Portal de investigación
Bypassing hazard of housekeeping genes: their evaluation in rat granule neurons treated with cerebrospinal fluid of multiple sclerosis subjects
Fecha de publicación:
Autores de IIS La Fe
Participantes ajenos a IIS La Fe
- Mathur D
- Urena-Peralta JR
- Lopez-Rodas G
- Burgal-Marti M
Grupos
Abstract
Gene expression studies employing real-time PCR has become an intrinsic part of biomedical research. Appropriate normalization of target gene transcript(s) based on stably expressed housekeeping genes is crucial in individual experimental conditions to obtain accurate results. In multiple sclerosis (MS), several gene expression studies have been undertaken, however, the suitability of housekeeping genes to express stably in this disease is not yet explored. Recent research suggests that their expression level may vary under different experimental conditions. Hence it is indispensible to evaluate their expression stability to accurately normalize target gene transcripts. The present study aims to evaluate the expression stability of seven housekeeping genes in rat granule neurons treated with cerebrospinal fluid of MS patients. The selected reference genes were quantified by real time PCR and their expression stability was assessed using GeNorm and NormFinder algorithms. GeNorm identified transferrin receptor (Tfrc) and microglobulin beta-2 (B2m) the most stable genes followed by ribosomal protein L19 (Rp119) whereas -actin (ActB) and glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase (Gapdh) the most fluctuated ones in these neurons. NormFinder identified Tfrc as the best invariable gene followed by B2m and Rp119. ActB and Gapdh were the least stable genes as analyzed by NormFinder algorithm. Both methods reported Tfrc and B2m the most stably expressed genes and Gapdh the least stable one. Altogether our data demonstrate the significance of pre-validation of housekeeping genes for accurate normalization and indicates Tfrc and B2m as best endogenous controls in MS. ActB and Gapdh are not recommended in gene expression studies related to current one.
Datos de la publicación
- ISSN/ISSNe:
- 1662-5102, 1662-5102
- Tipo:
- Article
- Páginas:
- 375-375
- Factor de Impacto:
- 2,260 SCImago ℠
- Cuartil:
- Q1 SCImago ℠
FRONTIERS IN CELLULAR NEUROSCIENCE FRONTIERS MEDIA SA
Citas Recibidas en Web of Science: 8
Documentos
- No hay documentos
Filiaciones
Keywords
- housekeeping genes; multiple sclerosis; normalization; GeNorm; NormFinder
Proyectos asociados
PROYECTO CAIBER
CAI08/01/0061 . INSTITUTO DE SALUD CARLOS III; FUNDACIÓN PARA LA INVESTIGACIÓN DEL HOSPITAL UNIVERSITARIO LA FE DE LA COMUNIDAD VALENCIANA . 2009
RED DE BIOBANCOS (BIOBANCOS)
RD09/0076/00021 . INSTITUTO DE SALUD CARLOS III; FUNDACIÓN PARA LA INVESTIGACIÓN DEL HOSPITAL UNIVERSITARIO LA FE DE LA COMUNIDAD VALENCIANA . 2010
PATRONES DE RM CEREBRAL Y MEDULAR EN RELACION CON LA PRESENCIA DE AUTOANTIGENOS NEURONALES RECONOCIDOS POR INMUNOGLOBULINAS M PRESENTES EN EL LIQUIDO CEFALORRAQUIDEO DE PACIENTES DE ESCLEROSIS MULTIPLE.
Investigador Principal: ISABEL BOSCÁ BLASCO
MERCK SERONO DR. CASANOVA . ALMIRALL S.A; FUNDACIÓN BIOGEN IDEC; MERCK S.L.U; FUNDACIÓN PARA LA INVESTIGACIÓN DEL HOSPITAL UNIVERSITARIO LA FE DE LA COMUNIDAD VALENCIANA . 2010
RED ESPAÑOLA DE ESCLEROSIS MULTIPLE
RD12/0032/0019 . INSTITUTO DE SALUD CARLOS III; FUNDACIÓN PARA LA INVESTIGACIÓN DEL HOSPITAL UNIVERSITARIO LA FE DE LA COMUNIDAD VALENCIANA . 2012
FENOTIPO CLÍNICO Y FISIOPATOGENIA DE LOS PROCESOS DESMIELINIZANTES DEL SISTEMA NERVIOSO CENTRAL DEBIDOS A HIPERMUTACIONES SOMÁTICAS.
