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Triplex Hybridization-Based Nanosystem for the Rapid Screening of Pneumocystis Pneumonia in Clinical Samples.
Fecha de publicación:
Fecha Ahead of Print:
Autores de IIS La Fe
Participantes ajenos a IIS La Fe
- Avino, Anna
- Eritja, Ramon
- Friaza, Vicente
- Calderon, Enrique J
- Santiago-Felipe, Sara
Grupos
Abstract
Pneumocystis pneumonia (PcP) is a disease produced by the opportunistic infection of the fungus Pneumocystis jirovecii. As delayed or unsuitable treatments increase the risk of mortality, the development of rapid and accurate diagnostic tools for PcP are of great importance. Unfortunately, current standard methods present severe limitations and are far from adequate. In this work, a time-competitive, sensitive and selective biosensor based on DNA-gated nanomaterials for the identification of P. jirovecii is presented. The biosensor consists of a nanoporous anodic alumina (NAA) scaffold which pores are filled with a dye reporter and capped with specific DNA oligonucleotides. In the presence of P. jirovecii genomic DNA, the gated biosensor is open, and the cargo is delivered to the solution where it is monitored through fluorescence spectroscopy. The use of capping oligonucleotides able to form duplex or triplex with P. jirovecii DNA is studied. The final diagnostic tool shows a limit of detection (LOD) of 1 nM of target complementary DNA and does not require previous amplification steps. The method was applied to identify DNA from P. jirovecii in unmodified bronchoalveolar lavage, nasopharyngeal aspirates, and sputum samples in 60 min. This is a promising alternative method for the routinely diagnosis of Pneumocystis pneumonia.
Datos de la publicación
- ISSN/ISSNe:
- 2309-608X, 2309-608X
- Tipo:
- Article
- Páginas:
- -
- DOI:
- 10.3390/jof6040292
- Factor de Impacto:
- 1,702 SCImago ℠
- Cuartil:
- Q1 SCImago ℠
JOURNAL OF FUNGI MDPI
Citas Recibidas en Web of Science: 5
Documentos
- No hay documentos
Filiaciones
Keywords
- nanoporous anodic alumina; Pneumocystis jirovecii; molecular gates; oligonucleotides; biosensor
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Cita
Pla L,Avino A,Eritja R,Ruiz A,Peman J,Friaza V,Calderon EJ,Aznar E,Martinez R,Santiago S. Triplex Hybridization-Based Nanosystem for the Rapid Screening of Pneumocystis Pneumonia in Clinical Samples. J Fungi (Basel). 2020. 6. (4):292. IF:5,816. (1).