Portal de investigación
Metagenomic Analysis of Crohn's Disease Patients Identifies Changes in the Virome and Microbiome Related to Disease Status and Therapy, and Detects Potential Interactions and Biomarkers
Autores de IIS La Fe
Participantes ajenos a IIS La Fe
- Pérez-Brocal V
- García-López R
Grupos
Abstract
BACKGROUND: The aim of this study was to survey the bacterial and viral communities in different types of samples from patients with Crohn's disease (CD) at different stages of the disease to relate their distribution with the origin and progression of this disorder. METHODS: A total of 42 fecal samples and 15 biopsies from 20 patients with CD and 20 healthy control individuals were collected for bacterial 16S rRNA gene profiling and DNA/RNA virome metagenomic analysis through 454 pyrosequencing. Their composition, abundance, and diversity were analyzed, and comparisons of disease status, patient status, and sample origin were used to determine statistical differences between the groups. RESULTS: Bacterial composition and relative abundance in new-onset patients with CD differed markedly from control individuals. Individual variability and sample origin had a stronger impact on viral communities than the disease, contrary to what was observed for bacterial populations although increased numbers of overrepresented viruses were observed in feces from patients with CD. Correlation-based networks were constructed to show potential relations between bacteria and between those and viruses. CONCLUSIONS: The bacterial community reflects the disease status of individuals more accurately than their viral counterparts. However, numerous viral biomarkers specifically associated with CD disease were identified. Because viruses can modulate bacterial communities, the correlation networks between both communities constitute a step forward in unraveling their interactions under normal and CD disease conditions.
Datos de la publicación
- ISSN/ISSNe:
- 1078-0998, 1536-4844
- Tipo:
- Article
- Páginas:
- 2515-2532
- Factor de Impacto:
- 2,356 SCImago ℠
- Cuartil:
- Q1 SCImago ℠
INFLAMMATORY BOWEL DISEASES LIPPINCOTT WILLIAMS & WILKINS
Citas Recibidas en Web of Science: 57
Documentos
- No hay documentos
Filiaciones
Keywords
- INFLAMMATORY-BOWEL-DISEASE; HUMAN GUT VIROME; HUMAN FECES; BACTERIAL PATHOGENS; VIRAL COMMUNITY; VIRUSES; BACTERIOPHAGES; EVOLUTION; EXACERBATION; PREVALENCE
Proyectos asociados
ANALISIS DE NUEVOS GENES IMPLICADOS EN LA PATOGENESIS DE LA ENFERMEDAD CELIACA
Investigador Principal: CARMEN RIBES KONINCKX
PI02/0573 . INSTITUTO DE SALUD CARLOS III . 2004
ELABORACION DE VIAS CLINICAS CON LA PARTICIPACION DE LOS PACIENTES
Investigador Principal: VICENTE JAVIER PALAU PEREZ
GV 2005 . 2005
ESTUDIO DE LA APOPTOSIS DEL NEUTROFILO EN LA NEUMONIA ADQUIRIDA EN LA COMUNIDAD GRAVE Y CON MALA RESPUESTA AL TRATAMIENTO
Investigador Principal: ENRIQUE CASES VIEDMA
AP-018/06 . 2006
AYUDAS PARA CONTRATOS DE APOYO A LA INVESTIGACION
Investigador Principal: PILAR NOS MATEU
CA10/01027 . INSTITUTO DE SALUD CARLOS III; FUNDACIÓN PARA LA INVESTIGACIÓN DEL HOSPITAL UNIVERSITARIO LA FE DE LA COMUNIDAD VALENCIANA . 2011
IMPACTO CLINICO DE LA TELEMEDICINA EN LA ENFERMEDAD DE CROHN Y LA COLITIS ULCEROSA: ESTUDIO TECCU
Investigador Principal: MARIAM AGUAS PERIS
PI12/00277 . INSTITUTO DE SALUD CARLOS III . 2013
CON-CIENCIA-YV: PILDORAS DE SALUD
FCT-13-7457_FECYT_2013 . MINISTERIO DE ECONOMIA Y COMPETITIVIDAD; FUNDACIÓN PARA LA INVESTIGACIÓN DEL HOSPITAL UNIVERSITARIO LA FE DE LA COMUNIDAD VALENCIANA . 2013
RECEPTOR PEROXISOMA-PROLIFERADOR-ACTIVADO GAMMA (PPAR-?) EN LA REGULACION DE LA INMUNIDAD INNATA Y ADQUIRIDA DELA ENFERMEDAD DE CROHN: UNA ESTRATEGIA TERAPEUTIA DIFERENTE.
