Biomarcadores, Medicina Genómica, Estadística y Análisis masivo de datos en Reproducción humana asistida

Áreas de investigación

• Fertilidad y Medicina Materno - Infantil

  Coordinador/a:

  

  Nicolás Garrido Puchalt

  Fundación IVI

Líneas de investigación

1. Calidad ovocitaria y embrionaria (A07 Desarrollo de tecnologías sanitarias y nuevos dispositivos) Desarrollo y mejora de las herramientas de evaluación de la calidad ovocitaria y embrionaria para optimización de los tratamientos de reproducción asistida (TRA).
2. Medicina Reproductiva genómica y de precisión (A07 Big Data y Tecnologías Aplicadas a la Salud) Mediante análisis masivo de datos a partir de tecnologías genómicas de alto rendimiento y de datos clínicos, encontramos patrones moleculares para estratificar a los pacientes en subtipos clínicos generando nuevas taxonomías de los problemas reproductivos. Para ello, utilizamos algoritmos de inteligencia artificial, así como desarrollamos y combinamos otras metodologías estadisticas avanzadas.
3. Genómica funcional en tratamientos de reproducción asistida (A07 Big Data y Tecnologías Aplicadas a la Salud) Mediante aproximaciones de genómica funcional integramos información molecular a partir de bases de datos y datasets disponibles para generar hipótesis (Data driven discovery). Estas hipótesis las contrastamos mediante validaciones exprimentales e in silico (Wet lab/Dry lab) (Hypothesis driven research) para comprender los mecanismos que subyacen a la infertilidad y priorizar potenciales biomarcadores y dianas terapeúticas. Para ello, utilizamos aproximaciones de enriquecimiento funcional, análisis de redes y otras aproximaciones sistémicas que nos permiten entender la complejidad molecular de los procesos complejos y multifactoriales implicados en la infertilidad.
4. Farmacología en tratamientos de reproducción asistida (A07 Tratamiento y medicina personalizada) Farmacología de sistemas para la respuesta farmacogenómica en tratamientos de reproducción asistida (TRA) y patologías ginecológicas benignas.
5. Factores ambientales en tratamientos de reproducción asistida (A07 Identificación de biomarcadores específicos) Perfiles de expresión genética de las células reproductoras y endometriales. Mecanismos inmunológicos y ambientales que intervienen en los procesos reproductivos.
6. Mitocondrias en la viabilidad de los ovocitos y preembriones humanos (A07 Identificación de biomarcadores específicos) Papel de las mitocondrias en la viabilidad de los ovocitos y preembriones humanos.
7. Compactación y polarización embrionaria (A07 Diagnóstico precoz de las enfermedades) Mecanismos moleculares de compactación y polarización embrionaria.
8. Mosaicismo genético embrionario (A07 Diagnóstico precoz de las enfermedades) Biología del embrión mosaico, estudio transcriptómico de los embriones mosaico y resultados clínicos.