Establishing a framework for best practices for quality assurance and quality control in untargeted metabolomics.

Autors de IIS La Fe
Autors aliens a IIS La Fe
- Mosley JD
- Schock TB
- Beecher CW
- Dunn WB
- Lewis MR
- Theodoridis G
- Ulmer Holland CZ
- Vuckovic D
- Wilson ID
- Zanetti KA
Grups d'Investigació
Abstract
BACKGROUND: Quality assurance (QA) and quality control (QC) practices are key tenets that facilitate study and data quality across all applications of untargeted metabolomics. These important practices will strengthen this field and accelerate its success. The Best Practices Working Group (WG) within the Metabolomics Quality Assurance and Quality Control Consortium (mQACC) focuses on community use of QA/QC practices and protocols and aims to identify, catalogue, harmonize, and disseminate current best practices in untargeted metabolomics through community-driven activities. AIM OF REVIEW: A present goal of the Best Practices WG is to develop a working strategy, or roadmap, that guides the actions of practitioners and progress in the field. The framework in which mQACC operates promotes the harmonization and dissemination of current best QA/QC practice guidance and encourages widespread adoption of these essential QA/QC activities for liquid chromatography-mass spectrometry. KEY SCIENTIFIC CONCEPTS OF REVIEW: Community engagement andQA/QC information gathering activities have been occurring through conference workshops, virtual and in-person interactive forum discussions, and community surveys. Seven principal QC stages prioritized by internal discussions of the Best Practices WG have received participant input, feedback and discussion. We outline these stages, each involving a multitude of activities, as the framework for identifying QA/QC best practices. The ultimate planned product of these endeavors is a "living guidance" document of current QA/QC best practices for untargeted metabolomics that will grow and change with the evolution of the field.
© 2024. This is a U.S. Government work and not under copyright protection in the US; foreign copyright protection may apply.
Dades de la publicació
- ISSN/ISSNe:
- 1573-3882, 1573-3890
- Tipus:
- Article
- Pàgines:
- 20-20
- PubMed:
- 38345679
- Factor d'Impacte:
- 0,866 SCImago ℠
- Quartil:
- Q2 SCImago ℠
METABOLOMICS SPRINGER
Documents
- No hi ha documents
Filiacions
Keywords
- Untargeted metabolomics; Reproducibility; Guidance; Quality assurance (QA); Quality control (QC); Liquid chromatography-mass spectrometry (LC-MS)
Projectes associats
UTILIDAD DEL TRATAMIENTO TOCOLITICO DE MANTENIMIENTO EN EL MANEJO DE LA AMENAZA DE PARTO PREMATURO (APP)
Investigador Principal: MÁXIMO VENTO TORRES
EC11-246 . 2012
MULTICENTER, RANDOMIZED, BLINDED CLINICAL STUDY COMPARING EARLY USE OF TOTAL BODY MODERATE HYPOTHERMIA PLUS TOPIRAMATE OR PLACEBO IN ASPHYXIATED NEWBORN INFANTS EVOLVING TO MODERATE-TO-SEVERE HYPOXIC ISCHEMIC ENCEPHALOPATHY
Investigador Principal: MÁXIMO VENTO TORRES
EC11-244 . INSTITUTO DE SALUD CARLOS III; FUNDACIÓN PARA LA INVESTIGACIÓN DEL HOSPITAL UNIVERSITARIO LA FE DE LA COMUNIDAD VALENCIANA . 2012
EFECTO DE LA MODULACION DEL FACTOR INDUCIBLE POR HIPOXIA (HIF) SOBRE LA DEGENERACION RETINIANA EN RETINOSIS PIGMENTARIA
Investigador Principal: REGINA RODRIGO NICOLÁS
PI12/00481 . INSTITUTO DE SALUD CARLOS III; FUNDACIÓN PARA LA INVESTIGACIÓN DEL HOSPITAL UNIVERSITARIO LA FE DE LA COMUNIDAD VALENCIANA . 2013
RED DE SALUD MATERNO INFANTIL Y DEL DESARROLLO
Investigador Principal: MÁXIMO VENTO TORRES
RD12/0026/0012 . INSTITUTO DE SALUD CARLOS III; FUNDACIÓN PARA LA INVESTIGACIÓN DEL HOSPITAL UNIVERSITARIO LA FE DE LA COMUNIDAD VALENCIANA . 2013
DAÑO OXIDATIVO Y METILACIÓN DEL ADN Y ACTIVIDAD DE LAS ENZIMAS REPARADORAS Y SU FRECUENCIA MUTAGÉNICA EN PREMATUROS SEGÚN LA CARGA DE OXÍGENO RECIBIDA EN LA REANIMACIÓN
Investigador Principal: MÁXIMO VENTO TORRES
PI14/00443 . INSTITUTO DE SALUD CARLOS III . 2015
ALBINO. EFFECT OF ALLOPURINOL IN ADDITION TO HYPOTHERMIA FOR HYPOXIC-ISCHEMIC BRAIN INJURY ON NEUROCOGNITIVE OUTCOME.
