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The Mutational Landscape of Acute Promyelocytic Leukemia Reveals an Interacting Network of Co-Occurrences and Recurrent Mutations
Fecha de publicación:
Autores de IIS La Fe
Participantes ajenos a IIS La Fe
- Carbonell Caballero, J.
- García Alonso, L.
- Jiménez Almazán, J.
- Vidal, E.
Grupos
Abstract
Preliminary Acute Promyelocytic Leukemia (APL) whole exome sequencing (WES) studies have identified a huge number of somatic mutations affecting more than a hundred different genes mainly in a non-recurrent manner, suggesting that APL is a heterogeneous disease with secondary relevant changes not yet defined. To extend our knowledge of subtle genetic alterations involved in APL that might cooperate with PML/RARA in the leukemogenic process, we performed a comprehensive analysis of somatic mutations in APL combining WES with sequencing of a custom panel of targeted genes by next-generation sequencing. To select a reduced subset of high confidence candidate driver genes, further in silico analysis were carried out. After prioritization and network analysis we found recurrent deleterious mutations in 8 individual genes (STAG2, U2AF1, SMC1A, USP9X, IKZF1, LYN, MYCBP2 and PTPN11) with a strong potential of being involved in APL pathogenesis. Our network analysis of multiple mutations provides a reliable approach to prioritize genes for additional analysis, improving our knowledge of the leukemogenesis interactome. Additionally, we have defined a functional module in the interactome of APL. The hypothesis is that the number, or the specific combinations, of mutations harbored in each patient might not be as important as the disturbance caused in biological key functions, triggered by several not necessarily recurrent mutations.
Datos de la publicación
- ISSN/ISSNe:
- 1932-6203, 1932-6203
- Tipo:
- Article
- Páginas:
- -
- Factor de Impacto:
- 1,236 SCImago ℠
Plos One PUBLIC LIBRARY SCIENCE
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ESTUDIO FASE I/II NACIONAL, ABIERTO, MULTICENTRICO, DE PANOBINOSTAT EN COMBINACION CON IDARRUBICINA Y CITARABINA EN PACIENTES DE EDAD IGUAL O SUPERIOR A 65 AÑOS CON LEUCEMIA MIELOBLASTICA AGUDA (LMA) DE NUEVO DIAGNOSTICO
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PANOBIDARA . 2009
ESTUDIO FASE 3, ALEATORIZADO, DOBLE CIEGO Y CONTROLADO CON PLACEBO PARA COMPARAR LA EFICACIA Y LA SEGURIDAD DE AZACITIDINA ORAL MÁS EL MEJOR TRATAMIENTO DE APOYO FRENTE AL MEJOR TRATAMIENTO DE APOYO COMO TERAPIA DE MANTENIMIENTO EN PACIENTES CON LEUCEMIA MIELOIDE AGUDA EN REMISIÓN COMPLETA.
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CC-486-AML-001 . 2013
ESTUDIO FASE III, PROSPECTIVO, ALEATORIZADO, ABIERTO, CON DOS BRAZOS DE TRATAMIENTO, PARA EVALUAR LA TASA DE REMISIÓN LIBRE DE TRATAMIENTO (RLT) EN PACIENTES CON LMC CROMOSOMA FILADELFIA POSITIVO, DESPUÉS DE DOS DURACIONES DISTINTAS DE TRATAMIENTO DE CONSOLIDACIÓN CON NILOTINIB 300 MG BID.
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CAMN107AIC05 . 2013
ESTUDIO ABIERTO Y ALEATORIZADO DE FASE III SOBRE QUIZARTINIB (AC220) EN MONOTERAPIA FRENTE A LA QUIMIOTERAPIA DE RESCATE EN PACIENTES CON LEUCEMIA MIELOIDE AGUDA (LMA) FLT3-ITD POSITIVA RESISTENTE O EN RECAÍDA TRAS EL TRATAMIENTO DE PRIMERA LÍNEA CON O SI N CONSOLIDACIÓN CON TRASPLANTE DE CÉLULAS MADRE HEMATOPOYÉTICAS (TCMH).
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AC220-007 . 2014
ESTUDIO FASE III, MULTICÉNTRICO, ALEATORIZADO, ABIERTO DE AZACITIDINA (VIDAZA®) FRENTE A FLUDARABINA Y CITARABINA (ESQUEMA FLUGA) EN PACIENTES ANCIANOS CON LEUCEMIA MIELOIDE AGUDA DE NUEVO DIAGNÓSTICO.
