Use of sera cell free DNA (cfDNA) and exovesicle-DNA for the molecular diagnosis of chronic Chagas disease.

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Autores de IIS La Fe

Participantes ajenos a IIS La Fe

  • Lozano N
  • Samblas MG
  • Giménez Martí MJ
  • Sequera-Arquelladas S
  • Moreno JMM

Grupos

Abstract

Chagas disease, a neglected tropical disease, is now considered a worldwide health concern as a result of migratory movements from Central and South America to other regions that were considered free of the disease, and where the epidemiological risk is limited to transplacental transmission or blood or organ donations from infected persons. Parasite detection in chronically ill patients is restricted to serological tests that only determine infection by previous infection and not the presence of the parasite, especially in patients undergoing treatment evaluation or in newborns. We have evaluated the use of nucleic acids from both circulating exovesicles and cell-free DNA (cfDNA) from 50 samples twice randomly selected from a total of 448 serum samples from immunologically diagnosed patients in whom the presence of the parasite was confirmed by nested PCR on amplicons resulting from amplification with kinetoplastid DNA-specific primers 121F-122R. Six samples were randomly selected to quantify the limit of detection by qPCR in serum exovesicles. When the nucleic acids thus purified were assayed as a template and amplified with kinetoplastid DNA and nuclear satellite DNA primers, a 100% positivity rate was obtained for all positive samples assayed with kDNA-specific primers and 96% when SAT primers were used. However, isolation of cfDNA for Trypanosoma cruzi and amplification with SAT also showed 100% positivity. The results demonstrate that serum exovesicles contain DNA of mitochondrial and nuclear origin, which can be considered a mixed population of exovesicles of parasitic origin. The results obtained with serum samples prove that both cfDNA and Exovesicle DNA can be used to confirm parasitaemia in chronically ill patients or in samples where it is necessary to demonstrate the active presence of the parasite. The results confirm for the first time the existence of exovesicles of mitochondrial origin of the parasite in the serum of those affected by Chagas disease.

Copyright: © 2023 Lozano et al. This is an open access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License, which permits unrestricted use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original author and source are credited.

Datos de la publicación

ISSN/ISSNe:
1932-6203, 1932-6203

Plos One  PUBLIC LIBRARY SCIENCE

Tipo:
Article
Páginas:
282814-282814
Factor de Impacto:
0,852 SCImago
Cuartil:
Q1 SCImago

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Keywords

  • POLYMERASE-CHAIN-REACTION; TRYPANOSOMA-CRUZI INFECTION; CONGENITAL TRANSMISSION; BLOOD-SAMPLES; EXTRACELLULAR VESICLES; SOLID-ORGAN; PCR; EXOSOMES; ANTIGEN; FLUIDS

Campos de estudio

Proyectos asociados

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PI08/0123 . INSTITUTO DE SALUD CARLOS III . 2009

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REGISTRO DE ESTIMULACIÓN TRANSCATÉTER CON EL SISTEMA MICRATM (MICRA)

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D5470C00004 . 2016

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GIL-HAR-2016-01 . 2017

ESTUDIO DE FASE III, ALEATORIZADO, DOBLE CIEGO, MULTICÉNTRICO, CON GRUPOS PARALELOS, DE AUSENCIA DE INFERIORIDAD, PARA EVALUAR LA EFICACIA, SEGURIDAD Y TOLERABILIDAD DE DOLUTEGRAVIR MÁS LAMIVUDINA EN COMPARACIÓN CON DOLUTEGRAVIR MÁS TENOFOVIR/EMTRICITAB INA EN ADULTOS INFECTADOS POR EL VIH-1 NO TRATADOS PREVIAMENTE.

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205543 . 2016

ESTUDIO RETROSPECTIVO MULTICÉNTRICO DE LA EFECTIVIDAD Y SEGURIDAD DE LOS REGÍMENES QUE CONTIENEN DARUNAVIR/COBICISTAT (DRV/C) EN LA PRÁCTICA CLÍNICA HABITUAL. ESTUDIO CODAR.

