K-Means Clustering Identifies Diverse Clinical Phenotypes in COVID-19 Patients: Implications for Mortality Risks and Remdesivir Impact.

Fecha de publicación: Fecha Ahead of Print:

Autores de IIS La Fe

  • Carolina Garcia Vidal

    Autor

  • Rosario Menéndez Villanueva

    Autor

  • Jesus Antonio Martinez Dominguez

    Autor

  • María Angeles Marcos Maeso

    Autor

Participantes ajenos a IIS La Fe

  • Teijón-Lumbreras C
  • Aiello TF
  • Chumbita M
  • Mateu-Subirà A
  • Peyrony O
  • Monzó P
  • Lopera C
  • Gallardo-Pizarro A
  • Calbo E
  • Xercavins M
  • Cuesta-Chasco G
  • Mensa J
  • Soriano A

Grupos

Abstract

INTRODUCTION: The impact of remdesivir on mortality in patients with COVID-19 is still controversial. We aimed to identify clinical phenotype clusters of COVID-19 hospitalized patients with highest benefit from remdesivir use and validate these findings in an external cohort. METHODS: We included consecutive patients hospitalized between February 2020 and February 2021 for COVID-19. The derivation cohort comprised subjects admitted to Hospital Clinic of Barcelona. The validation cohort included patients from Hospital Universitari Mutua de Terrassa (Terrassa) and Hospital Universitari La Fe (Valencia), all tertiary centers in Spain. We employed K-means clustering to group patients according to reverse transcription polymerase chain reaction (rRT-PCR) cycle threshold (Ct) values and lymphocyte counts at diagnosis, and pre-test symptom duration. The impact of remdesivir on 60-day mortality in each cluster was assessed. RESULTS: A total of 1160 patients (median age 66, interquartile range (IQR) 55-78) were included. We identified five clusters, with mortality rates ranging from 0 to 36.7%. Highest mortality rate was observed in the cluster including patients with shorter pre-test symptom duration, lower lymphocyte counts, and lower Ct values at diagnosis. The absence of remdesivir administration was associated with worse outcome in the high-mortality cluster (10.5% vs. 36.7%; p < 0.001), comprising subjects with higher viral loads. These results were validated in an external multicenter cohort of 981 patients. CONCLUSIONS: Patients with COVID-19 exhibit varying mortality rates across different clinical phenotypes. K-means clustering aids in identifying patients who derive the greatest mortality benefit from remdesivir use.

© 2024. The Author(s).

Datos de la publicación

ISSN/ISSNe:
2193-8229, 2193-6382

Infectious Diseases and Therapy  Springer Healthcare

Tipo:
Article
Páginas:
715-726
Factor de Impacto:
1,141 SCImago
Cuartil:
Q2 SCImago

Documentos

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Keywords

  • Antiviral agents; Artificial intelligence; COVID-19; Clustering

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CTBM100G2202 . 2017

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Z7224L01 . 2017

ESTUDIO ALEATORIZADO, DOBLE CIEGO, CONTROLADO CON PLACEBO, DE GRUPOS PARALELOS MULTICÉNTRICO, PARA EVALUAR LA EFICACIA, LA SEGURIDAD, LA TOLERABILIDAD Y LA FARMACOCINÉTICA DE INS1007 ADMINISTRADA UNA VEZ AL DÍA DURANTE 24 SEMANAS EN SUJETOS CON BRONQUIECT ASIA NO DEBIDA A FIBROSIS QUÍSTICA; EL ESTUDIO WILLOW.

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CE01-300

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Investigador Principal: JAIME SANZ CABALLER

CINC424A2401 . 2011

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Investigador Principal: JAIME SANZ CABALLER

AP24534-15-303 . 2016

ESTUDIO FASE II DE TRATAMIENTO CON DASATINIB EN NIÑOS Y ADOLESCENTES CON LEUCEMIA MIELOIDE CRONICA EN FASE CRONICA, RECIEN DIAGNOSTICADA O CON LEUCEMIAS PH+ CON RESISTENCIA O INTOLERANCIA A IMATINIB.