Investigador Principal: MÁXIMO VENTO TORRES
667224 . COMISION EUROPEA . 2016
RED DE SALUD MATERNO-INFANTIL Y DEL DESARROLLO.
Investigador Principal: MÁXIMO VENTO TORRES
RD16/0022/0001 . INSTITUTO DE SALUD CARLOS III . 2017
EFECTO DEL ALOPURINOL EN PACIENTES CON ENCEFALOPATÍA HIPÓXICO-ISQUÉMICA TRATADOS CON HIPOTERMIA – ALBINO – ENSAYO CLÍNICO MULTICÉNTRICO, ALEATORIZADO, CIEGO, CONTROLADO CON PLACEBO.
Investigador Principal: MÁXIMO VENTO TORRES
ALBINO . 2018
ENSAYO CLÍNICO FASE I PARA ESTABLECER LA SEGURIDAD DEL USO DE CÉLULAS MESENQUIMALES TRONCALES FETALES ALOGÉNICAS DE CORDÓN UMBILICAL EXPANDIDAS EN PACIENTES PREMATUROS CON DISPLASIA BRONCOPULMONAR.
Investigador Principal: MÁXIMO VENTO TORRES
PULMESCEL-1 . 2019
Short- and long-term impact assessment of inhaled nitric oxide in the treatment of severe hypoxia secondary to persistent pulmonary hypertension in the newborn period (Impacto a corto y largo plazo de la terapia con óxido nítrico inhalado para el tratamiento de hipóxia severa secundaria a la hipertensión pulmonar persistente en el periodo neonatal).
Investigador Principal: JULIA KULIGOWSKI
PI20/00964 . INSTITUTO DE SALUD CARLOS III . 2021
Contratos Miguel Servet II 2021. Julia Kuligowski.
Investigador Principal: JULIA KULIGOWSKI
CPII21/00003 . INSTITUTO DE SALUD CARLOS III . 2022
ENSAYO CLÍNICO MULTICÉNTRICO, ALEATORIZADO, DOBLE CIEGO Y CONTROLADO POR PLACEBO, COMPARANDO EL USO DE LA HIPOTERMIA CORPORAL TOTAL MODERADA PRECOZ CON TOPIRAMATO O CON PLACEBO EN RECIÉN NACIDOS ASFIXIADOS EVOLUCIONANDO A ENCEFALOPATÍA HIPÓXICO ISQUÉMICA MODERADA A SEVERA.
Investigador Principal: MÁXIMO VENTO TORRES
1645-CI-058 (HYPOTOP) . 2013
Contrato PFIS 2021. Abel Albiach
Investigador Principal: JULIA KULIGOWSKI
FI21/00193 . INSTITUTO DE SALUD CARLOS III . 2022
Contratos Río Hortega 2022. Cristina Zapata
Investigador Principal: JULIA KULIGOWSKI
CM22/00097 . INSTITUTO DE SALUD CARLOS III . 2023
Contrato Sara Borrell 2022. RIPOLL SEGUER, LAURA
Investigador Principal: JULIA KULIGOWSKI
CD22/00081 . INSTITUTO DE SALUD CARLOS III . 2023
LIPEXMILK II - UCIE 22-24
Investigador Principal: PILAR SEPÚLVEDA SANCHIS
INNVA2/2022/1_LIPEXMILKII . 2022
Vesículas Extracelulares de Leche Materna para la Prevención de la Enterocolotis Necrotizante en el Recién Nacido Prematuro.
Investigador Principal: JULIA KULIGOWSKI
CNS2022-135398 . MINISTERIO DE CIENCIA E INNOVACION . 2023
Actividad microbiana y vesículas extracelulares bacterianas implicadas en la aparición de los trastornos del espectro autista en niños prematuros: estudio de seguimiento a dos años
Investigador Principal: ANA CRISTINA GARCÍA BLANCO
CIAICO/2022/233 . CONSELLERIA DE INNOVACIÓN, UNIVERSIDADES, CIENCIA Y SOCIEDAD DIGITAL . 2023
Administración de Vesículas Extracelulares aislados de Leche Materna Donada como suplemento nutricional para la prevención del desarrollo de Enterocolitis Necrotizante en el recién nacido prematuro – estudio en fase I
Investigador Principal: JULIA KULIGOWSKI
PI23/00202 . INSTITUTO DE SALUD CARLOS III . 2024
Funcionalidad de la leche materna donada inactivada por un novedoso sistema de filtración con soportes antimicrobianos.
Investigador Principal: ISABEL TEN DOMÉNECH
CIGE/2023/173 . CONSELLERIA DE INNOVACIÓN, UNIVERSIDADES, CIENCIA Y SOCIEDAD DIGITAL . 2024