Portal de recerca
Fluconazole-resistant Candida parapsilosis: fast detection of the Y132F ERG11p substitution, and a proposed microsatellite genotyping scheme.
Autors de IIS La Fe
Autors aliens a IIS La Fe
- Guinea, Jesus
- Alcoceba, Eva
- Padilla, Eduardo
- Ramirez, Aida
- De Carolis, Elena
- Sanguinetti, Maurizio
- Munoz-Algarra, Maria
- Duran-Valle, Teresa
- Quiles-Melero, Inmaculada
- Merino, Paloma
- Gonzalez-Romo, Fernando
- Sanchez-Garcia, Aida
- Gomez-Garcia-de-la-Pedrosa, Elia
- Perez-Ayala, Ana
- Mantecon-Vallejo, Maria Angeles
- Cuetara, Maria Soledad
- Zurita, Nelly Daniela
- Garcia-Esteban, Coral
- Martinez-Jimenez, Maria Del Carmen
- Sanchez Castellano, Miguel Angel
- Reigadas, Elena
- Munoz, Patricia
- Escribano, Pilar
Grups d'Investigació
Abstract
OBJECTIVES: We propose fast and accurate molecular detection of the Y132F ERG11p substitution directly on pure-cultured Candida parapsilosis isolates. We also assessed a discriminative genotyping scheme to track circulating genotypes. METHODS: A total of 223 C. parapsilosis isolates (one patient each) from 20 hospitals, located in Spain and Italy were selected. Isolates were fluconazole-resistant (n = 94; harbouring the Y132F ERG11p substitution [n = 85], the G458S substitution [n = 6], the R398I substitution [n = 2], or the wild-type ERG11 gene sequence) or fluconazole-susceptible (n = 129). Two targeted-A395T-mutation PCR formats (conventional and real-time) were engineered and optimized on fluconazole-susceptible and fluconazole-resistant pure-cultured isolates, thus skipping DNA extraction. Two genotyping schemes were compared: Scheme 1 (CP1, CP4a, CP6, and B markers), and Scheme 2 (6A, 6B, 6C, CP1, CP4a, and CP6 markers). RESULTS: The screening performed using both PCR formats showed 100% specificity (fluconazole-susceptible isolates; n = 129/129) and sensitivity (Y132F isolates; n = 85/85) values; however, results were available in 3 and 1.5 hours with the conventional and real-time PCR formats, respectively. Overall, Scheme 1 showed higher genetic diversity than Scheme 2, as shown by the number of alleles detected (n = 98; mean 23, range 13-38), the significantly higher observed and expected heterozygosity, and the probability of identity index (2.5 × 10(-6)). Scheme 2 markers did not provide further genotypic discrimination of Y132F fluconazole-resistant genotypes. CONCLUSION: Both proposed PCR formats allow us to speed up the accurate detection of substitution Y132F ERG11p in C. parapsilosis isolates with 100% specificity and sensitivity. In addition, we recommend CP1, CP4a, CP6, and B microsatellite markers for genotyping fluconazole-resistant isolates.
Copyright © 2024 European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases. Published by Elsevier Ltd. All rights reserved.
Dades de la publicació
- ISSN/ISSNe:
- 1198-743X, 1469-0691
- Tipus:
- Article
- Pàgines:
- 1447-1452
- PubMed:
- 39002661
- Factor d'Impacte:
- 3,111 SCImago ℠
- Quartil:
- Q1 SCImago ℠
CLINICAL MICROBIOLOGY AND INFECTION ELSEVIER SCI LTD
Cites Rebudes en Web of Science: 2
Documents
- No hi ha documents
Filiacions
Filiacions no disponibles
Keywords
- Candida parapsilosis; Fluconazole-resistant; Genotyping; Y132F
Projectes associats
FUNGEMIA: EPIDEMIOLOGIA, MECANISMOS DE RESISTENCIA ANTIFUNGICA Y TIPADO MOLECULAR
090/2006- EVES - PEMAN . 2006
NUEVAS ESTRATEGIAS PARA EL TRATAMIENTO DE LAS INFECCIONES ASOCIADAS A BIOCAPAS FUNGICAS.
Investigador Principal: EMILIA CANTON LACASA
PI12/02786 . INSTITUTO DE SALUD CARLOS III . 2013
Optimización del diagnóstico, tratamiento y prevención de las infecciones invasoras por Candida Auris: Estudio multidisciplinar del mayor brote mundial de candidemia.
Investigador Principal: JAVIER PEMÁN GARCÍA
PI17/01538 . INSTITUTO DE SALUD CARLOS III . 2018
PLATAFORMA PARA LA DETECCIÓN DE PATÓGENOS BASADA EN MATERIALES CON PUERTAS MOLECULARES (PATH-GATE).