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CA180-226 . 2009

ESTUDIO DE FASE IB DE DETERMINACION DE DOSIS DE PANOBINOSTAT (LBH589) POR VIA ORAL EN COMBINACION CON UN TRATAMIENTO DE INDUCCION CON IDARUBICINA Y CITARABINA Y CON UN TRATAMIENTO DE CONSOLIDACION CON DOSIS ALTA DE CITARABINA EN PACIENTES ADULTOS DE EDAD IGUAL O MENOR A 65 AÑOS CON LEUCEMIA MIELOIDE AGUDA (LMA)

Investigador Principal: MIGUEL ÁNGEL SANZ ALONSO

CLBH589G2101 . 2010

ESTUDIO EPIDEMIOLÓGICO SOBRE EL ESTADO ACTUAL DE LOS PACIENTES CON ENFERMEDAD DE GAUCHER TIPO I EN ESPAÑA, EVALUADOS MEDIANTE LA THERAPEUTIC GOALS MAP (MONITOR, ACTION AND PROGRESS) TOOL©

Investigador Principal: JESUS ANTONIO MARTINEZ DOMINGUEZ

SHI-TSE-2011-01 . 2013

ESTUDIO OBSERVACIONAL EUROPEO DE DASATINIB (SPRYCEL) EN EL TRATAMIENTO DE PACIENTES CON LEUCEMIA MIELOIDE CRONICA, RESISTENTES E INTOLERANTES A IMATINIB

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CA180211 . 2009

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B1371003

ENSAYO CLINICO DE FASE 3, MULTICÉNTRICO, RANDOMIZADO, ABIERTO, PARALELO DE AZACITIDINA SUBCUTÁNEA MÁS CUIDADOS PALIATIVOS FRENTE A REGÍMENES DE CUIDADOS CONVENCIONALES MÁS CUIDADOS PALIATIVOS PARA EL TRATAMIENTO DE SÍNDROME MIELODISPLÁSICO (SMD).

Investigador Principal: MIGUEL ÁNGEL SANZ ALONSO

AZAPHGL2003CL001

ESTUDIO DE EXTENSIÓN ABIERTO DEL FÁRMACO ORAL CEP-701 EN PACIENTES CON ENFERMEDADES MALIGNAS HEMATOLÓGICAS QUE HAN PARTICIPADO EN UN ESTUDIO CLINICO DEL CEP-701.

Investigador Principal: MIGUEL ÁNGEL SANZ ALONSO

C0701A/501/ON/US

NECESIDADES NO CUBIERTAS EN LA LMC Y LA LLA PH+ (UNIC): ESTUDIO EUROPEO TRANSVERSAL DE LA EPIDEMIOLOGIA, LOS PATRONES DE TRATAMIENTO Y LOS RESULTADOS DE LA LEUCEMIA MIELOGENA Y LA LEUCEMIA LINFOBLASTICA AGUDA POSITIVA AL CROMOSOMA FILADELFIA

Investigador Principal: MIGUEL ÁNGEL SANZ ALONSO

CA180-062

ESTUDIO FASE III, MULTICENTRICO, ABIERTO, ALEATORIZADO DE IMATINIB FRENTE A NILOTINIB, EN PACIENTES ADULTOS CON LEUCEMIA MIELOIDE CRONICA CROMOSOMA FILADELFIA POSITIVO (PH+) EN FASE CRONICA (LMC-FC) DE NUEVO DIAGNOSTICO.

Investigador Principal: MIGUEL ÁNGEL SANZ ALONSO

CAMN107A2303

ENSAYO FASE III, ABIERTO, ALEATORIZADO, MULTICÉNTRICO: DASATINIB (SPRYCEL) FRENTE A LA DOSIS ESTÁNDAR DE IMATINIB (400 MG) EN EL TRATAMIENTO DE PACIENTES CON LEUCEMIA MIELIODE CRÓNICA CON CROMOSOMA PHILADELPHIA POSITIVO EN FASE CRÓNICA DE RECIENTE DIAGNÓS TICO.

