LipidMS 3.0: an R-package and a web-based tool for LC-MS/MS data processing and lipid annotation.

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Autors de IIS La Fe

Grups d'Investigació

Abstract

LipidMS was initially envisioned to use fragmentation rules and data-independent acquisition (DIA) for lipid annotation. However, data-dependent acquisition (DDA) remains the most widespread acquisition mode for untargeted LC-MS/MS-based lipidomics. Here we present LipidMS 3.0, an R package that not only adds DDA and new lipid classes to its pipeline, but also the required functionalities to cover the whole data analysis workflow from pre-processing (i.e., peak-peaking, alignment and grouping) to lipid annotation.

© The Author(s) 2022. Published by Oxford University Press. All rights reserved. For permissions, please e-mail: journals.permissions@oup.com.

Dades de la publicació

ISSN/ISSNe:
1367-4803, 1367-4811

Bioinformatics  OXFORD UNIV PRESS

Tipus:
Article
Pàgines:
4826-4828
PubMed:
36005855
Factor d'Impacte:
3,400 SCImago
Quartil:
Q1 SCImago

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