Investigador Principal: BONAVENTURA CASANOVA ESTRUCH
PI13/00663 . INSTITUTO DE SALUD CARLOS III . 2014
IMPLEMENTACIÓN Y AUTOMATIZACIÓN DE LAS MEDIDAS DE ATROFIA CEREBRAL Y DE MÉDULA CERVICAL EN PRÁCTICA CLÍNICA (LOCALIZACIÓN, GRADO Y EVOLUCIÓN DE LA ATROFIA EN PACIENTES CON ESCLEROSIS MÚLTIPLE)
Investigador Principal: BONAVENTURA CASANOVA ESTRUCH
2013_0423_CRC_CASANOVA . FUNDACION GENZYME . 2014
ESTUDIO MULTICÉNTRICO, ABIERTO, CON UN ÚNICO GRUPO QUE EVALÚA LA SEGURIDAD A LARGO PLAZO, LA TOLERABILIDAD Y LA EFICACIA DE FINGOLIMOD 0,5 MG (FTY720) ADMINISTRADO POR VÍA ORAL UNA VEZ AL DÍA EN PACIENTES CON ESCLEROSIS MÚLTIPLE.
Investigador Principal: BONAVENTURA CASANOVA ESTRUCH
CFTY720D2399 . 2010
ESTUDIO MULTICÉNTRICO, ALEATORIZADO, DOBLE CIEGO, DE GRUPOS PARALELOS, CONTROLADO CON PLACEBO, CON DURACIÓN VARIABLE DEL TRATAMIENTO, QUE EVALÚA LA EFICACIA Y SEGURIDAD DE SIPONIMOD (BAF312) EN PACIENTES CON ESCLEROSIS MÚLTIPLE SECUNDARIA PROGRESIVA SEGUIDO POR UNA EXTENSIÓN DEL TRATAMIENTO EN ABIERTO DE BAF312.
Investigador Principal: BONAVENTURA CASANOVA ESTRUCH
CBAF312A2304 . 2013
ESTUDIO EPIDEMIOLÓGICO RETROSPECTIVO PARA EL ANÁLISIS DE LA ACTIVIDAD CLÍNICA Y RADIOLÓGICA DE LA ENFERMEDAD EN PACIENTES CON ESCLEROSIS MÚLTIPLE RECURRENTE-REMITENTE TRAS LA RETIRADA DE NATALIZUMAB POR PRÁCTICA CLÍNICA HABITUAL.
Investigador Principal: BONAVENTURA CASANOVA ESTRUCH
BIO-NAT-2014-01 . 2015
ESTUDIO POSTAUTORIZACIÓN DE SEGURIDAD, PROSPECTIVO, MULTICÉNTRICO Y OBSERVACIONAL PARA EVALUAR EL PERFIL DE SEGURIDAD A LARGO PLAZO DEL TRATAMIENTO CON LEMTRADA® (ALEMTUZUMAB) EN PACIENTES CON FORMAS RECIDIVANTES DE ESCLEROSIS MÚLTIPLE.
Investigador Principal: BONAVENTURA CASANOVA ESTRUCH
SAN-ALE-2015-01 . 2016
ESTUDIO MULTINACIONAL, MULTICÉNTRICO, ALEATORIZADO, DOBLE CIEGO, CON GRUPOS PARALELOS Y CONTROLADO CON PLACEBO PARA EVALUAR LA EFICACIA, LA SEGURIDAD Y LA TOLERABILIDAD DE LA ADMINISTRACIÓN ORAL UNA VEZ AL DÍA DE LAQUINIMOD (0,6 O 1,5 MG) EN PACIENTES C O N ESCLEROSIS MÚLTIPLE PROGRESIVA PRIMARIA (EMPP).
Investigador Principal: BONAVENTURA CASANOVA ESTRUCH
TV5600-CNS-20006 . 2015
FASE DE EXTENSIÓN DEL ESTUDIO CBAF312A2201E1 CON ENMASCARAMIENTO DE LA DOSIS PARA EVALUAR LA SEGURIDAD, TOLERABILIDAD Y EFICACIA LARGO PLAZO DE BF312 ADMINISTRADO POR VÍA ORAL UNA VEZ AL DIA A PACIENTES CON ESCLEROSIS MÚLTIPLE RECURRENTE.
Investigador Principal: BONAVENTURA CASANOVA ESTRUCH
CBAF312A2201E1 . 2010
ESTUDIO EN FASE II DE BÚSQUEDA DE DOSIS, MULTICÉNTRICO, ALEATORIO, DE GRUPOS PARALELOS, PARCIALMENTE ENMASCARADO, CON PLACEBO Y AVONEX® COMO FÁRMACOS CONTROL, PARA EVALUAR LA EFICACIA, DETERMINADA POR LAS LESIONES CEREBRALES QUE APARECEN EN LA RMN Y LA SEGURIDAD DE DOS PAUTAS TERAPÉUTICAS DE OCRELIZUMAB EN PACIENTES CON EMRR.