Investigador Principal: JESUS ANTONIO MARTINEZ DOMINGUEZ

CA180-056

ESTUDIO ALEATORIZADO, EN DOBLE CIEGO, CONTROLADO CON PLACEBO Y MULTICÉNTRICO, DE CIPROFLOXACINO 32,5 MG EN POLVO SECO PARA INHALACIÓN DOS VECES AL DÍA EN ADMINISTRACIÓN INTERMITENTE, DURANTE 28 DÍAS CON OTROS 28 DE DESCANSO O DURANTE 14 DÍAS CON OTROS 14 DE DESCANSO, EN COMPARACIÓN CON PLACEBO, EN LA EVALUACIÓN DEL TIEMPO HASTA LA PRIMERA EXACERBACIÓN PULMONAR Y LA FRECUENCIA DE LAS EXACERBACIONES EN SUJETOS CON BRONQUIECTASIAS NO DEBIDAS A FIBROSIS QUÍSTICA.

Investigador Principal: ROSARIO MENÉNDEZ VILLANUEVA

BAYQ3939/15625

ESTUDIO FASE IIIB, MULTICENTRICO, ABIERTO DE NILOTINIB EN PACIENTES ADULTOS CON LMC PH+ DE NUEVO DIAGNOSTICO EN FASE CRONICA Y/O BCR-ABL POSITIVO.

Investigador Principal: JESUS ANTONIO MARTINEZ DOMINGUEZ

CAMN107EIC01

ESTUDIO DE FASE 3 ALEATORIZADO PARA EVALUAR LA SEGURIDAD Y LA ACTIVIDAD ANTIVIRAL DE REMDESIVIR (GS-5734TM) EN PARTICIPANTES CON INFECCIÓN MODERADA POR EL COVID-19 EN COMPARACIÓN CON EL TRATAMIENTO DE REFERENCIA.

Investigador Principal: ÁLVARO CASTELLANOS ORTEGA

GS-US-350-5774 . 2020

ESTUDIO DE FASE 3 ALEATORIZADO PARA EVALUAR LA SEGURIDAD Y LA ACTIVIDAD ANTIVIRAL DE REMDESIVIR (GS-5734TM) EN PARTICIPANTES CON INFECCIÓN GRAVE POR EL COVID-19.

Investigador Principal: ÁLVARO CASTELLANOS ORTEGA

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Investigador Principal: RAÚL MÉNDEZ OCAÑA

JR21/00051 . INSTITUTO DE SALUD CARLOS III . 2022

ESTUDIO RANDOMIZADO, CONTROLADO CON PLACEBO, DOBLE CIEGO, DE SEGURIDAD Y EFICACIA DEL FACTOR HUMANO RECOMBINANTE PARA EL CRECIMIENTO Y DESARROLLO DEL MEGACARIOCITO (PEGRHUMGDF) EN PACIENTES SOMETIDOS A QUIMIOTERAPIA DE INDUCCION POR LEUCEMIA MIELOIDE AGUDA.

Investigador Principal: MIGUEL ÁNGEL SANZ ALONSO

MGDF951025

ESTUDIO RANDOMIZADO, CONTROLADO CON PLACEBO, DOBLE CIEGO, DE SEGURIDAD Y EFICACIA DEL FACTOR HUMANO RECOMBINANTE PARA EL CRECIMIENTO Y DESARROLLO DEL MEGACARIOCITO (PEGRHUMGDF) EN PACIENTES SOMETIDOS A QUIMIOTERAPIA DE SEGUNDA INDUCCION Y CONSOLIDACION PO R LEUCEMIA MIELOIDE AGUDA DE NOVO.

Investigador Principal: MIGUEL ÁNGEL SANZ ALONSO

MGDF-951031

ESTUDIO ALEATORIZADO, CONTROLADO CON PLACEBO, DOBLE CIEGO, DE SEGURIDAD Y EFICACIA DEL FACTOR HUMANO RECOMBINANTE PARA EL CRECIMIENTO Y DESARROLLO DEL MAGACARIOCITO (PEG-RHUMGDF) EN PACIENTES SOMETIDOS A QUIMIOTERAPIA DE INDUCCIÓN POR LEUCEMIA MIELOIDE AGUDA DE NOVO.