Investigador Principal: BELÉN BELTRÁN NICLÓS
PI14/01702 . INSTITUTO DE SALUD CARLOS III . 2015
REGISTRO NO INTERVENCIONISTA DE LARGA DURACIÓN PARA EVALUAR LA SEGURIDAD Y LA EFECTIVIDAD DE HUMIRA® (ADALIMUMAB) EN PACIENTES CON COLITIS ULCEROSA (CU) DE ACTIVIDAD MODERADA A GRAVE. (LEGACY).
Investigador Principal: MARIAM AGUAS PERIS
ABB-ADA-2013-01 . 2014
DESPISTAJE DE LA INFECCIÓN CRÓNICA POR EL VIRUS DE LA HEPATITIS E EN PACIENTES INMUNOSUPRIMIDOS CON ELEVACIÓN DE LOS NIVELES DE TRANSAMINASAS Y ESTUDIO DE FACTORES DE RIESGO ASOCIADOS.
Investigador Principal: MARTÍN PRIETO CASTILLO
REG-HEPE-2014-01 . 2015
ESTUDIO FASE III, MULTICÉNTRICO, ALEATORIZADO, DOBLE CIEGO, DE GRUPOS PARALELOS Y CONTROLADO CON PLACEBO PARA EVALUAR LA EFICACIA Y LA SEGURIDAD DE CÉLULAS MADRE ALOGÉNICAS EXPANDIDAS DERIVADAS DEL TEJIDO ADIPOSO (EASC) PARA EL TRATAMIENTO DE LA ENFERMEDA D DE CROHN FISTULIZANTE PERIANAL TRAS UN PERIODO DE 24 SEMANAS Y UN PERIODO DE SEGUIMIENTO EXTENDIDO HASTA LAS 104 SEMANAS. ESTUDIO ADMIRE-CD.
Investigador Principal: BELÉN BELTRÁN NICLÓS
CX601-0302 . 2012
ESTUDIO OBSERVACIONAL RETROSPECTIVO PARA DESCRIBIR LOS PATRONES DE TRATAMIENTO Y LA UTILIZACIÓN DE RECURSOS SANITARIOS ASOCIADOS A LA TERAPIA CON LOS INHIBIDORES DEL FACTOR DE NECROSIS TUMORAL (TNF) EN PACIENTES CON DIAGNÓSTICO DE ENFERMEDAD DE CROHN (EC) O COLITIS ULCEROSA (CU).
Investigador Principal: MARIAM AGUAS PERIS
TAK-TNF-2014-01 . 2015
ENSAYO CLÍNICO MULTICÉNTRICO, ALEATORIZADO, CON SIMPLE CIEGO Y DE GRUPOS PARALELOS PARA COMPARAR LA EFICACIA DE ADALIMUMAB CON LA DE AZATIOPRINA EN LA PREVENCIÓN DE LA RECURRENCIA POSTQUIRÚRGICA EN LA ENFERMEDAD DE CROHN DESPUÉS DE 52 SEMANAS DE TRATAMIEN TO.
Investigador Principal: PILAR NOS MATEU
APPRECIA
PREDICCIÓN DE RESPUESTA A CORTO Y LARGO PLAZO AL TRATAMIENTO CON FÁRMACOS ANTI-TNF EN PACIENTES CON ENFERMEDAD DE CROHN. ESTUDIO PREDICROHN.