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FLUGAZA . 2014
ESTUDIO FASE 2/3 ALEATORIZADO DE DACOGEN® (DECITABINA) MÁS JNJ-56022473 (ANTI-CD123) FRENTE A DACOGEN (DECITABINA) EN MONOTERAPIA, EN PACIENTES CON LEUCEMIA MIELOIDE AGUDA (LMA) QUE NO SON CANDIDATOS A RECIBIR QUIMIOTERAPIA INTENSIVA.
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56022473AML2002 . 2015
PRIMER ESTUDIO EN PERSONAS CON MEN1112, UN ANTICUERPO MONOCLONAL DIRIGIDO A CD157 EN LEUCEMIA MIELOIDE AGUDA EN RECAÍDA O REFRACTARIA.
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ARMY-1 . 2015
ENSAYO DE FASE III, MULTICÉNTRICO, DOBLE CIEGO, ALEATORIZADO, CONTROLADO CON PLACEBO, DE IDASANUTLIN, UN ANTAGONISTA DE MDM2, CON CITARABINA FRENTE A CITARABINA MÁS PLACEBO EN PACIENTES CON LEUCEMIA MIELOIDE AGUDA (LMA) EN RECAÍDA O REFRACTARIA.
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WO29519 . 2016
ESTUDIO CLÍNICO DE FASE II/III, ALEATORIZADO Y PROSPECTIVO, COMPARATIVO DE BEGEDINA® FRENTE AL TRATAMIENTO CONVENCIONAL EN LA ENFERMEDAD INJERTO CONTRA HUÉSPED AGUDA RESISTENTE A LOS ESTEROIDES.
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ADN011
ESTUDIO MULTICÉNTRICO, ALEATORIZADO, DOBLE CIEGO, FASE III DE REVLIMID (LENALIDOMINA) VERSUS PLACEBO EN PACIENTES CON SÍNDROME MIELODISPLÁSICO DE BAJO RIESGO (IPSS BAJO E INTEMEDIO-1) CON ALTERACIÓN EN 5Q- Y ANEMIA SIN NECESIDADES TRANSFUSIONALES.
Investigador Principal: GUILLERMO SANZ SANTILLANA
SINTRA-REV . 2010
ESTUDIO POST-AUTORIZACIÓN DE SEGURIDAD (EPAS) PROSPECTIVO, NO INTERVENCIONISTA, DISEÑADO COMO REGISTRO DE ENFERMEDAD DE PACIENTES CON SÍNDROMES MIELODISPLÁSICOS (SMD) DE BAJO RIESGO (IPSS BAJO E INTERMEDIO-1) CON DELECCIÓN 5Q AISLADA Y DEPENDENCIA TRANSFUSIONAL.
Investigador Principal: GUILLERMO SANZ SANTILLANA
CEL-LEN-2014-01 . 2015
ESTUDIO FASE III, MULTICÉNTRICO, ALEATORIZADO, DOBLE CIEGO, CONTROLADO CON PLACEBO DE ELTROMBOPAG O PLACEBO EN COMBINACIÓN CON AZACITIDINA EN SUJETOS CON SÍNDROMES MIELODISPLÁSICOS (SMD) DE RIESGO INTERMEDIO-1, INTERMEDIO-2 O ALTO SEGÚN EL IPSS. SUPPORT: A STUDY OF ELTROMBOPAG IN MYELODYSPLASTIC SYNDROMES RECEIVING AZACITIDINE.
Investigador Principal: GUILLERMO SANZ SANTILLANA
TRC112121 . 2014
ENSAYO CLINICO ABIERTO, MULTICENTRICO, DE ACCESO EXPANDIDO DE INC424 EN PACIENTES CON MIELOFIBROSIS PRIMARIA (PMF) O MIELOFIBROSIS SECUNDARIA A POLICITEMIA (PPV MF) O MIELOFIBROSIS SECUNDARIA A TROMBOCITEMIA ESENCIAL (PET-MF).
Investigador Principal: JAIME SANZ CABALLER
CINC424A2401 . 2011
ESTUDIO FASE II, MULTICÉNTRICO, ABIERTO, ALEATORIZADO PARA EVALUAR LA SEGURIDAD Y LA EFICACIA DE DOS POSOLOGÍAS DISTINTAS DE LDE225 ORAL, EN PACIENTES ADULTOS CON LEUCEMIA AGUDA REFRACTARIA/EN RECIDIVA O EN PACIENTES CON EDAD AVANZADA SIN TRATAMIENTO PREVIO.