Investigador Principal: BONAVENTURA CASANOVA ESTRUCH
WA21493 . 2008
FATIGA EN ESCLEROSIS MÚLTIPLE: MEJORÍA CON ACETATO DE GLATIRAMERO EN PACIENTES PREVIAMENTE TRATADOS CON IFN-BETA.
Investigador Principal: FRANCISCO CARLOS PÉREZ MIRALLES
TEV-ACE-2013-01 . 2014
ENSAYO CLINICO, ABIERTO, NO ALEATORIZADO, DE GRUPOS PARALELOS, MULTICÉNTRICO PARA EVALUAR LA EFICACIA DE FINGOLIMOD COMO TERAPIA EN PACIENTES DE NOVO VS. FINGOLIMOD COMO TERAPIA EN PACIENTES PREVIAMENTE TRATADOS CON INTERFERONES O ACETATO DE GLATIRAMERO, EN BASE A LA PRESENCIA DE BROTES, EN PACIENTES CON ESCLEROSIS MÚLTIPLE REMITENTE-RECURRENTE.
Investigador Principal: BONAVENTURA CASANOVA ESTRUCH
CFTY720DES03 . 2012
BETAEVAL - EL NUEVO AUTOINYECTOR BETACONNECT™: ADHERENCIA AL TRATAMIENTO Y EVALUACIÓN DE PACIENTES CON ESCLEROSIS MÚLTIPLE (EM) TRATADOS CON BETAFERON®.
Investigador Principal: BONAVENTURA CASANOVA ESTRUCH
BAY-INT-2014-01 . 2015
REGISTRO DE SEGURIDAD PROSPECTIVO Y OBSERVACIONAL A LARGO PLAZO DE PACIENTES CON ESCLEROSIS MÚLTIPLE QUE HAN PARTICIPADO EN ENSAYOS CLÍNICOS CON CLADRIBINA
Investigador Principal: BONAVENTURA CASANOVA ESTRUCH
EMR700568-012 . 2013
ESTUDIO ALEATORIZADO, DOBLE CIEGO, EN GRUPOS PARALELOS, CONTROLADO CON PLACEBO PARA EVALUAR LA EFICACIA, SEGURIDAD, TOLERABILIDAD Y FARMACOCINÉTICA DE BIIB033 EN SUJETOS CON EL PRIMER EPISODIO DE NEURITIS ÓPTICA AGUDA.
Investigador Principal: BONAVENTURA CASANOVA ESTRUCH
215ON201
ESTUDIO DE EXTENSIÓN ABIERTO CON UN ÚNICO BRAZO DE TRATAMIENTO DEL ESTUDIO MULTICÉNTRICO, ALEATORIZADO, DOBLE CIEGO, CONTROLADO CON PLACEBO, CON GRUPOS PARALELOS PARA COMPARAR LA EFICACIA Y SEGURIDAD DE 0,5 MG FTY720 ADMINISTRADO POR VÍA ORAL UNA VEZ AL D ÍA VERSUS PLACEBO EN PACIENTES CON ESCLEROSIS MÚLTIPLE PRIMARIA PROGRESIVA.
Investigador Principal: BONAVENTURA CASANOVA ESTRUCH
CFTY720D2306E1
ESTUDIO MULTICÉNTRICO DE TRES AÑOS DE DURACIÓN PARA EVALUAR LA TOMOGRAFÍA DE COHERENCIA ÓPTICA COMO MEDIDA DE VALORACIÓN EN PACIENTES CON ESCLEROSIS MÚLTIPLE.
Investigador Principal: BONAVENTURA CASANOVA ESTRUCH
CFTY720D2319 . 2012
REGISTRO ESPAÑOL DE PACIENTES TRATADOS CON GILENYA (FINGOLIMOD).
Investigador Principal: BONAVENTURA CASANOVA ESTRUCH
ACA-FIN-2011-01 . 2012
ESTUDIO FASE 2/3, MULTICÉNTRICO, ALEATORIZADO, DOBLE CIEGO, CONTROLADO CON PLACEBO (PARTE A) Y DOBLE CIEGO, CON DOBLE SIMULACIÓN Y CON CONTROL ACTIVO (PARTE B), DE GRUPOS PARALELOS PARA EVALUAR LA EFICACIA Y LA SEGURIDAD DE RPC1063 ADMINISTRADO POR VÍA OR AL A PACIENTES CON ESCLEROSIS MÚLTIPLE RECIDIVANTE.
Investigador Principal: BONAVENTURA CASANOVA ESTRUCH
RPC01-201
ESTUDIO PROSPECTIVO, DE UN SOLO BRAZO Y EN ENTORNO CLÍNICO PARA DESCRIBIR LA EFICACIA, TOLERABILIDAD Y COMODIDAD DEL TRATAMIENTO CON TERIFLUNOMIDA UTILIZANDO RESULTADOS NOTIFICADOS POR EL PACIENTE (PATIENT REPORTED OUTCOMES, PRO) EN PACIENTES CON ESCLEROS IS MÚLTIPLE RECIDIVANTE (EMR).