Investigador Principal: MARISA IBORRA COLOMINO
GET-CRO-2010-01
CRÓNICA-UC: EVALUACIÓN DE LA CAPACIDAD DIAGNÓSTICA DEL CUESTIONARIO DE WALMSLEY UTILIZADO EN UNA APLICACIÓN ONLINE (CUMPLIMENTADO POR EL PROPIO PACIENTE "VÍA WEB") EN COMPARACIÓN CON EL MISMO CUESTIONARIO APLICADO POR EL MÉDICO EN SU CONSULTA EN PACIENTES CON COLITIS ULCEROSA.
Investigador Principal: PILAR NOS MATEU
MSD-COL-2012-01
ESTUDIO ABIERTO MULTICÉNTRICO PARA EVALUAR EL IMPACTO DE ADALIMUMAB EN LA CALIDAD DE VIDA, LA UTILIZACIÓN DE LA ASISTENCIA SANITARIA Y COSTE DE LOS PACIENTES CON COLITIS ULCEROSA EN CONDICIONES SIMILARES A LA PRÁCTICA CLÍNICA HABITUAL.
Investigador Principal: PILAR NOS MATEU
M13-045
VALORACIÓN DE LA TOLERABILIDAD DE UN COMPLEMENTO ALIMENTICIO DE HIERRO LIPOSOMADO ORAL (FISIOGEN FERRO FORTE®) EN EL DÉFICIT DE HIERRO EN PACIENTES CON ENFERMEDAD INFLAMATORIA INTESTINAL.
Investigador Principal: GUILLERMO BASTIDA PAZ
FIFERM02
IMPACTO CLÍNICO DE LA TELEMEDICINA EN LA ENFERMEDAD DE CROHN Y LA COLITIS ULCEROSA.
Investigador Principal: MARIAM AGUAS PERIS
TECCU
ESTUDIO RETROSPECTIVO SOBRE PRÁCTICA CLÍNICA EN PACIENTES CON ENFERMEDAD DE CROHN Y CIRUGÍA ILEOCÓLICA EN ESPAÑA.
Investigador Principal: MARISA IBORRA COLOMINO
MSD-CRO-2013-01
OPTIMIZACIÓN DEL TRATAMIENTO CON ADALIMUMAB EN PACIENTES CON ENFERMEDAD INFLAMATORIA INTESTINAL.
Investigador Principal: JOSÉ LUIS POVEDA ANDRÉS
FAR-ADA-2014-01
IMPACTO DE LA REACTIVACIÓN DEL CITOMEGALOVIRUS EN LA RESPUESTA A LOS FÁRMACOS ANTI-TNF-ALFA EN PACIENTES CON COLITIS ULCEROSA CORTICORREFRACTARIA.
Investigador Principal: MARISA IBORRA COLOMINO
IIS-ANT-2014-01
REGISTRO DE PACIENTES CON COLITIS COLAGENA TRATADOS CON AZATIOPRINA Y/O MERCAPTOPURINA.
Investigador Principal: BELÉN BELTRÁN NICLÓS
HMT-AZA-2014-01
ESTUDIO ALEATORIZADO DE DOS ESTRATEGIAS DE TRATAMIENTO CON RIBAVIRINA PARA LA HEPATITIS CRÓNICA E Y FORMAS AGUDAS GRAVES.
Investigador Principal: MARTÍN PRIETO CASTILLO
RACHE . 2016
Cita
Pérez V,García R,Nos P,Beltrán B,Moret I,Moya A. Metagenomic Analysis of Crohn's Disease Patients Identifies Changes in the Virome and Microbiome Related to Disease Status and Therapy, and Detects Potential Interactions and Biomarkers. Inflamm Bowel Dis. 2015. 21. (11):p. 2515-2532. IF:4,358. (1).