Investigador Principal: MIGUEL ÁNGEL SANZ ALONSO
CLDE225X2203 . 2013
ESTUDIO DE FASE 3, ALEATORIZADO Y ABIERTO QUE INVESTIGA LA EFICACIA DEL ANTICUERPO BITE® BLINATUMOMAB EN COMPARACIÓN CON EL TRATAMIENTO ESTÁNDAR DE QUIMIOTERAPIA EN SUJETOS ADULTOS CON LEUCEMIA LINFOBLÁSTICA AGUDA (LLA) DE PRECURSORES B RECIDIVANTE/REFRACTARIA (ESTUDIO TOWER).
Investigador Principal: MIGUEL ÁNGEL SANZ ALONSO
00103311 . 2014
ENSAYO CLÍNICO DE FASE III, ALEATORIZADO, DOBLE CIEGO, CONTROLADO, PARALELO, DE VOLASERTIB INTRAVENOSO EN COMBINACION CON DOSIS BAJAS DE CITARABINA SUBCUTÁNEA VS. PLACEBO + DOSIS BAJAS DE CITARABINA EN PACIENTES ? 65 AÑOS CON LEUCEMIA MIELOIDE AGUDA PREVIAMENTE NO TRATADA, QUE NO PUEDAN RECIBIR TRATAMIENTO INTENSIVO DE INDUCCIÓN DE LA REMISIÓN.
Investigador Principal: MIGUEL ÁNGEL SANZ ALONSO
1230.14 . 2013
ESTUDIO DE FASE III, MULTICENTRICO. ALEATORIZADO, ABIERTO DE AZACITIDINA (VIDAZA R) FRENTE A LAS PAUTAS CONVENCIONALES PARA EL TRATAMIENTO DE ANCIANOS CON LEUCEMIA MIELOIDE AGUDA DE NUEVO DIAGNOSTICO.
Investigador Principal: PAU MONTESINOS FERNÁNDEZ
AZA-AML-001 . 2010
ESTUDIO DE FASE 3 ALEATORIZADO DE LA EFICACIA Y LA SEGURIDAD DE POSACONAZOL EN COMPARACIÓN CON VORICONAZOL PARA EL TRATAMIENTO DE LA ASPERGILOSIS INVASIVA EN ADULTOS Y ADOLESCENTES.
Investigador Principal: MIGUEL ÁNGEL SANZ ALONSO
MK-5592-069 (P06200) . 2013
ESTUDIO DE FASE IB DE DETERMINACION DE DOSIS DE PANOBINOSTAT (LBH589) POR VIA ORAL EN COMBINACION CON UN TRATAMIENTO DE INDUCCION CON IDARUBICINA Y CITARABINA Y CON UN TRATAMIENTO DE CONSOLIDACION CON DOSIS ALTA DE CITARABINA EN PACIENTES ADULTOS DE EDAD IGUAL O MENOR A 65 AÑOS CON LEUCEMIA MIELOIDE AGUDA (LMA)
Investigador Principal: MIGUEL ÁNGEL SANZ ALONSO
CLBH589G2101 . 2010
MANEJO CLINICO DE LA PURPURA TROMBOCITOPENICA IDIOPATICA CRONICA EN ESPAÑA
Investigador Principal: MIGUEL ÁNGEL SANZ ALONSO
04107 . 2008
ESTUDIO OBSERVACIONAL EUROPEO DE DASATINIB (SPRYCEL) EN EL TRATAMIENTO DE PACIENTES CON LEUCEMIA MIELOIDE CRONICA, RESISTENTES E INTOLERANTES A IMATINIB
Investigador Principal: JESUS ANTONIO MARTINEZ DOMINGUEZ
CA180211 . 2009
ESTUDIO ALEATORIZADO FASE III DE ELACITARABINA COMPARADA CON LA ELECCION DEL INVESTIGADOR EN PACIENTES CON LEUCEMIA MIELOIDE AGUDA EN ESTADIO AVANZADO.
Investigador Principal: PAU MONTESINOS FERNÁNDEZ
CP4055-306 . 2010
ENSAYO CLINICO MULTICENTRICO, PROSPECTIVO, ABIERTO, DE UN SOLO GRUPO, DE FASE II PARA ANALIZAR LA TERAPIA DE INDUCCION CON UNA COMBINACION DE CLOFARABINA Y DOSIS BAJAS DE CITARABINA SEGUIDO DE TERAPIA DE CONSOLIDACION CON CLOFARABINA Y DOSIS BAJAS DE CIT ARABINA PARA EL TRATAMIENTO DE PACIENTES DE EDAD MAYOR O IGUAL A 60 AÑOS CON LMA
Investigador Principal: FEDERICO MOSCARDO GARCIA
AML-CLOFARA-CA09
ENSAYO CLÍNICO EN FASE II, ALEATORIZADO Y SIN ENMASCARAMIENTO SOBRE EL INHIBIDOR SELECTIVO DE LA EXPORTACIÓN NUCLEAR (SINE) SELINEXOR (KPT-330) COMPARADO CON UNA DETERMINADA OPCIÓN TERAPEUTICA ESCOGIDA POR EL MÉDICO EN PACIENTES DE 60 O MAS AÑOS DE EDAD C ON LEUCEMIA MIELOIDE AGUDA (LMA) RECIDIVANTE O RESISTENTE AL TRATAMIENTO QUE NO SON APTOS PARA LA QUIMIOTERAPIA INTENSIVA Y/O EL TRANSPLANTE.
