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Integrative and comparative genomic analyses identify clinicallyrelevant pulmonary carcinoidgroups and unveil the supra-carcinoids.
Data de publicació:
Autors de IIS La Fe
Autors aliens a IIS La Fe
- Alcala N
- Leblay N
- Gabriel AAG
- Mangiante L
- Giffon T
- Sertier AS
- Ferrari A
- Derks J
- Ghantous A
- Delhomme TM
- Chabrier A
- Cuenin C
- Abedi-Ardekani B
- Boland A
- Olaso R
- Meyer V
- Altmuller J
- Le Calvez-Kelm F
- Durand G
- Voegele C
- Boyault S
- Moonen L
- Lemaitre N
- Lorimier P
- Toffart AC
- Soltermann A
- Clement JH
- Saenger J
- Field JK
- Brevet M
- Blanc-Fournier C
- Galateau-Salle F
- Le Stang N
- Russell PA
- Wright G
- Sozzi G
- Pastorino U
- Lacomme S
- Vignaud JM
- Hofman V
- Hofman P
- Brustugun OT
- Lund-Iversen M
- Thomas de Montpreville V
- Muscarella LA
- Graziano P
- Popper H
- Stojsic J
- Deleuze JF
- Herceg Z
- Viari A
- Nuernberg P
- Pelosi G
- Dingemans AMC
- Milione M
- Roz L
- Brcic L
- Volante M
- Papotti MG
- Caux C
- Hernandez-Vargas H
- Brambilla E
- Speel EJM
- Girard N
- Lantuejoul S
- McKay JD
- Foll M
- Fernandez-Cuesta L
Grups d'Investigació
Abstract
The worldwide incidence of pulmonary carcinoids is increasing, but little is known about their molecular characteristics. Through machine learning and multi-omics factor analysis, we compare and contrast the genomic profiles of 116 pulmonary carcinoids (including 35 atypical), 75 large-cell neuroendocrine carcinomas (LCNEC), and 66 small-cell lung cancers. Here we report that the integrative analyses on 257 lung neuroendocrine neoplasms stratify atypical carcinoids into two prognostic groups with a 10-year overall survival of 88% and 27%, respectively. We identify therapeutically relevant molecular groups of pulmonary carcinoids, suggesting DLL3 and the immune system as candidate therapeutic targets; we confirm the value of OTP expression levels for the prognosis and diagnosis of these diseases, and we unveil the group of supra-carcinoids. This group comprises samples with carcinoid-like morphology yet the molecular and clinical features of the deadly LCNEC, further supporting the previously proposed molecular link between the low- and high-grade lung neuroendocrine neoplasms.
Dades de la publicació
- ISSN/ISSNe:
- 2041-1723, 2041-1723
- Tipus:
- Article
- Pàgines:
- 3407-3407
- PubMed:
- 31431620
- Factor d'Impacte:
- 5,569 SCImago ℠
- Quartil:
- Q1 SCImago ℠
NATURE COMMUNICATIONS NATURE PUBLISHING GROUP
Cites Rebudes en Web of Science: 92
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Filiacions
Keywords
- CELL LUNG-CANCER; NEUROENDOCRINE TUMORS; DENDRITIC CELLS; EXPRESSION; CLASSIFICATION; MUTATIONS; DISCOVERY; PATHWAY; HEALTH; IDENTIFICATION
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