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Spatiotemporal Characteristics of the Largest HIV-1 CRF02_AG Outbreak in Spain: Evidence for Onward Transmissions
Fecha de publicación:
Autores de IIS La Fe
Participantes ajenos a IIS La Fe
- Kostaki, EG
- Flampouris, A
- Karamitros, T
- Chueca, N
- Alvarez, M
- Casas, P
- Alejos, B
- Hatzakis, A
- Garcia, F
- Paraskevis, D
- Moreno, S
- Jarrin, I
- Dalmau, D
- Navarro, ML
- Gonzalez, MI
- Blanco, JL
- Rubio, R
- Iribarren, JA
- Gutierrez, F
- Vidal, F
- Berenguer, J
- Gonzalez, J
- Hernando, V
- Moreno, C
- Iniesta, C
- Sousa, LMG
- Perez, NS
- Munoz-Fernandez, MA
- Garcia-Merino, IM
- Fernandez, IC
- Rico, CG
- de la Fuente, JG
- Concejo, PP
- Portilla, J
- Merino, E
- Reus, S
- Boix, V
- Giner, L
- Gadea, C
- Portilla, I
- Pampliega, M
- Diez, M
- Rodriguez, JC
- Sanchez-Paya, J
- Gomez, JL
- Hernandez, J
- Aleman, MR
- Alonso, MD
- Hernandez, MI
- Diaz-Flores, F
- Garcia, D
- Pelazas, R
- Lirola, AL
- Moreno, JS
- Caso, AA
- Gutierrez, CH
- Mena, MN
- Pulido, F
- Bisbal, O
- Hernando, A
- Dominguez, L
- Crestelo, DR
- Bermejo, L
- Santacreu, M
- Iribarren, JA
- Arrizabalaga, J
- Aramburu, MJ
- Camino, X
- Rodriguez-Arrondo, F
- von Wichmann, MA
- Tome, LP
- Goenaga, MA
- Bustinduy, MJ
- Azkune, H
- Ibarguren, M
- Lizardi, A
- Kortajarena, X
- Masia, M
- Padilla, S
- Navarro, A
- Montolio, F
- Robledano, C
- Colome, JG
- Adsuar, A
- Pascual, R
- Fernandez, M
- Garcia, E
- Garcia, JA
- Barber, X
- de Quiros, JCLB
- Gutierrez, I
- Ramirez, M
- Padilla, B
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- Tejerina, F
- Parras, FJ
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- Diez, C
- Latorre, LP
- Peraire, J
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- Veloso, S
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- Lopez-Dupla, M
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- Navarro, JF
- Molina, JM
- Gonzalez-garcia, J
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- Arribas, JR
- de la Serna, JIB
- Castro, JM
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- Lopez-Hortelano, MG
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- Martin-Carbonero, ML
- Mayoral, M
- Mellado, MJ
- Mican, RE
- Montejano, R
- Montes, ML
- Moreno, V
- Perez-Valero, I
- Rodes, B
- Sainz, T
- Sendagorta, E
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- Valencia, E
- Blanco, JR
- Oteo, JA
- Ibarra, V
- Metola, L
- Sanz, M
- Perez-Martinez, L
- Jaen, A
- Sanmarti, M
- Cairo, M
- Martinez-Lacasa, J
- Velli, P
- Font, R
- Xercavins, M
- Alonso, N
- Rivero, M
- Reparaz, J
- de Alda, MGR
- Cano, MTD
- de Galarreta, BPR
- de los Santos, I
- Sanz, JS
- Aparicio, AS
- Cepeda, CS
- Fraile, LGF
- Gayo, EM
- Casado, JL
- Dronda, F
- Moreno, A
- Elias, MJP
- Ayerbe, CG
- Gutierrez, C
- Madrid, N
- Terron, SD
- Marti, P
- Ansa, U
- Serrano, S
- Vivancos, MJ
- Bernal, E
- Cano, A
- Garcia, AA
- Urbieta, JB
- Munoz, A
- Alcaraz, MJ
- Villalba, MD
- Garcia, F
- Hernandez, J
- Pena, A
- Munoz, L
- Vinuesa, D
- Martinez-Montes, C
- Garcia, F
- Guerrero-Beltran, C
- Del Romero, J
- Rodriguez, C
- Puerta, T
- Carrio, JC
- Vera, M
- Ballesteros, J
- Ayerdi, O
- Antela, A
