETOS CON UNA EDAD COMPRENDIDA ENTRE 1-21 AÑOS CON TUMORES SOLIDOS REFRACTARIOS.

Investigador Principal: VICTORIA CASTEL SÁNCHEZ

CA124002

ESTUDIO MULTICENTRICO, DOBLE CIEGO, ALEATORIZADO Y COMPARATIVO PARA EVALUAR LA SEGURIDAD, LA TOLERABILIDAD Y LA EFICACIA DE CASPOFUNGINA FRENTE A ANFOTERICINA BLIPOSOMICA COMO TRATAMIENTO EMPIRICO EN PACIENTES PEDIATRICOS CON FIEBRE PERSISTENTE Y NEUTROPENIA.

Investigador Principal: VICTORIA CASTEL SÁNCHEZ

MK991-044

RECOMBINACION CHIMERC MONOCLONAL ANTIBODY CH 14-18.High Risk Neuroblastoma Study 1.8 of SIOP-Europe (SIOPEN).

Investigador Principal: VICTORIA CASTEL SÁNCHEZ

SIOPENRNET002 (HR-NBL-1) . 2010

ESTUDIO EN FASE 2, ABIERTO Y DE UN SOLO GRUPO DE IRINOTECAN EN COMBINACION CON TEMOZOLOMIDA EN NIÑOS CON MEDULOBLASTOMA RECURRENTE O REFRACTARIO Y EN NIÑOS CON GLIOMA DE ALTO GRADO RECIEN DIAGNOSTICADO.

Investigador Principal: VICTORIA CASTEL SÁNCHEZ

A5961166

ESTUDIO DE FASE I/II DE CP-751,871 EN PACIENTES CON TUMORES DE LA FAMILIA DE SARCOMAS DE EWING RECURRENTES Y/O REFRACTARIOS.

Investigador Principal: VICTORIA CASTEL SÁNCHEZ

A4021020 . 2008

ESTUDIO ALEATORIZADO, DOBLE CIEGO, CONTROLADO CON PLACEBO SOBRE LA EFICACIA Y SEGURIDAD DEL CLORHIDRATO DE DONEPEZILO EN NIÑOS PREADOLESCENTES Y ADOLESCENTES CON TRASTORNO DE ATENCION DESPUES DEL TRATAMIENTO PARA EL CANCER

Investigador Principal: ADELA CAÑETE NIETO

E2020-G000-333

PRIMER ESTUDIO INTERNACIONAL INTERGRUPO PARA EL TRATAMIENTO DEL LINFOMA DE HODGKIN CLASICO EN NIÑOS Y ADOLESCENTES.

Investigador Principal: JOSÉ MARÍA FERNÁNDEZ NAVARRO

EURONET-PHL-C1

ESTUDIO FASE II, NO ALEATORIZADO, DE TRATAMIENTO CON TEMOZOLAMIDA COMBINADA CON TOPOTECAN PARA NEUROBLASTOMA Y OTROS TUMORES SOLIDOS PEDIATRICOS EN SITUACION DE RECAIDA O PROGERESION.

Investigador Principal: VICTORIA CASTEL SÁNCHEZ

ITCC-013-TOTEM2

ESTUDIO EN FASE I/II DE BÚSQUEDA DE DOSIS DE CH14.18/CHO EN INFUSIÓN CONTINUA COMBINADO CON ALDESLEUKINA (IL-2) SUBCUTÁNEA EN PACIENTES CON NEUROBLASTOMA PRIMARIO REFRACTARIO O EN RECAÍDA.

Investigador Principal: VICTORIA CASTEL SÁNCHEZ

012010 . 2012

PROTOCOLO EUROPEO DE TRATAMIENTO PARA EL NEUROBLASTOMA DE RIESGO BAJO O INTERMEDIO.

Investigador Principal: ADELA CAÑETE NIETO

LINES . 2011

ESTUDIO FASE II, MULTICÉNTRICO, ABIERTO, DE UN SOLO BRAZO QUE EVALÚA LA SEGURIDAD Y EFICACIA DE LDE225 ORAL EN PACIENTES CON MEDULOBLASTOMA EN RECIDIVA QUE TENGAN ACTIVACIÓN DE LA VÍA HH.

