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Integrative and comparative genomic analyses identify clinicallyrelevant pulmonary carcinoidgroups and unveil the supra-carcinoids.
Fecha de publicación:
Autores de IIS La Fe
Participantes ajenos a IIS La Fe
- Alcala N
- Leblay N
- Gabriel AAG
- Mangiante L
- Giffon T
- Sertier AS
- Ferrari A
- Derks J
- Ghantous A
- Delhomme TM
- Chabrier A
- Cuenin C
- Abedi-Ardekani B
- Boland A
- Olaso R
- Meyer V
- Altmuller J
- Le Calvez-Kelm F
- Durand G
- Voegele C
- Boyault S
- Moonen L
- Lemaitre N
- Lorimier P
- Toffart AC
- Soltermann A
- Clement JH
- Saenger J
- Field JK
- Brevet M
- Blanc-Fournier C
- Galateau-Salle F
- Le Stang N
- Russell PA
- Wright G
- Sozzi G
- Pastorino U
- Lacomme S
- Vignaud JM
- Hofman V
- Hofman P
- Brustugun OT
- Lund-Iversen M
- Thomas de Montpreville V
- Muscarella LA
- Graziano P
- Popper H
- Stojsic J
- Deleuze JF
- Herceg Z
- Viari A
- Nuernberg P
- Pelosi G
- Dingemans AMC
- Milione M
- Roz L
- Brcic L
- Volante M
- Papotti MG
- Caux C
- Hernandez-Vargas H
- Brambilla E
- Speel EJM
- Girard N
- Lantuejoul S
- McKay JD
- Foll M
- Fernandez-Cuesta L
Grupos
Abstract
The worldwide incidence of pulmonary carcinoids is increasing, but little is known about their molecular characteristics. Through machine learning and multi-omics factor analysis, we compare and contrast the genomic profiles of 116 pulmonary carcinoids (including 35 atypical), 75 large-cell neuroendocrine carcinomas (LCNEC), and 66 small-cell lung cancers. Here we report that the integrative analyses on 257 lung neuroendocrine neoplasms stratify atypical carcinoids into two prognostic groups with a 10-year overall survival of 88% and 27%, respectively. We identify therapeutically relevant molecular groups of pulmonary carcinoids, suggesting DLL3 and the immune system as candidate therapeutic targets; we confirm the value of OTP expression levels for the prognosis and diagnosis of these diseases, and we unveil the group of supra-carcinoids. This group comprises samples with carcinoid-like morphology yet the molecular and clinical features of the deadly LCNEC, further supporting the previously proposed molecular link between the low- and high-grade lung neuroendocrine neoplasms.
Datos de la publicación
- ISSN/ISSNe:
- 2041-1723, 2041-1723
- Tipo:
- Article
- Páginas:
- 3407-3407
- PubMed:
- 31431620
- Factor de Impacto:
- 5,569 SCImago ℠
- Cuartil:
- Q1 SCImago ℠
NATURE COMMUNICATIONS NATURE PUBLISHING GROUP
Citas Recibidas en Web of Science: 92
Documentos
- No hay documentos
Filiaciones
Keywords
- CELL LUNG-CANCER; NEUROENDOCRINE TUMORS; DENDRITIC CELLS; EXPRESSION; CLASSIFICATION; MUTATIONS; DISCOVERY; PATHWAY; HEALTH; IDENTIFICATION
Proyectos y Estudios Clínicos
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RD12/0036/0014 . INSTITUTO DE SALUD CARLOS III . 2013
IDENTIFICACION DE NUEVAS MOLECULAS CON ACTIVIDAD ANTICOAGULANTE Y/O CITOPROTECTORA EN LA VIA DE LA PROTEINA C: EXPLORANDO SU UTILIDAD CLINICA.