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SEI-DAR-2016-01 . 2017

ESTUDIO DE FASE 3, MULTICÉNTRICO, ALEATORIZADO, ABIERTO Y CON CONTROL ACTIVO PARA EVALUAR LA EFICACIA Y LA SEGURIDAD DEL TRATAMIENTO CON MARIBAVIR EN COMPARACIÓN CON EL TRATAMIENTO ASIGNADO POR EL INVESTIGADOR EN RECEPTORES DE U N TRASPLANTE CON INFECCI ONES POR CITOMEGALOVIRUS (CMV) QUE SON REFRACTARIOS O RESISTENTES AL TRATAMIENTO CON GANCICLOVIR, VALGANCICLOVIR, FOSCARNET O CIDOFOVIR.

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DETERMINACIÓN DEL COSTE DE LA RECURRENCIA POR CLOSTRIDIUM DIFFICILE EN PACIENTES ADULTOS TRATADOS EN HOSPITALES ESPAÑOLES. ESTUDIO OBSERVACIONAL RETROSPECTIVO MULTICÉNTRICO.

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MSD-CDI-2016-01 . 2017

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B5091007 . 2017

ESTUDIO DE FASE III, ALEATORIZADO, MULTICÉNTRICO, CON GRUPOS PARALELOS Y DE AUSENCIA DE INFERIORIDAD PARA EVALUAR LA EFICACIA, LA SEGURIDAD Y LA TOLERABILIDAD DEL CAMBIO A DOLUTEGRAVIR MÁS LAMIVUDINA EN ADULTOSINFECTADOS POR EL VIH 1 CON SUPRESIÓN VIROLÓGICA.

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204862 . 2018

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JLC-RAL-2017-01

ENSAYO DE FASE II, MULTICÉNTRICO, ALEATORIZADO, DOBLE CIEGO, PARA EVALUAR LA SEGURIDAD, TOLERABILIDAD Y EFICACIA DE CD101 INTRAVENOSO FRENTE A CASPOFUNGINA INTRAVENOSA SEGUIDO DE DESESCALADO A FLUCONAZOL ORAL, EN EL TRATAMIENTO DE PACIENTES CON CANDIDEMI A Y/O CANDIDIASIS INVASIVA.

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MORBILIDAD Y MORTALIDAD A LARGO PLAZO TRAS LA ERRADICACION DEL VHC EN PACIENTES COINFECTADOS POR VIH/VHC CON FIBROSIS HEPATICA AVANZADA/CIRROSIS. ESTUDIO MARATHON.

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FHG-AAD-2018-01 . 2019

A RETROSPECTIVE STUDY TO EVALUATE THE EPIDEMIOLOGY, STANDARD OF CARE, OUTCOMES AND RESOURCE USE ASSOCIATED WITH PATIENTS WHO HAVE, OR ARE AT RISK OF, INFECTION WITH CARBAPENEM NON-SUSCEPTIBLE GRAM-NEGATIVE ORGANISMS OF INTEREST (ENTEROBACTERIACEAE, PSEUDOMONAS, STENOTROPHOMONAS AND ACINETOBACTER).

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OPTIMIZACIÓN DEL DIAGNÓSTICO, TRATAMIENTO Y PREVENCIÓN DE LAS INFECCIONES INVASORAS POR CANDIDA AURIS: ESTUDIO MULTIDISCIPLINAR DEL MAYOR BROTE MUNDIAL DE CANDIDEMIA.

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JPG-FUN-2018-01 . 2019

ENSAYO CLÍNICO DE FASE 3, ALEATORIZADO, DOBLE CIEGO Y CONTROLADO CON PLACEBO PARA EVALUAR LA SEGURIDAD Y LA EFICACIA DE LA PROFILAXIS CON LETERMOVIR (LET) CUANDO SE PROLONGA DE 100 A 200 DÍAS DESPUÉS DEL TRASPLANTE EN RECEPTORES SEROPOSITIVOS PARA EL CITO MEGALOVIRUS (CMV) (R+) DE UN TRASPLANTE ALOGÉNICO DE CÉLULAS MADRE HEMATOPOYÉTICAS (TCMH).

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MK-8228-040 . 2019

IMPACTO CLÍNICO Y MICROBIOLÓGICO DE LOS NUEVOS ANTIPSEUDOMÓNICOS CEFTOLOZANO-TAZOBACTAM Y CEFTAZIDIMA-AVIBACTAM EN LAS INFECCIONES POR PSEUDOMONAS AERUGINOSA EXTREMADAMENTE RESISTENTE. ESTUDIO PSEUDONOVA.

