Utility of Optical Genome Mapping for Accurate Detection and Fine-Mapping of Structural Variants in Elusive Rare Diseases

Autores de IIS La Fe
Participantes ajenos a IIS La Fe
- Sanchis, Amparo
- Senent, Maria Leonor
Grupos
Abstract
Rare diseases (RDs) often have a genetic basis, yet conventional diagnostic techniques fail to identify causative genetic variations in up to 50% of cases. Structural variants (SVs), including balanced rearrangements, frequently evade detection by karyotyping, microarray, and exome sequencing. The present study utilized optical genome mapping (OGM) to investigate two patients with RDs whose genetic etiology remained unresolved despite prior genomic analyses. Patient 1 exhibited a balanced reciprocal translocation disrupting the BCL11A gene, associated with Dias-Logan syndrome. Patient 2 had a mosaic 682 kb deletion near the IHH gene, causing ectopic enhancer-promoter interactions and polydactyly, mirroring phenotypes observed in mouse models and similar human cases. These findings highlight OGM's efficacy in identifying complex SVs and underline novel pathogenic mechanisms in rare genetic disorders. Consequently, the incorporation of OGM into routine diagnostic procedures will enhance genetic diagnosis, discover new syndromes of currently unknown cause, and eventually improve the clinical management of numerous patients with rare diseases.
Datos de la publicación
- ISSN/ISSNe:
- 1661-6596, 1661-6596
- Tipo:
- Article
- Páginas:
- -
- DOI:
- 10.3390/ijms26031244
- Factor de Impacto:
- 1,176 SCImago ℠
- Cuartil:
- Q1 SCImago ℠
INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES MDPI AG
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Cita
Orellana C,Rosello M,Sanchis A,Pedrola L,Martin C,Gabaldon A,Senent ML,Such E,Garcia C,Avetisyan G,Martinez F. Utility of Optical Genome Mapping for Accurate Detection and Fine-Mapping of Structural Variants in Elusive Rare Diseases. Int J Mol Sci. 2025. 26. (3):1244. IF:4,900. (1).