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PI14/00512 . INSTITUTO DE SALUD CARLOS III . 2015
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Investigador Principal: JUAN SANDOVAL DEL AMOR
CP13/00055 . INSTITUTO DE SALUD CARLOS III; FUNDACIÓN PARA LA INVESTIGACIÓN DEL HOSPITAL UNIVERSITARIO LA FE DE LA COMUNIDAD VALENCIANA . 2015
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IMPLANTACIÓN DE LA MEDICINA PERSONALIZADA EN ONCOLOGÍA PEDIÁTRICA: FARMACOGENÉTICA, EPIGENÉTICA, METABOLÓMICA Y LOS SISTEMAS DE INFORMACIÓN.
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CARACTERIZACIÓN EPIGENÓMICA DE LA ANOREXIA NERVIOSA. MODELO DE GEMELAS MONOCIGOTAS DISCORDANTES Y VALIDACIÓN EN POBLACIÓN GENERAL.
Investigador Principal: LUIS MIGUEL ROJO MORENO
PI16/01279 . INSTITUTO DE SALUD CARLOS III . 2017
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Investigador Principal: JUAN SANDOVAL DEL AMOR
PI16/00295 . INSTITUTO DE SALUD CARLOS III . 2017
MEDICINA DE PRECISIÓN EN RECAÍDAS DE CÁNCER PEDIÁTRICO NEUROBLÁSTICO MEDIANTE SECUENCIACION MASIVA DE NUEVA GENERACIÓN (NGS).
Investigador Principal: INÉS CALABRIA TORRES
GV/2017/135 . CONSELLERIA DE EDUCACION . 2017
Validation/Identification of clinically valuable epigenomic biomarkers for early diagnosis to improve the current poor outcome of non-small cell lung cancer patients.
Investigador Principal: JUAN SANDOVAL DEL AMOR
2017_0367_CRC_GECP_SANDOVAL . FUNDACIÓN PARA LA INVESTIGACIÓN DEL HOSPITAL UNIVERSITARIO LA FE DE LA COMUNIDAD VALENCIANA . 2017
Plataforma de Unidades de Investigación Clínica y Ensayos Clínicos.
Investigador Principal: MÁXIMO VENTO TORRES
PT17/0017/0035 . INSTITUTO DE SALUD CARLOS III; FUNDACIÓN PARA LA INVESTIGACIÓN BIOMÉDICA DEL HOSPITAL CLÍNICO SAN CARLOS (IDISSC) . 2018
Desarrollo de un kit epigenético para el diagnóstico no invasivo para el cáncer de pulmón.
Investigador Principal: JUAN SANDOVAL DEL AMOR
APOTIP/2019/A/004 . CONSELLERIA DE EDUCACION . 2019
VIOLIN. Virtual BIopsy frOm RectaL cancer ImagiNg.
Investigador Principal: LUIS MARTÍ BONMATÍ
C66161/A29001 . CANCER RESEARCH UK . 2019
Cita
Alcala N,Leblay N,Gabriel A,Mangiante L,HERVAS D,Giffon T,Sertier AS,Ferrari A,Derks J,Ghantous A,Delhomme TM,Chabrier A,Cuenin C,Abedi B,Boland A,Olaso R,Meyer V,Altmuller J,Le Calvez F,Durand G,Voegele C,Boyault S,Moonen L,Lemaitre N,Lorimier P,Toffart AC,Soltermann A,Clement JH,Saenger J,Field JK,Brevet M,Blanc C,Galateau F,Le N,Russell PA,Wright G,Sozzi G,Pastorino U,Lacomme S,Vignaud JM,Hofman V,Hofman P,Brustugun OT,Lund M,Thomas de Montpreville V,Muscarella LA,Graziano P,Popper H,Stojsic J,Deleuze JF,Herceg Z,Viari A,Nuernberg P,Pelosi G,Dingemans A,Milione M,Roz L,Brcic L,Volante M,Papotti MG,Caux C,SANDOVAL J,Hernandez H,Brambilla E,Speel E,Girard N,Lantuejoul S,McKay JD,Foll M,Fernandez L. Integrative and comparative genomic analyses identify clinicallyrelevant pulmonary carcinoidgroups and unveil the supra-carcinoids. Nat. Commun. 2019. 10. (1):p. 3407-3407. IF:12,121. (1).