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CMP-COL-2018-01 . 2019

ESTUDIO OBSERVACIONAL, PROSPECTIVO Y MULTICÉNTRICO, PARA DETERMINAR LA INCIDENCIA DE DIARREA ASOCIADA A CLOSTRIDIUM DIFFICILE, FACTORES DE RIESGO Y PRONÓSTICO EN PACIENTES CRÍTICOS EN ESPAÑA.

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AST-ICD-2013-01 . 2014

ESTUDIO ABIERTO ALEATORIZADO DE FASE II/III, MULTICÉNTRICO, CON DOS GRUPOS, QUE EVALÚA LA TOXICIDAD Y EL EFECTO ANTIVIRAL DE LAS ACTUALES TERAPIAS ANTIRRETROVIRALES ESTÁNDARES EN COMPARACIÓN CON EL ELVITEGRAVIR (EVG) ADMINISTRADO JUNTO A DARUNAVIR/RITONAV IR (DRV/R) EN PACIENTES PEDIÁTRICOSINFECTADOS POR EL VIH-1 CON SUPRESIÓN VIRAL.

Investigador Principal: DESAMPARADOS PEREZ TAMARIT

PENTA17 . 2016

ESTUDIO DE FASE 3, MULTICÉNTRICO, ALEATORIZADO, CON ENMASCARAMIENTO DOBLE, EN EL QUE SE COMPARARÁN LA EFICACIA Y LA SEGURIDAD DE REZAFUNGINA PARA INYECCIÓN Y CASPOFUNGINA POR VÍA INTRAVENOSA SEGUIDA DE UN DESESCALADO OPCIONAL A FLUCONAZOL POR VÍA ORAL, EN PACIENTES CON CANDIDEMIA, CANDIDIASIS INVASIVA O AMBAS (ESTUDIO RESTORE)

Investigador Principal: MARÍA ÁNGELES FERRE COLOMER

CD101.IV.3.05 . 2020

ESTUDIO ABIERTO, MULTICENTRICO, DE FASE IV PARA EVALUAR LA EFICACIA Y SEGURIDAD DE INTERFERON PEGILADO ALFA-2A (4P KD) ASOCIADO A RIBAVIRINA PARA HEPATITIS CRONICA C CON ALT PERSISTENTEMENTE NORMALES, EN PACIENTES COINFECTADOS POR EL VIRUS DE LA INMUNODEF ICIENCIA HUMANA.

Investigador Principal: JOSE LACRUZ RODRIGO

CONTRA

ESTUDIO MULTICENTRICO, DOBLE CIEGO, RANDOMIZADO Y CONTROLADO CON COMPARADOR ACTIVO, PARA EVALUAR LA SEGURIDAD Y LA EFICACIA ANTIRRETROVIRAL DEL MK0518 FRENTE A KALETRA EN PACIENTES INFECTADOS CON VIH Y EN TRATAMIENTO ESTABLE CON KALETRA A LOS QUE SE LES CAMBIA DE TRATAMIENTO.

Investigador Principal: JOSÉ LÓPEZ ALDEGUER

0518-032

ENSAYO EN FASE III, ALEATORIZADO, DOBLE CIEGO O CON ENMASCARAMIENTO PARA EL OBSERVADOR, CONTROLADO CON PLACEBO, PARA EVALUAR LA EFICACIA Y SEGURIDAD DE UNA VACUNA DE SUBUNIDAD F PREFUSIÓN CONTRA EL VIRUS RESPIRATORIO SINCITIAL (VRS) EN LACTANTES NACIDOS D E MUJERES VACUNADAS DURANTE EL EMBARAZO

Investigador Principal: EMILIO MONTEAGUDO MONTESINOS

C3671008 . 2020

ENSAYO CLINICO PARA EVALUAR EL EFECTO SOBRE LA GRASA SUBCUTANEA DEL CAMBIO DE EFV POR LPV/R EN PACIENTES INFECTADOS POR VIH QUE DESARROLLAN LIPOATROFIA QUE SIGUE SIENDO CLINICAMENTE EVIDENTE A PESAR DEL TRATAMIENTO CON EFAVIRENZ Y UNA COMBINACION A DOSIS FIJA DE ANALOGOS DE NUCLEOSIDOS NO TIMIDINICOS.