Investigador Principal: VICTORIA CASTEL SÁNCHEZ

CLDE225C2301

ESTUDIO DE LA TOXICIDAD EN PLASMA INDUCIDA POR AGENTES QUIMIOTERÁPICOS.

Investigador Principal: JOSÉ ANASTASIO MONTERO ARGUDO

CARDIOTOX CLÍNICO

ESTUDIO PROSPECTIVO OBSERVACIONAL DE LA EXPRESIÓN DE ABCB1/P-GLICOPROTEÍNA COMO FACTOR PARA LA ESTRATIFICACIÓN BIOLÓGICA DEL OSTEOSARCOMA NO METASTÁTICO DE LAS EXTREMIDADES.

Investigador Principal: ROBERTO PEDRO DÍAZ BEVERIDGE

ISG-GEIS-OS-2 . 2014

ENSAYO INTERNACIONAL, ALEATORIZADO Y CONTROLADO PARA EL TRATAMIENTO DEL SARCOMA DE EWING DE DIAGNÓSTICO RECIENTE.

Investigador Principal: ANTONIO JUAN RIBELLES

RG_11-152 . 2015

ESTUDIO DE FASE I-II SOBRE LA SEGURIDAD Y LA EFICACIA DE DACOGEN EN ADMINISTRACIÓN SECUENCIAL CON CITARABINA EN NIÑOS CON LEUCEMIA MIELOIDE AGUDA RECIDIVANTE O RESISTENTE AL TRATAMIENTO.

Investigador Principal: JOSÉ MARÍA FERNÁNDEZ NAVARRO

DACOGENAML2004 . 2015

ENSAYO INTERNACIONAL, ALEATORIZADO Y CONTROLADO DE QUIMIOTERAPIA PARA EL TRATAMIENTO DEL SARCOMA DE EWING RECURRENTE O REFRACTARIO.

Investigador Principal: ROBERTO PEDRO DÍAZ BEVERIDGE

RG_13-277 . 2015

ESTUDIO FASE I-II DE VINBLASTINA EN COMBINACIÓN CON NILOTINIB EN NIÑOS, ADOLESCENTES, Y ADULTOS JÓVENES CON GLIOMA DE BAJO GRADO REFRACTARIO O RECURRENTE.

Investigador Principal: ADELA CAÑETE NIETO

IGR2012/1883 . 2015

ESTUDIO EN FASE TEMPRANA, MULTICÉNTRICO, ABIERTO, DE LA SEGURIDAD Y FARMACOCINÉTICA DEL ANTICUERPO ANTI-PD-L1 (MPDL3280A) EN PACIENTES PEDIÁTRICOS Y ADULTOS JÓVENES CON TUMORES SÓLIDOS PREVIAMENTE TRATADOS.

Investigador Principal: ADELA CAÑETE NIETO

GO29664

AN INTERNATIONAL PROSPECTIVE STUDY ON CLINICALLY STANDARD-RISK MEDULLOBLASTOMA IN CHILDREN OLDER THAN 3 TO 5 YEARS WITH LOW-RISK BIOLOGICAL PROFILE (PNET 5 MB - LR) OR AVERAGE-RISK BIOLOGICAL PROFILE (PNET 5 MB -SR)

Investigador Principal: ADELA CAÑETE NIETO

SIOPPNET5 . 2016

SEGUNDO ESTUDIO INTERNACIONAL INTERGRUPO PARA EL LINFOMA DE HODGKIN CLÁSICO EN NIÑOS Y ADOLESCENTES.

Investigador Principal: MARÍA DEL MAR ANDRÉS MORENO

EURONET-PHL-C2 . 2016

DESARROLLO DE UNA PLATAFORMA EUROPEA DE INVESTIGACIÓN EPIDEMIOLÓGICA EN NEUROBLASTOMA.

Investigador Principal: ADELA CAÑETE NIETO

ADE-NEU-2015-01

ESTUDIO DE REGISTRO PROSPECTIVO DE PACIENTES CON NEUROBLASTOMA Y AFECTACIÓN DEL CANAL MEDULAR (SCI).