Investigador Principal: RAMÓN MARTÍNEZ MÁÑEZ
DTS18/00090 . INSTITUTO DE SALUD CARLOS III . 2019
MULTICIDE. Prevención de infecciones relacionadas con la asistencia sanitaria mediante la implementación de sistemas biocidas multifuncionales basados en materiales nanoestructurados MOF y grafenos
Investigador Principal: JAVIER PEMÁN GARCÍA
INNEST00/19/124 . AGENCIA VALENCIANA DE LA INNOVACION (AVI) . 2019
ENSAYO DE FASE II, MULTICÉNTRICO, ALEATORIZADO, DOBLE CIEGO, PARA EVALUAR LA SEGURIDAD, TOLERABILIDAD Y EFICACIA DE CD101 INTRAVENOSO FRENTE A CASPOFUNGINA INTRAVENOSA SEGUIDO DE DESESCALADO A FLUCONAZOL ORAL, EN EL TRATAMIENTO DE PACIENTES CON CANDIDEMI A Y/O CANDIDIASIS INVASIVA.
Investigador Principal: MARÍA ÁNGELES FERRE COLOMER
CD101.IV.2.03 . 2018
ESTUDIO EN FASE IIB, ABIERTO Y DE GRUPO ÚNICO DE F901318 COMO TRATAMIENTO DE INFECCIONES FÚNGICAS INVASIVAS DEBIDAS A LOMENTOSPORA PROLIFICANS,SCEDOSPORIUM SPP., ASPERGILLUS SPP. Y OTROS HONGOS RESISTENTES EN PACIENTES QUE NO DISPONEN DE OPCIONES DE TRATAMIENTO ALTERNATIVAS ADECUADAS.
Investigador Principal: AMPARO SOLÉ JOVER
F901318/0032 . 2018
OPTIMIZACIÓN DEL DIAGNÓSTICO, TRATAMIENTO Y PREVENCIÓN DE LAS INFECCIONES INVASORAS POR CANDIDA AURIS: ESTUDIO MULTIDISCIPLINAR DEL MAYOR BROTE MUNDIAL DE CANDIDEMIA.
Investigador Principal: JAVIER PEMÁN GARCÍA
JPG-FUN-2018-01 . 2019
CAMBIOS EPIDEMIOLÓGICOS, CLÍNICOS Y TERAPÉUTICOS DE LA CANDIDEMIA EN NIÑOS MENORES DE 15 AÑOS DE UN HOSPITAL TERCIARIO DURANTE UN PERÍODO DE 8 AÑOS (2011-2018).
Investigador Principal: ANA ISABEL PIQUERAS ARENAS
APA-PIP-2019-01 . 2019
MOBACT. Prevención de infecciones nosocomiales mediante el desarrollo de materiales híbridos bacteriostáticos y/o bactericidas para mobiliario sanitario
Investigador Principal: HECTOR ROLANDO MARTÍNEZ MOREL
INNEST/2020/52 . AGENCIA VALENCIANA DE LA INNOVACION (AVI) . 2020
ESTUDIO DE FASE 3, MULTICÉNTRICO, ALEATORIZADO, CON ENMASCARAMIENTO DOBLE, EN EL QUE SE COMPARARÁN LA EFICACIA Y LA SEGURIDAD DE REZAFUNGINA PARA INYECCIÓN Y CASPOFUNGINA POR VÍA INTRAVENOSA SEGUIDA DE UN DESESCALADO OPCIONAL A FLUCONAZOL POR VÍA ORAL, EN PACIENTES CON CANDIDEMIA, CANDIDIASIS INVASIVA O AMBAS (ESTUDIO RESTORE)
Investigador Principal: MARÍA ÁNGELES FERRE COLOMER
CD101.IV.3.05 . 2020
ESTUDIO ALEATORIZADO DOBLE CIEGO Y COMPARATIVO DE MICAFUNGINA (FK463) A LA CASPOFUNGINA COMO TRATAMIENTO ANTIFUNGICO EN PACIENTES CON CANDIDEMIA O CANDIDIASIS INVASIVA
Investigador Principal: MIGUEL GOBERNADO SERRANO
03-0-192
ESTUDIO MULTICENTRICO, ABIERTO, NO COMPARATIVO, PARA EVALUAR LA SEGURIDAD, TOLERABILIDAD Y EFICACIA DEL PEREPARADO MK-0991 EN EL TRTAMIENTO DE LAS INFECCIONES INVASIVAS POR ASPERGILLUS EN ADULTOS REFRACTARIOS O CON INTOLERANCIA A ANFOTERICINA B, FORMULACIONES LIPIDICAS DE ANFOTERICINA B O AZOLES.
Investigador Principal: MIGUEL GOBERNADO SERRANO
MSD991-019/0398
ESTUDIO MULTICENTRICO, DOBLE CIEGO, RANDOMIZADO Y COMPARATIVO PARA EVALUAR LA SEGURIDAD, TOLERABILIDAD Y EFICACIA DE MK-0991 COMPARADA CON (ANFOTERICINA B) LIPOSOMAL INYECTABLE, COMO TERAPIA EMPIRICA EN PACIENTES CON FIEBRE PERSISTENTE Y NEUTROPENIA.