Investigador Principal: JOSÉ LÓPEZ ALDEGUER

LIPOKAL

UN ENSAYO ALEATORIZADO INTERNACIONAL PARA EVALUAR TRATAMIENTOS NO LICENCIADOS PARA COVID-19 EN PACIENTES HOSPITALIZADOS QUE RECIBEN EL TRATAMIENTO CONVENCIONAL PARA COVID QUE SE OFRECE EN CADA HOSPITAL.

Investigador Principal: MIGUEL SALAVERT LLETÍ

OMS COVID-19 . 2020

ESTUDIO FASE IIIB, ALEATORIZADO, MULTICÉNTRICO, CON GRUPO CONTROL ACTIVO, DE GRUPO PARALELO, NO INFERIORIDAD, ABIERTO, QUE EVALÚA LA EFICACIA, SEGURIDAD Y TOLERABILIDAD DEL CAMBIO A CABOTEGRAVIR DE ACCIÓN PROLONGADA JUNTO CON RILPIVIRINA DE ACCIÓN PROLONGADA ADMINISTRADO CADA DOS MESES DESDE UN RÉGIMEN DE COMPRIMIDO ÚNICO DE BICTEGRAVIR/EMTRICITABINA/ TENOFOVIR ALAFENAMIDA EN ADULTOS INFECTADOS POR VIH-1 VIROLÓGICAMENTE SUPRIMIDOS.

Investigador Principal: MARTA MONTERO ALONSO

213500 . 2020

ESTUDIO ALEATORIO, TRIPLE CIEGO, CON DOS GRUPOS, PARALELOS, PARA EVALUAR LA EFICACIA, LA TOLERABILIDAD Y LA SEGURIDAD DE LA ADMINITRACION DE LOSARTAN 100 MG/HIDROCLOROTIZIDA 25 MG FRENTE A AMLODIPINO 10 MG MAS HIDROCLOROTIAZIDA 25 MG. EN PACIENTES CON HIPERTENSION ARTERIAL MODERADA-GRAVE.

Investigador Principal: JOSE RAMON CALABUIG ALBORCH

MDS954-948/700

ACCESO PRECOZ A MK-0518 EN COMBINACION CON UN TRATAMIENTO DE BASE ANTIRETROVIRAL OPTIMIZADO (TBO) EN PACIENTES INFECTADOS CON VIH-1 CON MUCHA EXPERIENCIA PREVIA EN OTROS TRATAMIENTOS Y CON OPCIONES TERAPEUTICAS LIMITADAS O NULAS.

Investigador Principal: JOSÉ LÓPEZ ALDEGUER

0518-023

ACCESO PRECOZ A TMC125 EN COMBINACION CON OTROS ANTIRRETROVIRALES EN SUETOS INFECTADOS POR EL VIH 1 PREVIAMENTE TRATADOS CON OPCIONES LIMITADAS DE TRATAMIENTO.

Investigador Principal: JOSÉ LÓPEZ ALDEGUER

TMC125-C214

ENSAYO MULTICENTRICO Y ABIERTO DE ACCESO EXPANDIDO A MARAVIROC.

Investigador Principal: JOSÉ LÓPEZ ALDEGUER

A4001050

ENSAYO CLINICO MULTICENTRICO, PROSPECTIVO, ALEATORIZADO Y ABIERTO, PARA COMPARAR LA SEGURIDAD Y EFICACIA DE APTIVUS POTENCIADO CON DOSIS BAJAS DE RITONAVIR (TIPRANAVIR, TPV/R) FRENTE A PREZISTA (DARUNAVIR, DRV/R) EN PACIENTES AMPLIAMENTE PRETRATADOS CON LAS TRES CLASES DE ANTIRRETROVIRALES (ITIN, ITINN E IP) Y QUE PRESENTEN RESISTENCIA A MAS DE UN IP.