- Losada, E
- Aguilera, A
- Riera, M
- Penaranda, M
- Leyes, M
- Ribas, MA
- Campins, AA
- Vidal, C
- Fanjul, F
- Murillas, J
- Homar, F
- Santos, J
- Ayerbe, CG
- Viciana, I
- Palacios, R
- Gonzalez, CM
- Viciana, P
- Espinosa, N
- Lopez-Cortes, LF
- Podzamczer, D
- Ferrer, E
- Imaz, A
- Tiraboschi, J
- Silva, A
- Saumoy, M
- Olalla, J
- del Arco, A
- de la Torre, J
- Prada, JL
- Guerrero, JMGD
- Stachowski, JP
- Amador, C
- Martinez, OJ
- Vera, FJ
- Martinez, L
- Garcia, J
- Alcaraz, B
- Jimeno, A
- Iglesias, AC
- Souto, BP
- de Cea, AM
- Galera, C
- Albendin, H
- Perez, A
- Iborra, A
- Moreno, A
- Merlos, MA
- Vidal, A
- Suarez-Garcia, I
- Malmierca, E
- Gonzalez-Ruano, P
- Rodrigo, DM
- Mohamed-Balghata, MO
- Vidal, MAG
- Pineda, JA
- Macias, J
- Bernal, S
- Thomson, M
- Delgado, E
- Benito, S
- Montero, V
- CoRIS
Grupos
Abstract
Background and Aim: The circulating recombinant form 02_AG (CRF02_AG) is the predominant clade among the human immunodeficiency virus type-1 (HIV-1) non-Bs with a prevalence of 5.97% (95% Confidence Interval-CI: 5.41-6.57%) across Spain. Our aim was to estimate the levels of regional clustering for CRF02_AG and the spatiotemporal characteristics of the largest CRF02_AG subepidemic in Spain. Methods: We studied 396 CRF02_AG sequences obtained from HIV-1 diagnosed patients during 2000-2014 from 10 autonomous communities of Spain. Phylogenetic analysis was performed on the 391 CRF02_AG sequences along with all globally sampled CRF02_AG sequences (N = 3,302) as references. Phylodynamic and phylogeographic analysis was performed to the largest CRF02_AG monophyletic cluster by a Bayesian method in BEAST v1.8.0 and by reconstructing ancestral states using the criterion of parsimony in Mesquite v3.4, respectively. Results: The HIV-1 CRF02_AG prevalence differed across Spanish autonomous communities we sampled from (p < 0.001). Phylogenetic analysis revealed that 52.7% of the CRF02_AG sequences formed 56 monophyletic clusters, with a range of 279 sequences. The CRF02_AG regional dispersal differed across Spain (p = 0.003), as suggested by monophyletic clustering. For the largest monophyletic cluster (subepidemic) (N = 79), 49.4% of the clustered sequences originated from Madrid, while most sequences (51.9%) had been obtained from men having sex with men (MSM). Molecular clock analysis suggested that the origin (t(MRCA)) of the CRF02_AG subepidemic was in 2002 (median estimate; 95% Highest Posterior Density-HPD interval: 1999-2004). Additionally, we found significant clustering within the CRF02_AG subepidemic according to the ethnic origin. Conclusion: CRF02_AG has been introduced as a result of multiple introductions in Spain, following regional dispersal in several cases. We showed that CRF02_AG transmissions were mostly due to regional dispersal in Spain. The hot-spot for the largest CRF02_AG regional subepidemic in Spain was in Madrid associated with MSM transmission risk group. The existence of subepidemics suggest that several spillovers occurred from Madrid to other areas. CRF02_AG sequences from Hispanics were clustered in a separate subclade suggesting no linkage between the local and Hispanic subepidemics.