Investigador Principal: MIGUEL ÁNGEL SANZ ALONSO
MK-991-026
ESTUDIO MULTICENTRICO, DOBLE CIEGO, COMPRARATIVO, ALEATORIZADO PARA EVALUAR LA EFICACIA Y SEGURIDAD DE MICAFUNGIS (FK463) FRENTE A ANFOTERICINA B LIPOSOMAL (AMBISOME) EN EL TRATAMIENTO DE LA CANDIDEMIA Y CANDIDIASIS INVASIVA.
Investigador Principal: MIGUEL GOBERNADO SERRANO
FG-463-21-08
ESTRATEGIA DE MANEJO ANTIFÚNGICO DEL PACIENTE ONCOHEMATOLÓGICO NEUTROPÉNICO. EMPLEO DE VORICONAZOL COMO TRATAMIENTO ANTICIPADO.
Investigador Principal: MIGUEL ÁNGEL SANZ ALONSO
ANTIVORIFUNGOL
ESTUDIO ABIERTO DE ISAVUCONAZOLE EN EL TRATAMIENTO DE PACIENTES CON ASPERGILOSIS Y DETERIORO DE LA FUNCION RENAL O DE PACIENTES CON ENFERMEDAD FUNGICA INVASIVA CAUSADA POR MOHOS ATIPICOS, LEVADURAS U HONGOS DIMORFICOS
Investigador Principal: ISIDRO JARQUE RAMOS
WSA-CS-003
ESTUDIO EPIDEMIOLOGICO DE DIAGNOSTICO PRECOZ DE LA CANDIDIASIS INVASORA EN PACIENTES NEONATOS PRETERMINO DE MUY BAJO PESO. ESTUDIO CANDI-NEO
Investigador Principal: MÁXIMO VENTO TORRES
AST-MYC-2010-01
ESTUDIO OBSERVACIONAL, PROSPECTIVO Y MULTICÉNTRICO EN CUIDADOS INTENSIVOS PARA EVALUAR LA FIABILIDAD DIAGNÓSTICOA DE LA PCR (REACCIÓN EN CADENA DE LA POLIMERASA) EN PACIENTES EN TRATAMIENTO ANTIFÚNGICO EMPÍRICO POR SOSPECHA DE CANDIDIASIS INVASIVA. (ESTUD IO MICAFEM).
Investigador Principal: PAULA RAMÍREZ GALLEYMORE
AST-INF-2012-01
AYUDAS MARGARITA SALAS PARA LA FORMACIÓN DE JÓVENES DOCTORES_Alba García Fernández
Investigador Principal: JAVIER PEMÁN GARCÍA
2021-754-1_CRC_Margarita Salas_PEMAN-TORMO . MINISTERIO DE UNIVERSIDADES . 2022
Estudio piloto in vitro e in vivo de la eficacia y efectividad de la nitroxolina en el tratamiento de la candiduria por Candida auris.
Investigador Principal: VÍCTOR GARCÍA BUSTOS
NITROX-AURIS . 2021
PHAGTHER. Utilización de bacteriófagos para el tratamiento de infecciones multirresistentes asociadas con la asistencia sanitaria.
Investigador Principal: MARÍA ÁNGELES TORMO MAS
CIAICO/2021/306 . CONSELLERIA DE INNOVACIÓN, UNIVERSIDADES, CIENCIA Y SOCIEDAD DIGITAL . 2022
Immune response to SARS-CoV-2 vaccination in immunocompromised patients and epigenetic predictors of post-vaccination response.
Investigador Principal: ALBA CECILIA RUIZ GAITÁN
2022-217-1_EOm . 2022
Desarrollo de dispositivos basados en ensayos de flujo lateral para la detección rápida, selectiva y sensible de hongos filamentosos en ambientes controlados de hospital para prevención y control de infecciones nosocomiales.
Investigador Principal: HECTOR ROLANDO MARTÍNEZ MOREL
CPP2021-008945 . MINISTERIO DE CIENCIA E INNOVACION . 2022
Estudio de fase 3, multicéntrico, prospectivo, aleatorizado, con enmascaramiento doble, en el que se comparan dos tratamientos para la candidemia y/o la candidiasis invasiva: una equinocandina por vía intravenosa, seguida de ibrexafungerp por vía oral, frente al tratamiento con una equinocandina por vía intravenosa, seguida de fluconazol por vía oral (MARIO)
Investigador Principal: DAVID MARTÍNEZ CUADRÓN
SCY-078-302 . 2023
Diagnóstico precoz de candidiasis invasiva en el paciente crítico basado en la determinación de beta-d-glucano sérico, citoquinas y metabolómica.
Investigador Principal: ALBA CECILIA RUIZ GAITÁN
PI23/00826 . INSTITUTO DE SALUD CARLOS III . 2024