Investigador Principal: JOSÉ LÓPEZ ALDEGUER

1182.71

ENSAYO CLINICO EN FASE IV ALEATORIZADO, ABIERTO, MULTICENTRICO Y DE NO INFERIORIDAD PARA COMPARAR LA SEGURIDAD Y LA EFICACIA DE COLISTINA IV. CON MEROPENEM IV. EN EL TRATAMIENTO DE LA NEUMONIA ASOCIADA A VENTILACION MECANICA

Investigador Principal: JUAN MANUEL BONASTRE MORA

MAGICBULLET/COLOMER

EFICACIA Y SEGURIDAD DEL TRATAMIENTO FRENTE AL VIRUS DE LA HEPATITIS C BASADO EN ANTIVIRALES DE ACCIÓN DIRECTA EN CONDICIONES DE USO REAL: COHORTE GEHEP.

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FPS-MON-2014-01

ESTUDIO TRANSVERSAL DE LA COINFECIÓN VIH - VHC EN ESPAÑA.

Investigador Principal: MARTA MONTERO ALONSO

SEI-VIH-2015-01

ESTUDIO PROSPECTIVO PARA LA DETECCIÓN PRECOZ DE CARCINOMA PULMONAR EN PACIENTES CON INFECCIÓN POR VIH.

Investigador Principal: MARTA MONTERO ALONSO

GESIDA 8815 . 2016

ESTUDIO DE FASE2, ALEATORIZADO, DOBLE CIEGO, CONTROLADO CON PLACEBO PARA EVALUAR LA ACTIVIDAD ANTIVÍRICA, LOS RESULTADOS CLÍNICOS, LA SEGURIDAD, LA TOLERABILIDAD Y LA FARMACOCINÉTICA DE PAUTAS DE LUMICITABINA (JNJ-64041575) DE ADMINISTRACIÓN ORAL EN LACTA NTES Y NIÑOS DE ENTRE 28 DÍAS Y 36 MESES DE EDAD HOSPITALIZADOS POR INFECCIÓN CON VIRUS RESPIRATORIO SINCITIAL.

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64041575RSV2004

VALORACIÓN DE LA FACILIDAD DE USO DE UNA HERRAMIENTA INFORMÁTICA DESARROLLADA PARA EL SEGUIMIENTO EN LOS PERÍODOS ENTRE CONSULTAS DE PACIENTES CON INFECCIÓN CRÓNICA POR VIH ESTABLES. EL PROYECTO CRÓNICA REMOTE.

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IMPAC-NEO . 2021

PREVENCION DEL DESARROLLO DE ENFERMEDAD POR SARS-COV-2 (COVID-19) MEDIANTE LA ADMINISTRACION PROFILÁCTICA DE EMTRICITABINA/TENOFOVIR DISOPROXILO E HIDROXICLOROQUINA EN PERSONAL SANITARIO DE ALTO RIESGO: ENSAYO CLÍNICO ALEATORIZADO, CONTROLADO CON PLACEBO .

Investigador Principal: MARÍA TASIAS PITARCH

PREP COVID-19 . 2020

ENSAYO CLÍNICO FASE III ALEATORIZADO, CONTROLADO Y ABIERTO EN PACIENTES CON INFECCIÓN RECURRENTE POR CLOSTRIDIOIDES DIFFICILE (CD) PARA EVALUAR LA EFICACIA Y LA SEGURIDAD DE CÁPSULAS DE MICROBIOTA FECAL LIOFILIZADA VS FIDAXOMICINA.

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ICD01 . 2021

METABOLIZACIÓN DE DIGOXINA POR LA MICROBIOTA ENTÉRICA.

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JSA-DIG-2019-01 . 2023

ENSAYO CLÍNICO PILOTO PARA EVALUAR LA EFICACIA, SEGURIDAD Y TOLERABILIDAD DEL CAMBIO A UN TRATAMIENTO CON BICTEGRAVIR/FTC/TAF (BIKTARVY®) MÁS DARUNAVIR/COBICISTAT EN PACIENTES INFECTADOS POR VIH-1 ALTAMENTE TRATADOS.

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BIDA . 2021

ESTUDIO DE FASE III, MULTICÉNTRICO, ALEATORIZADO, DOBLE CIEGO, CONTROLADO CON PLACEBO, DE GRUPOS PARALELOS PARA EVALUAR LA EFICACIA Y LA SEGURIDAD DE REMDESIVIR EN PARTICIPANTES CON REDUCCIÓN SEVERA DE LA FUNCIÓN RENAL HOSPITALIZADOS POR COVID-19.

