Transcriptomic Alterations in Spliceosome Components in Advanced Heart Failure: Status of Cardiac-Specific Alternative Splicing Factors

Fecha de publicación: 01/09/2024

Autores de IIS La Fe

Participantes ajenos a IIS La Fe

Gonzalez-Torrent, Irene
Delgado-Arija, Marta
Benedicto, Carlota

Grupos

Grupo de Investigación Clínica y Traslacional en Cardiología

Investigador Principal

Esther Roselló Lletí

Abstract

Heart failure (HF) is associated with global changes in gene expression. Alternative mRNA splicing (AS) is a key regulatory mechanism underlying these changes. However, the whole status of molecules involved in the splicing process in human HF is unknown. Therefore, we analysed the spliceosome transcriptome in cardiac tissue (n = 36) from control subjects and HF patients (with ischaemic (ICM) and dilated (DCM) cardiomyopathies) using RNA-seq. We found greater deregulation of spliceosome machinery in ICM. Specifically, we showed widespread upregulation of the E and C complex components, highlighting an increase in SNRPD2 (FC = 1.35, p < 0.05) and DHX35 (FC = 1.34, p < 0.001) mRNA levels. In contrast, we observed generalised downregulation of the A complex and cardiac-specific AS factors, such as the multifunctional protein PCBP2 (FC = -1.29, p < 0.001) and the RNA binding proteins QKI (FC = -1.35, p < 0.01). In addition, we found a relationship between SNPRD2 (an E complex component) and the left ventricular mass index in ICM patients (r = 0.779; p < 0.01). On the other hand, we observed the specific underexpression of DDX46 (FC = -1.29), RBM17 (FC = -1.33), SDE2 (FC = -1.35) and RBFOX1 (FC = -1.33), p < 0.05, in DCM patients. Therefore, these aetiology-related alterations may indicate the differential involvement of the splicing process in the development of ICM and DCM.

Datos de la publicación

ISSN/ISSNe:: 1661-6596, 1661-6596
Tipo:: Article
Páginas:: -
DOI:: 10.3390/ijms25179590
Factor de Impacto:: 1,176 SCImago ℠
Cuartil:: Q1 SCImago ℠

Documentos

No hay documentos

Métricas

Filiaciones

Filiaciones no disponibles

Proyectos asociados

REDINSCOR

RD06/0003/1001 . INSTITUTO DE SALUD CARLOS III; FUNDACIÓN PARA LA INVESTIGACIÓN DEL HOSPITAL UNIVERSITARIO LA FE DE LA COMUNIDAD VALENCIANA . 2008

APOPTOSIS EN EL RECHAZO AGUDO DEL INJERTO CARDIACO ALOGENICO

Investigador Principal: LUIS ALMENAR BONET

AP-196/10 . 2010

CINETICA DEL TRANSPORTE NUCLEO-CITOPLASMATICO DE LOS CARDIOMIOCITOS HUMANOS EN LA INSUFICIENCIA CARDIACA. ANALISIS CELULAR Y DE EXPRESION GENICA

PI10/00275 . INSTITUTO DE SALUD CARLOS III; FUNDACIÓN PARA LA INVESTIGACIÓN DEL HOSPITAL UNIVERSITARIO LA FE DE LA COMUNIDAD VALENCIANA . 2010

REGISTRO MULTICÉNTRICO DE PACIENTES HOSPITALIZADOS POR INSUFICIENCIA CARDÍACA AGUDA (REDINSCOR II).

RD12/0042/0003 . INSTITUTO DE SALUD CARLOS III; FUNDACIÓN PARA LA INVESTIGACIÓN DEL HOSPITAL UNIVERSITARIO LA FE DE LA COMUNIDAD VALENCIANA . 2013

TRANSPORTE NÚCLEO CITOPLASMA Y CAMBIOS DE EXPRESIÓN GÉNICA EN LA INSUFICIENCIA CARDIACA. PUESTA EN MARCHA DE UNA NUEVA ESTRATEGIA TERAPÉUTICA.

Investigador Principal: JOSE MIGUEL RIVERA OTERO

PI13/00100 . INSTITUTO DE SALUD CARLOS III; FUNDACIÓN PARA LA INVESTIGACIÓN DEL HOSPITAL UNIVERSITARIO LA FE DE LA COMUNIDAD VALENCIANA . 2014

ESTANCIA DE CONTRATADOS PREDOCTORALES EN CENTROS FUERA DE LA COMUNIDAD VALENCIANA

BEFPI/2014 . 2014

SEGUIMIENTO DE PACIENTES SOMETIDOS A TRASPLANTE CARDIACO. ESTUDIO DE MARCADORES DE RECHAZO IMPLICADOS EN EL TRANSPORTE NÚCLEO-CITOPLASMA.

Investigador Principal: ESTHER ROSELLÓ LLETÍ

PI14/01506 . INSTITUTO DE SALUD CARLOS III . 2015

PAPEL PROTECTOR DE BH4 EN LA DISFUNCIÓN VENTRICULAR. UNA PROMETEDORA ESTRATEGIA TERAPÉUTICA EN LA

Investigador Principal: ESTHER ROSELLÓ LLETÍ

CAS14/00111 . MINISTERIO DE EDUCACION, CULTURA Y DEPORTE; FUNDACIÓN PARA LA INVESTIGACIÓN DEL HOSPITAL UNIVERSITARIO LA FE DE LA COMUNIDAD VALENCIANA . 2014