Investigador Principal: MIGUEL ÁNGEL SANZ ALONSO

MGDF-970106

ESTUDIO ALEATORIZADO, CONTROLADO CON PLACEBO, DOBLE CIEGO, DE SEGURIDAD Y EFICACIA DEL FACTOR HUMANO RECOMBINANTE PARA EL CRECIMIENTO Y DESARROLLO DEL MAGACARIOCITO (PEG-RHUMGDF) EN PACIENTES SOMETIDOS A QUIMIOTERAPIA DE INDUCCION POR LEUCEMIA.

Investigador Principal: MIGUEL ÁNGEL SANZ ALONSO

MGDF-970107

ESTUDIO DE ESTIMACION COMPARATIVA PROSPECTIVO, MULTICENTRICO, ALEATORIO Y DOBLE CIEGO, PARA EVALUAR LA SEGURIDAD, LA TOLERABILIDAD Y LA EFICACIA DE L-749,345 FRENTE A LA CEFTRIAXONA SODICA EN EL TRATAMIENTO DE LAS INFECCIONES GRAVES NO COMPLICADAS DE LASVIAS RESPIRATORIAS INFERIORES DE INTENSIDAD LEVE O MODERADA EN ADULTOS.

Investigador Principal: MIGUEL JOSÉ PERPIÑA TORDERA

MSD749-002/0696

ESTUDIO PILOTO MULTICENTRICO FASE II DE TRATAMIENTO CON ARABINOSIDO DE CITOSINA POR VIA ORAL ASOCIADO AL INTERFERON ALFA-2B EN LOS PACIENTES CON LEUCEMIA MIELOIDE CRONICA PH-POSITIVA RESISTENTE AL INTERFERON.

Investigador Principal: MIGUEL ÁNGEL SANZ ALONSO

YNK-01/LMC-97

ESTUDIO ABIERTO, CONTROLADO, ALEATORIZADO CENTRALMENTE, ESTRATIFICADO, MULTINACIONAL Y MULTICENTRICO SOBRE LA EFICACIA, SEGURIDAD, Y COSTE DE DE LA CEFPIROMA (HR 810) FRENTE AL CEFTAZIDIMA EN EL TRATAMIENTO ANTIBIOTICO EMPIRICO DE PACIENTES NEUTROPENICOSFEBRILES CON SOSPECHA DE INFECCION BACTERIANA.

Investigador Principal: MIGUEL ÁNGEL SANZ ALONSO

HR810/4003

ESTUDIO CONTROLADO, DE AISGANACION ALEATORIA, DE DISEÑO ABIERTO, DE FASE III EN INDIVIDUOS CON LEUCEMIA MIELOIDE AGUDA DE MAL PRONOSTICO ASIGNADOS ALEATORIZAMENTE AL TRATAMIENTO CON SDZ PSC 833 + CITARABINA, MITOXANTRONA Y ETOPOSIDO (AME) O AME SOLA.

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PSCC301-E-00

ESTUDIO MULTICENTRICO, INTERNACIONAL, PROSPECTIVO, NO CONTROLADO, ABIERTO PARA EVALUAR LA SEGURIDAD Y EFICACIA DE LOS COMPRIMIDOS ORALES DE MIXIFLOXACINO 400 MG UNA VEZ AL DIA DURANTE 10 DIAS EN ETRATAMIENTO DE PACIENTES CON NEUMONIA ADQUIRIDA EN LA COMUNIDAD RESIESTENTE AL NEUMOCOCO.