Investigador Principal: MIGUEL SALAVERT LLETÍ

GS-US-540-5912 . 2021

REAL LIFE STUDY OF BICTEGRAVIR, EMTRICITABINE, AND TENOFOVIR ALAFENAMIDE IN HIV-1 INFECTED TREATMENT-NAIVE PATIENTS USING TEST AND TREAT STRATEGY. (BIC-NOW).

Investigador Principal: MARTA MONTERO ALONSO

CHT-BIC-2020-01 . 2022

Estudio de fase IV, multicéntrico, abierto y aleatorizado, para evaluar el impacto del cambio de tratamiento antirretroviral de terapia dual a terapia triple sobre la inflamación en pacientes con infección por VIH tipo 1

Investigador Principal: MARTA MONTERO ALONSO

GESIDA10918 . 2021

A descriptive, prospective, multi-country, multicentre study to assess performance of genital Herpes Simplex Virus-2 (HSV-2) related disease endpoints based on patient-reported health outcomes, self-swabbing collected via decentralised approach in patients ≥ 18 years of age in the United States and Europe.

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214523 (EPI-HSV-006 BOD TH) . 2021

Impacto del tratamiento temprano con RDV. Experiencia y Seguridad con su uso en vida real en pacientes con COVID-19: Análisis retrospectivo de la cohorte española.

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RDV-RWE . 2021

Estudio de fase IIb, aleatorizado, con doble enmascaramiento, de grupos paralelos para evaluar la eficacia, la seguridad, la tolerabilidad y el perfil de resistencia de GSK3640254 en combinación con dolutegravir en comparación con dolutegravir más lamivudina en adultos infectados por el VIH-1 sin tratamiento previo.

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212483 . 2021

Implicaciones para la salud del aumento de peso, del índice de masa corporal y de la relación cintura/cadera después de comenzar el primer TAR con los principales inhibidores de integrasa.

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PHAGTHER. Utilización de bacteriófagos para el tratamiento de infecciones multirresistentes asociadas con la asistencia sanitaria.

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CIAICO/2021/306 . CONSELLERIA DE INNOVACIÓN, UNIVERSIDADES, CIENCIA Y SOCIEDAD DIGITAL . 2022

Overcoming barriers to care for delta infected patients.

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ENSAYO CLÍNICO ALEATORIZADO, CONTROLADO, ABIERTO, MULTICÉNTRICO PARA EVALUAR LA EFICACIA Y LA SEGURIDAD DE UNA COMBINACIÓN DE FÁRMACOS ANTITUBERCULOSAS BASADA EN DOSIS ALTA DE RIMPICINA, DOSIS ALTAS DE MOXIFLOXACINO Y LINEZOLID EN PACIENTES CON TUBERCULOSIS PULMONAR BACILÍFERA (RML-TB).

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Nuevas estrategias en la prevención, diagnóstico y tratamiento de las infecciones asociadas con la asistencia sanitaria (REDUCHAI).

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PID2021-122875OB-I00 . MINISTERIO DE CIENCIA E INNOVACION . 2022

ESTUDIO RETROSPECTIVO MULTICÉNTRICO DE LA EFECTIVIDAD Y SEGURIDAD DE LA COMBINACIÓN DOLUTEGRAVIR + RILPIVIRINA TRAS EL CAMBIO DESDE PAUTAS CON TAF.

Investigador Principal: MARTA MONTERO ALONSO

TADORI . 2022

Etiología de la neumonía adquirida en la comunidad tras la pandemia COVID-19 en la era de las técnicas microbiológicas moleculares. Estudio multicéntrico nacional.

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PI22/01712 . INSTITUTO DE SALUD CARLOS III . 2023

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GS-US-611-6273 . 2023

Quimioluminiscencia como técnica de cribado de Mononucleosis infecciosa.

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“CABO-CHANCE: Estudio en vida real sobre el uso de Cabotegravir/Rilpivirina de acción prolongada (CAB/RPV AP) en pacientes pretratados que viven con el VIH (PVVIH).”

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FIB-CAB-2023-02 . 2023

Comparación de fidaxomicina en posología convencional frente a fidaxomicina en posología extendida en pulsos en pacientes con alto riesgo de recurrencia de infección por C.difficile. Estudio multicéntrico mediante análisis de propensión”.

Investigador Principal: EVA CALABUIG MUÑOZ

235/22 . 2023

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