Investigador Principal: ADELA CAÑETE NIETO

AIE-QUI-2015-01 . 2017

ESTUDIO FASE I/II MULTICÉNTRICO, ABIERTO PARA EVALUAR LA SEGURIDAD, FARMACOCINÉTICA Y EFICACIA DE ALECTINIB EN PACIENTES PEDIÁTRICOS CON TUMORES SÓLIDOS O DEL SNC CON FUSIÓN ALK POSITIVA, EN LOS QUE EL TRATAMIENTO PREVIO HA RESULTADO INEFICAZ O PARA LOS QUE NO SE DISPONE DE UN TRATAMIENTO ADECUADO.

Investigador Principal: ADELA CAÑETE NIETO

GO42286 . 2021

ESTUDIO FASE 1/2 DE BEMPEGALDESLEUKIN EN COMBINACIÓN CON NIVOLUMAB EN NIÑOS, ADOLESCENTES Y ADULTOS JÓVENES CON NEOPLASIAS MALIGNAS RECIDIVANTES O REFRACTARIAS (PIVOT IO 020).

Investigador Principal: ANTONIO JUAN RIBELLES

CA045-020 . 2021

Outcomes and response of patients with sarcoma enrolled on dose finding trials at ITCC centres.

Investigador Principal: ANTONIO JUAN RIBELLES

R&D-TEM_34 . 2021

FaR-RMS – Un estudio global para niños y adultos con Rabdomiosarcoma recién diagnosticado y recidivante.

Investigador Principal: ANTONIO JUAN RIBELLES

RG_17-247 . 2021

International registry for paediatric patients with a relapsed or refractory hepatoblastoma or hepatocellular carcinoma – RELIVE.

Investigador Principal: ANTONIO JUAN RIBELLES

RELIVE . 2023

AYUDAS MARGARITA SALAS PARA LA FORMACIÓN DE JÓVENES DOCTORES_Rebeca Burgos Panadero

Investigador Principal: JAIME FONT DE MORA SAINZ

2021-753-1_CRC_Margarita Salas_FONTDEMORA . MINISTERIO DE UNIVERSIDADES . 2022

Novel strategies for combined immunotherapy: identifying altered immune checkpoints in high-grade gliomas by in vivo imaging.

2022-017-1_MARGARITA SALAS_BURGOS . MINISTERIO DE UNIVERSIDADES . 2022

Estudio en fase I/II de la seguridad, tolerabilidad, farmacocinética y eficacia preliminar de relatlimab más nivolumab en participantes pediátricos y adultos jóvenes con linfoma de Hodgkin clásico y linfoma no Hodgkin recurrentes o resistentes.

Investigador Principal: MARÍA DEL MAR ANDRÉS MORENO

CA224-069 . 2022

SINUÉ. Planificación de intervenciones quirúrgicas de precisión guiados por hábitats identitarios de tumores gliales habilitando decisiones intraoperatorias de tratamiento inmunoterápico

Investigador Principal: JAIME FONT DE MORA SAINZ

INNEST/2022/86 . AGENCIA VALENCIANA DE LA INNOVACION (AVI) . 2022

Estudio de los niveles de NETs en plasma de niños y adolescentes con cáncer y su relevancia clínica.

Investigador Principal: ADELA CAÑETE NIETO

2022-487-1_CRC_AECC_BENAVENT . FUNDACIÓN CIENTÍFICA AECC; MARÍA GARCÍA CAMPOS; NURIA BENAVENT GARCÍA; MARINA LIERN GARCÍA . 2022

Estudio de los mecanismos moleculares de inmunosupresión en cáncer de mama triple negativo.

Investigador Principal: JAIME FONT DE MORA SAINZ

2022-492-1_CRC_AECC_ROSADO . FUNDACIÓN CIENTÍFICA AECC . 2022

Adenda al protocolo J1S-MC-JP04 Estudio de fase 2, aleatorizado, sin enmascaramiento, en el que se evalúa abemaciclib en combinación con irinotecán y temozolomida en participantes con sarcoma de Ewing recidivante o resistente al tratamiento.

Investigador Principal: ANTONIO JUAN RIBELLES

J1S-MC-JP04 . 2022

SEHOP-PENCIL study: Personalised mEdicine for Cancer in children in Spain.