Investigador Principal: BONAVENTURA CASANOVA ESTRUCH
LPS13567
ESTUDIO DE UN SOLO GRUPO PARA EVALUAR LAS GUÍAS DETALLADAS DE INFUSIÓN PARA EL MANEJO DE LAS REACCIONES ASOCIADAS A LA INFUSIÓN (RAI) EN PACIENTES CON ESCLEROSIS MÚLTIPLE REMITENTE-RECURRENTE (EMRR) TRATADOS CON LEMTRADA.
Investigador Principal: BONAVENTURA CASANOVA ESTRUCH
LPS13650
VITAMINA D COMO TRATAMIENTO ADYUVANTE PARA LA ESCLEROSIS MÚLTIPLE RECURRENTE REMITENTE: ESTUDIO UNICÉNTRICO, ALEATORIZADO, DOBLE CIEGO, CONTROLADO POR PLACEBO.
Investigador Principal: BONAVENTURA CASANOVA ESTRUCH
VITADEM
ESTUDIO ABIERTO, MULTICÉNTRICO, ALEATORIZADO PARA EVALUAR EL IMPACTO DE NATALIZUMAB FRENTE A FINGOLIMOD EN LESIONES DEL TEJIDO DEL SISTEMA NERVIOSO CENTRAL Y EN LA RECUPERACIÓN DE SUJETOS CON ESCLEROSIS MÚLTIPLE RECIDIVANTE-REMITENTE ACTIVA.
Investigador Principal: BONAVENTURA CASANOVA ESTRUCH
101MS408
SEGUIMIENTO A LARGO PLAZO DE PACIENTES RECLUTADOS HACE 10 AÑOS EN EL PROGRAMA DE FASE II DE FINGOLIMOD EN ESCLEROSIS MÚLTIPLE QUE CURSA CON BROTES.
Investigador Principal: BONAVENTURA CASANOVA ESTRUCH
NOV-FIN-2014-01 . 2014
ESTUDIO OBSERVACIONAL RETROSPECTIVO PARA DESCRIBIR LAS CARACTERÍSTICAS DE LOS PACIENTES CON ESCLEROSIS MÚLTIPLE RECURRENTE REMITENTE (EMRR) EN TRATAMIENTO DE LARGA DURACIÓN CON INTERFERÓN (IFN) BETA 1-A SC.
Investigador Principal: BONAVENTURA CASANOVA ESTRUCH
MER-INT-2014-01
ESTUDIO DE FASE 3, MULTICÉNTRICO, ALEATORIZADO, EN DOBLE CIEGO Y CONTROLADO CON PLACEBO, DE LA EFICACIA Y SEGURIDAD DE SA237, AÑADIDO AL TRATAMIENTO BASAL, EN PACIENTES CON NEUROMIELITIS ÓPTICA (NMO) O EL ESPECTRO DE TRASTORNOS DE LA NEUROMIELITIS ÓPTICA (ETNMO).
Investigador Principal: BONAVENTURA CASANOVA ESTRUCH
SA-307JG
ESTUDIO MULTICÉNTRICO, CON TRATAMIENTO CIEGO Y DE FASE IIIB PARA EVALUAR SI EL AJUSTE DE LA DOSIS AL ALZA DE TECFIDERA® DURANTE 6 SEMANAS ES EFICAZ PARA REDUCIR LA INCIDENCIA DE ACONTECIMIENTOS ADVERSOS GASTROINTESTINALES EN PACIENTES CON ESCLEROSIS MÚLTI PLE.
Investigador Principal: BONAVENTURA CASANOVA ESTRUCH
109MS416
ESTUDIO OBSERVACIONAL Y PROSPECTIVO PARA EVALUAR, EN PACIENTES CON ESCLEROSIS MÚLTIPLE, LA CAPACIDAD DE BANDAS OLIGOCLONALES DE IGM LÍPIDO-ESPECÍFICAS (IGM LS-OCB) EN LÍQUIDO CEFALORRAQUÍDEO DE PREDECIR LA RESPUESTA A DMT Y PRONOSTICAR LA ACTIVIDAD DE LA ENFERMEDAD.
Investigador Principal: BONAVENTURA CASANOVA ESTRUCH
BIO-IGM-2014-01 . 2015
Cita
Mathur D,Urena JR,Lopez G,Casanova B,Coret F,Burgal M. Bypassing hazard of housekeeping genes: their evaluation in rat granule neurons treated with cerebrospinal fluid of multiple sclerosis subjects. Front Cell Neurosci. 2015. 9. p. 375-375. IF:4,609. (1).