Investigador Principal: MIGUEL JOSÉ PERPIÑA TORDERA

BAY-128039-100224

ESTUDIO ABIERTO MULTICÉNTRICO, DE ACCESO EXPANDIDO DE STI571, EN PACIENTES CON LEUCEMIA MIELOIDE CRÓNICA EN CRISIS BLÁSTICA LINFOIDE O MIELOIDE O CON LEUCEMIA MIELÓGENA AGUDA CROMOSOMA FILADELFIA POSITIVO.

Investigador Principal: MIGUEL ÁNGEL SANZ ALONSO

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PROTOCOLO DE ACCESO EXPANDIDO DE STI571, EN PACIENTES CON LEUCEMIA MIELOIDE CRÓNICA EN FASE ACELERADA O CON LEUCEMIA LINFOBLÁSTICA AGUDA CROMOSOMA PH POSITIVO.

Investigador Principal: MIGUEL ÁNGEL SANZ ALONSO

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EFICACIA Y SEGURIDAD DE LEVOFLOXACINO EN EL TRATAMIENTO DE LA NEUMONIA ADQUIRIDA EN LA COMUNIDAD.

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Investigador Principal: MIGUEL ÁNGEL SANZ ALONSO

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Investigador Principal: ROSARIO MENÉNDEZ VILLANUEVA

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Investigador Principal: MIGUEL ÁNGEL SANZ ALONSO

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ESTUDIO ALEATORIZADO CONTROLADO CON PLACEBO, PARA EVALUAR LA EFICACIA Y SEGURIDAD DEL TRATAMIENTO CON AMG531 EN SUJETOS TROMBOCITOPENICOS CON PURPURA TROMBOCITOPENICA INMUNE (IDIOPATICA) (PTI) SIN ESPLENECTOMIA PREVIA.

Investigador Principal: MIGUEL ÁNGEL SANZ ALONSO

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Investigador Principal: MIGUEL ÁNGEL SANZ ALONSO

BURKIMAB007/04

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Investigador Principal: ROSARIO MENÉNDEZ VILLANUEVA

REP-FAR-005

UN ESTUDIO DE FASE II DE TAMIBAROTENO EN PACIENTES CON LEUCEMIA PROMIELOCITICA AGUDA QUE HAYAN RECIBIDO TERAPIA PREVIA CON ATRA Y TRIOXIDO DE ARSENICO (STAR-1)

Investigador Principal: MIGUEL ÁNGEL SANZ ALONSO

INNO-507-P2

ESTUDIO EN FASE 3, MULTICÉNTRICO, ALEATORIZADO, DOBLE CIEGO Y COMPARATIVO PARA EVALUAR LA SEGURIDAD Y LA EFICACIA DE CEFTAROLINA EN COMPARACIÓN CON CEFTRIAXONA, CON CLARITROMICINA COMO MEDICACIÓN ADYUVANTE, EN EL TRATAMIENTO DE LA NEUMONÍA ADQUIRIDA EN LA COMUNIDAD.

Investigador Principal: ROSARIO MENÉNDEZ VILLANUEVA

P903-08A1

UTILIDAD DEL TRATAMIENTO ANTIBIOTICO EN LAS AGUDIZACIONES DE LA ENFERMEDAD PULMONAR OBSTRUCTIVA CRONICA (EPOC) SIN PURULENCIA EN EL ESPUTO: ENSAYO CLINICO, ALEATORIZADO, CONTROLADO, Y DOBLE CIEGO DE EFICACIA Y SEGURIDAD.

Investigador Principal: ROSARIO MENÉNDEZ VILLANUEVA

AEPOC . 2010

OFATUMUMAB COMO PARTE DEL REGIMEN DE ACONDICIONAMIENTO DE INTENSIDAD REDUCIDA PARA PACIENTES CON LEUCEMIA LINFATICA CRONICA DE ALTO RIESGO QUE RECIBEN UN TRASPLANTE ALOGENICO DE PROGENITORES HEMATOPOYETICOS: UN ESTUDIO PILOTO CONJUNTO DEL GRUPO ESPAÑOL DE TRASPLANTE HEMATOPOYETICO Y TERAPIA CELULAR (GETH) Y DEL GRUPO ESPAÑOL DE LEUCEMIA LINFATICA CRONICA (GELLC)