Investigador Principal: PAU MONTESINOS FERNÁNDEZ
KCP-330-008 . 2015
ESTUDIO ALEATORIZADO DE FASE III CON SAPACITABINA POR VÍA ORAL EN ANCIANOS CON DIAGNÓSTICO RECIENTE DE LEUCEMIA MIELOIDE AGUDA.
Investigador Principal: PAU MONTESINOS FERNÁNDEZ
CYC682-12 . 2014
PONATINIB Y QUIMIOTERAPIA EN ADULTOS JÓVENES CON LEUCEMIA AGUDA LINFOBLÁSTICA CON CROMOSOMA FILADELFIA DE NUEVO DIAGNOSTICO.
Investigador Principal: PAU MONTESINOS FERNÁNDEZ
PONALFIL . 2016
ESTUDIO DE CARACTERIZACIÓN FARMACOLÓGICA EX VIVO DE TRATAMIENTOS EN HEMOPATÍAS MALIGNA, MEDIANTE EL USO DE LA PLATAFORMA AUTOMATIZADA DE CITOMETRÍA DE FLUJO EXVITECH.
Investigador Principal: PAU MONTESINOS FERNÁNDEZ
VIVIA-PMMH-02 . 2014
ENSAYO CONTROLADO DE FASE IIB MULTICÉNTRICO, ABIERTO, ALEATORIZADO, PARA EVALUAR LA EFICACIA Y LA TOLERANCIA DE GRASPA (L-ASPARAGINASA ENCAPSULADA EN GLÓBULOS ROJOS) MÁS CITARABINA DE BAJA DOSIS, COMPARADA CON CITARABINA DE BAJA DOSIS SOLA, EN EL TRATAMIENTO DE PACIENTES CON DIAGNÓSTICO RECIENTE DE LEUCEMIA MIELOIDE AGUDA (LMA) MAYORES DE 65 AÑOS NO APTOS PARA QUIMIOTERAPIA INTENSIVA.
Investigador Principal: MIGUEL ÁNGEL SANZ ALONSO
GRASPA-AML-2012-01 . 2014
ESTUDIO DE FASE III, MULTICÉNTRICO, ALEATORIZADO Y CONTROLADO PARA EVALUAR LA EFICACIA Y LA SEGURIDAD DE ON 01910.NA AL ADMINISTRARSE MEDIANTE INFUSIÓN INTRAVENOSA CONTINUA DE 72 HORAS EN SEMANAS ALTERNAS A PACIENTES CON SÍNDROME MIELODISPLÁSICO CON EXCES O DE BLASTOCITOS QUE PRESENTAN RECURRENCIA TRAS EL TRATAMIENTO CON AZACITIDINA O DECITABINA, O RESISTENCIA O INTOLERANCIA A DICHOS FÁRMACOS.
Investigador Principal: GUILLERMO SANZ SANTILLANA
04-21
ESTUDIO DE SEGURIDAD POSTCOMERCIALIZACION, OBSERVACIONAL Y NO- INTERVENCIONISTA, DE SUJETOS TRATADOS CON LENALIDOMIDA.
Investigador Principal: ISIDRO JARQUE RAMOS
CC-5013-PASS-001 . 2012
ESTUDIO FASE 3, MULTICENTRICO, ALEATORIZADO, ABIERTO Y DE GRUPOS PARALELOS PARA VALORAR LA EFICACIA Y SEGURIDAD DE LENALIDOMIDA (REVLIMID) FRENTE A CLORAMBUCILO COMO TERAPIA DE PRIMERA LINEA EN PACIENTES ANCIANOS CON LEUCEMIA LINFOCITICA CRONICA DE CELULA S B NO TRATADOS PREVIAMENTE (ENSAYO ORIGIN).
Investigador Principal: MIGUEL ÁNGEL SANZ ALONSO
CC-5013-CLL-008 . 2010
ESTUDIO PILOTO FASE II MULTICÉNTRICO, NO ALEATORIZADO PARA EVALUAR LA EFICACIA Y SEGURIDAD DE DASATINIB TRAS TRASPLANTE ALOGÉNICO DE PROGENITORES HEMOPOYÉTICOS EN PACIENTES CON LEUCEMIA AGUDA LINFOBLÁSTICA FILADELFIA POSITIVA (BCR-ABL+) DE NOVO.