Datos de la publicación
- ISSN/ISSNe:
- 1664-302X, 1664-302X
- Tipo:
- Article
- Páginas:
- -
- Factor de Impacto:
- 1,690 SCImago ℠
- Cuartil:
- Q1 SCImago ℠
Frontiers in Microbiology FRONTIERS MEDIA SA
Citas Recibidas en Web of Science: 7
Documentos
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Filiaciones
Keywords
- HIV-1; CRF02_AG; Spain; regional dispersal; spatiotemporal characteristics
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Investigador Principal: MARTA MONTERO ALONSO
GESIDA 8815 . 2016
Cita
Kostaki EG,Flampouris A,Karamitros T,Chueca N,Alvarez M,Casas P,Alejos B,Hatzakis A,Garcia F,Paraskevis D,Moreno S,Jarrin I,Dalmau D,Navarro ML,Gonzalez MI,Blanco JL,Rubio R,Iribarren JA,Gutierrez F,Vidal F,Berenguer J,Gonzalez J,Hernando V,Moreno C,Iniesta C,Sousa LMG,Perez NS,Munoz MA,Garcia IM,Fernandez IC,Rico CG,de la Fuente JG,Concejo PP,Portilla J,Merino E,Reus S,Boix V,Giner L,Gadea C,Portilla I,Pampliega M,Diez M,Rodriguez JC,Sanchez J,Gomez JL,Hernandez J,Aleman MR,Alonso MD,Hernandez MI,Diaz F,Garcia D,Pelazas R,Lirola AL,Moreno JS,Caso AA,Gutierrez CH,Mena MN,Pulido F,Bisbal O,Hernando A,Dominguez L,Crestelo DR,Bermejo L,Santacreu M,Iribarren JA,Arrizabalaga J,Aramburu MJ,Camino X,Rodriguez F,von MA,Tome LP,Goenaga MA,Bustinduy MJ,Azkune H,Ibarguren M,Lizardi A,Kortajarena X,Masia M,Padilla S,Navarro A,Montolio F,Robledano C,Colome JG,Adsuar A,Pascual R,Fernandez M,Garcia E,Garcia JA,Barber X,de Quiros JCLB,Gutierrez I,Ramirez M,Padilla B,Gijon P,Aldamiz T,Tejerina F,Parras FJ,Balsalobre P,Diez C,Latorre LP,Peraire J,Vilades C,Veloso S,Vargas M,Lopez M,Olona M,Rull A,Rodriguez E,Alba V,Alonso MM,Aldeguer JL,Julia MB,Pitarch MT,Hernandez IC,Munoz EC,Tovar SC,Lleti MS,Navarro JF,Molina JM,Gonzalez J,Arnalich F,Arribas JR,de la Serna J,Castro JM,Escosa L,Herranz P,Hontanon V,Garcia S,Lopez MG,Gonzalez A,Martin ML,Mayoral M,Mellado MJ,Mican RE,Montejano R,Montes ML,Moreno V,Perez I,Rodes B,Sainz T,Sendagorta E,Alcariz NS,Valencia E,Blanco JR,Oteo JA,Ibarra V,Metola L,Sanz M,Perez L,Jaen A,Sanmarti M,Cairo M,Martinez J,Velli P,Font R,Xercavins M,Alonso N,Rivero M,Reparaz J,de Alda MGR,Cano MTD,de Galarreta BPR,de los Santos I,Sanz JS,Aparicio AS,Cepeda CS,Fraile LGF,Gayo EM,Casado JL,Dronda F,Moreno A,Elias MJP,Ayerbe CG,Gutierrez C,Madrid N,Terron SD,Marti P,Ansa U,Serrano S,Vivancos MJ,Bernal E,Cano A,Garcia AA,Urbieta JB,Munoz A,Alcaraz MJ,Villalba MD,Garcia F,Hernandez J,Pena A,Munoz L,Vinuesa D,Martinez C,Garcia F,Guerrero C,Del Romero J,Rodriguez C,Puerta T,Carrio JC,Vera M,Ballesteros J,Ayerdi O,Antela A,Losada E,Aguilera A,Riera M,Penaranda M,Leyes M,Ribas MA,Campins AA,Vidal C,Fanjul F,Murillas J,Homar F,Santos J,Ayerbe CG,Viciana I,Palacios R,Gonzalez CM,Viciana P,Espinosa N,Lopez LF,Podzamczer D,Ferrer E,Imaz A,Tiraboschi J,Silva A,Saumoy M,Olalla J,del Arco A,de la Torre J,Prada JL,Guerrero JMGD,Stachowski JP,Amador C,Martinez OJ,Vera FJ,Martinez L,Garcia J,Alcaraz B,Jimeno A,Iglesias AC,Souto BP,de Cea AM,Galera C,Albendin H,Perez A,Iborra A,Moreno A,Merlos MA,Vidal A,Suarez I,Malmierca E,Gonzalez P,Rodrigo DM,Mohamed MO,Vidal M,Pineda JA,Macias J,Bernal S,Thomson M,Delgado E,Benito S,Montero V,C. Spatiotemporal Characteristics of the Largest HIV-1 CRF02_AG Outbreak in Spain: Evidence for Onward Transmissions. Front Microbiol. 2019. 10. 370. IF:4,235. (2).