Investigador Principal: JAIME SANZ CABALLER

GETH-CLL4 . 2011

ESTUDIO DE FASE 3, MULTICÉNTRICO, ALEATORIZADO, CON DOBLE ENMASCARAMIENTO Y CONTROL ACTIVO, DE GRUPOS PARALELOS, CON FASE ABIERTA DE AMPLIACIÓN, DESTINADO A EVALUAR LA EFICACIA Y LA INOCUIDAD DE E5501 ADMINISTRADO POR VÍA ORAL EN COMPARACIÓN CON ELTROMBOP AG EN ADULTOS AQUEJADOS DE TROMBOCITOPENIA INMUNITARIA CRÓNICA (PÚRPURA TROMBOCITOPÉNICA IDIOPÁTICA)

Investigador Principal: VICENTE JAVIER PALAU PEREZ

E5501-G000-305

ESTUDIO DE FASE III, ALEATORIZADO Y DOBLE CIEGO DE FEBUXOSTAT PARA LA PREVENCIÓN DEL SÍNDROME DE LISIS TUMORAL EN LAS NEOPLASIAS MALIGNAS HEMATOLÓGICAS EN COMPARACIÓN CON ALOPURINOL.

Investigador Principal: PAU MONTESINOS FERNÁNDEZ

FLO-01

ESTUDIO DE FASE II ABIERTO Y MULTICÉNTRICO PARA EVALUAR LA TOLERABILIDAD, SEGURIDAD, EFICACIA Y FARMACOCINÉTICA/FARMACODINAMIA (FC/FD) DE POL7080 EN EL TRATAMIENTO DE PACIENTES CON EXACERBACIÓN AGUDA DE LA BRONQUIECTASIA NO ASOCIADA A FIBROSIS QUÍSTICA, C AUSADA POR INFECCIÓN POR PSEUDOMONAS AERUGINOSA QUE REQUIERE TRATAMIENTO INTRAVENOSO.

Investigador Principal: ROSARIO MENÉNDEZ VILLANUEVA

POL7080-002

REGISTRO DE PACIENTES CON LEUCEMIA MIELOIDE CRÓNICA CON ALTA PROBABILIDAD DE ALCANZAR RESPUESTA MOLECULAR COMPLETA.

Investigador Principal: JESUS ANTONIO MARTINEZ DOMINGUEZ

FMS-LMC-2012-01

PNEUMOCOCCAL PNEUMONIA EPIDEMIOLOGY, URINE SEROTYPING, AND MENTAL OUTCOMES. THE PNEUMO STUDY IN EUROPE.

Investigador Principal: ROSARIO MENÉNDEZ VILLANUEVA

ESTUDIO PNEUMO . 2020

REGISTRO DE LA SOCIEDAD ESPAÑOLA DE NEUMOLOGIA Y CIRUGIA TORACICA DE PACIENTES CON COVID-19 (RECOVID).

Investigador Principal: ROSARIO MENÉNDEZ VILLANUEVA

UIC-IBU-2020-03 . 2020

Etiología de la neumonía adquirida en la comunidad tras la pandemia COVID-19 en la era de las técnicas microbiológicas moleculares. Estudio multicéntrico nacional.

Investigador Principal: ROSARIO MENÉNDEZ VILLANUEVA

PI22/01712 . INSTITUTO DE SALUD CARLOS III . 2023

CEFTO-REALLIFE: uso de ceftobiprole en vida real en una cohorte hospitalaria multicéntrica española.

Investigador Principal: ROSARIO MENÉNDEZ VILLANUEVA

FIB-CEF-2021-01 . 2022

Estudio de prueba de concepto (PoC), aleatorizado, doble ciego, controlado con placebo y de grupos paralelos para evaluar la eficacia, seguridad y tolerabilidad de itepekimab en participantes con bronquiectasias no debidas a fibrosis quística.

Investigador Principal: RAÚL MÉNDEZ OCAÑA

ACT18018 . 2024

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