Investigador Principal: GUILLERMO SANZ SANTILLANA
DASA-TRAS . 2010
OFATUMUMAB COMO PARTE DEL REGIMEN DE ACONDICIONAMIENTO DE INTENSIDAD REDUCIDA PARA PACIENTES CON LEUCEMIA LINFATICA CRONICA DE ALTO RIESGO QUE RECIBEN UN TRASPLANTE ALOGENICO DE PROGENITORES HEMATOPOYETICOS: UN ESTUDIO PILOTO CONJUNTO DEL GRUPO ESPAÑOL DE TRASPLANTE HEMATOPOYETICO Y TERAPIA CELULAR (GETH) Y DEL GRUPO ESPAÑOL DE LEUCEMIA LINFATICA CRONICA (GELLC)
Investigador Principal: JAIME SANZ CABALLER
GETH-CLL4 . 2011
PROTOCOLO ASISTENCIAL PARA EL TRATAMIENTO DE PRIMERA LÍNEA ADAPTADO AL RIESGO DE LA LEUCEMIA MIELOBLÁSTICA AGUDA EN PACIENTES DE EDAD MENOR O IGUAL A 65 AÑOS.
Investigador Principal: PAU MONTESINOS FERNÁNDEZ
PET-IDA-2011-01 . 2014
OFATUMUMAB COMO PARTE DEL RÉGIMEN DE ACONDICIONAMIENTO DE INTENSIDAD REDUCIDA (RIC) EN PACIENTES CON LINFOMA B NO-HODGKIN DE ALTO RIESGO QUE RECIBEN UN TRANSPLANTE ALOGÉNICO DE PROGENITORES HEMATOPOYÉTICOS.
Investigador Principal: ISIDRO JARQUE RAMOS
GELTAMO-O-CRT-2011 . 2012
ESTUDIO DE FASE III, ALEATORIZADO Y DOBLE CIEGO DE FEBUXOSTAT PARA LA PREVENCIÓN DEL SÍNDROME DE LISIS TUMORAL EN LAS NEOPLASIAS MALIGNAS HEMATOLÓGICAS EN COMPARACIÓN CON ALOPURINOL.
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INDUCCIÓN A LA REMISIÓN CON ATRA + IDARUBICINA (AIDA). CONSOLIDACIÓN ADAPTADA AL RIESGO CON LIGERA REDUCCIÓN DE ANTRACICLINAS Y ADICIÓN DE ARA-C EN RIESGO INTERMEDIO Y ALTO. MANTENIMIENTO CON ATRA + DOSIS BAJAS DE QUIMIOTERAPIA (METOTREXATE + MERCAPTOPURI NA)
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ESTUDIO DE LA TOXICIDAD EN PLASMA INDUCIDA POR AGENTES QUIMIOTERÁPICOS.
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REGISTRO DE PACIENTES CON LEUCEMIA MIELOIDE CRÓNICA CON ALTA PROBABILIDAD DE ALCANZAR RESPUESTA MOLECULAR COMPLETA.
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ESTUDIO FASE I/II DE INFUSIÓN DE PROGENITORES HEMATOPOYÉTICOS AUXILIARES DURANTE LA FASE DE CONSOLIDACIÓN EN PACIENTES DE EDAD MENOR A 65 AÑOS CON LEUCEMIA MIELOBLÁSTICA AGUDA EN PRIMERA REMISIÓN COMPLETA.
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ESTUDIO OBSERVACIONAL PROSPECTIVO MULTICÉNTRICO ALEATORIZADO PARA COMPARAR EL TRASPLANTE DE SANGRE DE CORDÓN UMBILICAL DE DONANTE NO EMPARENTADO VS TRASPLANTE DE PROGENITORES HEMATOPOYÉTICO DE DONANTE FAMILIAR HAPLOIDÉNTICO EN PACIENTES ADULTOS CON NEOPLA SIAS HEMATOLÓGICAS.
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Ibáñez M,Carbonell J,García L,Such E,Jiménez J,Vidal E,Barragán E,López M,LLop M,Martín I,Gómez I,Montesinos P,Sanz MA,Dopazo J,Cervera J. The Mutational Landscape of Acute Promyelocytic Leukemia Reveals an Interacting Network of Co-Occurrences and Recurrent Mutations. PLoS One. 2016. 11. (2):e0148346. IF:2,806. (1).