Investigador Principal: ADELA CAÑETE NIETO

PMP21/00073 . INSTITUTO DE SALUD CARLOS III . 2022

ESTUDIO ABIERTO, MULTICÉNTRICO FASE 1/2 DE SURUFATINIB EN COMBINACIÓN CON GEMCITABINA EN PACIENTES PEDIÁTRICOS, ADOLESCENTES Y ADULTOS JÓVENES CON TUMORES SÓLIDOS RECURRENTES O REFRACTARIOS.

Investigador Principal: ANTONIO JUAN RIBELLES

2020-012-GLOB2 . 2022

ESTUDIO EN FASE I/II PARA EVALUAR PALBOCICLIB (IBRANCE®) EN COMBINACIÓN CON IRINOTECÁN Y TEMOZOLOMIDA O EN COMBINACIÓN CON TOPOTECÁN Y CICLOFOSFAMIDA EN PACIENTES PEDIÁTRICOS CON TUMORES SÓLIDOS RECURRENTES O RESISTENTES AL TRATAMIENTO

Investigador Principal: ANTONIO JUAN RIBELLES

A5481092 . 2022

LOGGIC Core BioClinical Data Bank.

Investigador Principal: ADELA CAÑETE NIETO

LOGGIC Core . 2023

Estudio TEMOkids: Un estudio farmacocinético para evaluar la aceptabilidad y la seguridad en la población de Kimozo, una suspensión oral pediátrica de temozolomida.

Investigador Principal: ADELA CAÑETE NIETO

ORP-TMZ-I-b . 2022

Revisión de la experiencia en el manejo del neuroblastoma de alto riesgo refractario, en recaída o progresión en España.

Investigador Principal: BLANCA MARTÍNEZ DE LAS HERAS

NBRRP1921 . 2023

Implementación del estudio de enfermedad residual medible mediante secuenciación masiva en pacientes pediátricos con leucemia linfoblástica aguda

Investigador Principal: MARTA LLOP GARCÍA

CIGE/2022/83 . CONSELLERIA DE INNOVACIÓN, UNIVERSIDADES, CIENCIA Y SOCIEDAD DIGITAL . 2023

Estudio en fase I/II, abierto, de seguridad, tolerabilidad, farmacocinética y actividad antitumoral de repotrectinib en pacientes pediátricos y adultos jóvenes con tumores avanzados o metastásicos con reordenaciones de ALK, ROS1 o NTRK1-3 (CARE).

Investigador Principal: ANTONIO JUAN RIBELLES

TPX-0005-07 . 2023

High-Risk Neuroblastoma Study 2 of SIOP-Europa-Neuroblastoma (SIOPEN) Randomized, international and multicentric phase 3 study that evaluates and compares 2 treatment strategies in 3 therapeutic phases (induction, high-dose chemotherapy and radiotherapy) for patients with high-risk neuroblastoma.

Investigador Principal: ADELA CAÑETE NIETO

2019/2894 . 2023

Estudio de las modificaciones epigenéticas en niños y niñas nacidas tras técnicas de reproducción asistida y su potencial relación con problemas de salud.

Investigador Principal: EDUARDO ESTALELLA NAVARRO

EPIFIV . 2023

Estudio de extensión multicéntrico y abierto para evaluar los efectos a largo plazo en pacientes pediátricos tratados con Tafinlar (dabrafenib) y/o Mekinist (trametinib).

Investigador Principal: ADELA CAÑETE NIETO

CDRB436G2401 . 2023

SACHA: Secured Access to innovative medicines for CHildren, adolescents and young adults with cAncer.

Investigador Principal: ANTONIO JUAN RIBELLES

SACHA . 2023

LOGGIC/FIREFLY-2: Ensayo en fase III, aleatorizado, internacional y multicéntrico de DAY101 en monoterapia frente a la quimioterapia estándar en pacientes con glioma pediátrico de bajo grado que presentan una alteración de RAF activadora que requiere tratamiento sistémico de primera línea.

Investigador Principal: ADELA CAÑETE NIETO

DAY101-002 . 2023

A Phase I/II study of Brigatinib in pediatric and young adult patients with ALK+ Anaplastic Large Cell Lymphoma,Inflammatory Myofibroblastic Tumors or other solid tumors.

Investigador Principal: ADELA CAÑETE NIETO

ITCC-098 . 2023

Compartir la publicació